木麻黃青枯病抗性與EST-SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-08-02 19:40
為挖掘與木麻黃(Casuarina equisetifolia)青枯病抗性(bacterial wilt resistance,BWR)相關(guān)的分子標(biāo)記及其有效等位變異,加速抗病品種的選育進(jìn)程,以53份木麻黃種質(zhì)為自然群體材料,利用223個(gè)木麻黃EST-SSR標(biāo)記對(duì)抗、感池進(jìn)行標(biāo)記分型與篩選,選擇Structure 2.3.4軟件進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析,SPAGeDi1-5a軟件計(jì)算親緣關(guān)系系數(shù),TASSEL軟件的混合線性模型(MLM)進(jìn)行標(biāo)記與抗病性狀的關(guān)聯(lián)分析。利用抗、感基因池篩選出用于關(guān)聯(lián)分析且不偏離哈-溫平衡的標(biāo)記47個(gè);群體結(jié)構(gòu)分析將木麻黃種質(zhì)分為2個(gè)組群;關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)CASeSSR253、CASeSSR022、CASeSSR359、CASeSSR241、CASeSSR242、CASeSSR263、CASeSSR056、CASeSSR052、CASeSSR176、CASeSSR258等10個(gè)ESTSSR標(biāo)記位點(diǎn)與木麻黃青枯病抗性顯著相關(guān)(P <0.05),對(duì)青枯病抗性的解釋率在12.6%~60.1%之間;CASeSSR359-386 bp、CASeSSR359-370 bp、C...
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 DNA提取與標(biāo)記分型
1.3 數(shù)據(jù)分析
1.3.1 群體結(jié)構(gòu)及關(guān)聯(lián)分析
1.3.2 等位變異表型效應(yīng)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 木麻黃EST-SSR標(biāo)記分型與篩選
2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
2.3 關(guān)聯(lián)分析
2.4 位點(diǎn)和等位片段的表型效應(yīng)
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)在林木育種中的應(yīng)用[J]. 闕青敏,歐陽(yáng)昆唏,李培,陳曉陽(yáng). 植物生理學(xué)報(bào). 2019(11)
[2]山西谷子核心資源群體結(jié)構(gòu)及主要農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 王海崗,溫琪汾,穆志新,喬治軍. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(22)
[3]辣椒疫病抗性關(guān)聯(lián)分析及優(yōu)異等位變異挖掘[J]. 袁欣捷,方榮,周坤華,馬輝剛,何烈干,陳學(xué)軍. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(04)
[4]SSR標(biāo)記與陸地棉田間黃萎病抗性的關(guān)聯(lián)分析[J]. 張素君,唐麗媛,李興河,王海濤,劉存敬,張香云,張建宏. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(06)
[5]煙草種質(zhì)的SSR標(biāo)記遺傳多樣性及青枯病抗性的關(guān)聯(lián)分析[J]. 賴瑞強(qiáng),李榮華,夏巖石,郭培國(guó),袁清華,趙偉才. 中國(guó)煙草學(xué)報(bào). 2018(06)
[6]全基因組測(cè)序技術(shù)研究及其在木本植物中的應(yīng)用[J]. 劉海琳,尹佟明. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(05)
[7]51個(gè)木麻黃無性系遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 許秀玉,王明懷,魏龍,徐斌. 林業(yè)科學(xué)研究. 2012(06)
[8]改進(jìn)的CTAB提取植物DNA方法[J]. 李榮華,夏巖石,劉順枝,孫莉麗,郭培國(guó),繆紳裕,陳健輝. 實(shí)驗(yàn)室研究與探索. 2009(09)
[9]分子生物技術(shù)在木麻黃科植物研究中的應(yīng)用[J]. 黃桂華,仲崇祿,蘇曉華,張勇,C.Franche,D.Bogusz. 廣東林業(yè)科技. 2006(03)
[10]我國(guó)木麻黃科植物遺傳改良研究進(jìn)展[J]. 黃桂華,仲崇祿,張勇. 廣東林業(yè)科技. 2005(04)
博士論文
[1]木麻黃青枯病的抗性鑒定及EST-SSR關(guān)聯(lián)分析[D]. 許秀玉.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2017
本文編號(hào):3669125
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 DNA提取與標(biāo)記分型
1.3 數(shù)據(jù)分析
1.3.1 群體結(jié)構(gòu)及關(guān)聯(lián)分析
1.3.2 等位變異表型效應(yīng)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 木麻黃EST-SSR標(biāo)記分型與篩選
2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
2.3 關(guān)聯(lián)分析
2.4 位點(diǎn)和等位片段的表型效應(yīng)
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)在林木育種中的應(yīng)用[J]. 闕青敏,歐陽(yáng)昆唏,李培,陳曉陽(yáng). 植物生理學(xué)報(bào). 2019(11)
[2]山西谷子核心資源群體結(jié)構(gòu)及主要農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 王海崗,溫琪汾,穆志新,喬治軍. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(22)
[3]辣椒疫病抗性關(guān)聯(lián)分析及優(yōu)異等位變異挖掘[J]. 袁欣捷,方榮,周坤華,馬輝剛,何烈干,陳學(xué)軍. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(04)
[4]SSR標(biāo)記與陸地棉田間黃萎病抗性的關(guān)聯(lián)分析[J]. 張素君,唐麗媛,李興河,王海濤,劉存敬,張香云,張建宏. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(06)
[5]煙草種質(zhì)的SSR標(biāo)記遺傳多樣性及青枯病抗性的關(guān)聯(lián)分析[J]. 賴瑞強(qiáng),李榮華,夏巖石,郭培國(guó),袁清華,趙偉才. 中國(guó)煙草學(xué)報(bào). 2018(06)
[6]全基因組測(cè)序技術(shù)研究及其在木本植物中的應(yīng)用[J]. 劉海琳,尹佟明. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(05)
[7]51個(gè)木麻黃無性系遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 許秀玉,王明懷,魏龍,徐斌. 林業(yè)科學(xué)研究. 2012(06)
[8]改進(jìn)的CTAB提取植物DNA方法[J]. 李榮華,夏巖石,劉順枝,孫莉麗,郭培國(guó),繆紳裕,陳健輝. 實(shí)驗(yàn)室研究與探索. 2009(09)
[9]分子生物技術(shù)在木麻黃科植物研究中的應(yīng)用[J]. 黃桂華,仲崇祿,蘇曉華,張勇,C.Franche,D.Bogusz. 廣東林業(yè)科技. 2006(03)
[10]我國(guó)木麻黃科植物遺傳改良研究進(jìn)展[J]. 黃桂華,仲崇祿,張勇. 廣東林業(yè)科技. 2005(04)
博士論文
[1]木麻黃青枯病的抗性鑒定及EST-SSR關(guān)聯(lián)分析[D]. 許秀玉.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2017
本文編號(hào):3669125
本文鏈接:http://sikaile.net/wenshubaike/mfmb/3669125.html
最近更新
教材專著