通過基因組重測序技術(shù),比較馬尾松（Pinus massoniana）與火炬松（P. taeda）的基因組,分析探討以火炬松基因組為馬尾松分子研究分析參考基因組的可行性。通過測序共得到231.27 Gbp的Clean Data,Q30達(dá)到87.61%,測序深度為8倍。拼接得到的馬尾松reads數(shù)目有771 625 883個,GC含量38.14%。將馬尾松重測序結(jié)果與火炬松Ptaeda 2.0基因組比較,發(fā)現(xiàn)有96.98%的reads可定位在參考基因組上,60.98%的reads雙端測序序列均可定位到參考基因組上且距離符合測序片段的長度分布。馬尾松reads對火炬松參考基因組的覆蓋度為62.59%。馬尾松基因組與火炬松基因組匹配率高,可以用火炬松基因組為馬尾松分子研究提供參考。 

【文章來源】：廣西林業(yè)科學(xué). 2020,49(04)

【文章頁數(shù)】：3 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 全基因組DNA提取
        1.2.2 基因組重測序
        1.2.3 與參考基因組比對統(tǒng)計(jì)
2 結(jié)果與分析
    2.1 馬尾松的基因組重測序結(jié)果
    2.2 與參考基因組比較分析
    2.3 覆蓋深度分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于重測序番茄InDel標(biāo)記的開發(fā)[J]. 張國儒,唐亞萍,楊濤,帕提古麗,王柏柯,李寧,王娟,李曉琴,余慶輝,楊生保.  分子植物育種. 2019(14)
[2]韓國赤芝全基因組重測序分析[J]. 朱風(fēng)麗,徐曉蘭,陳體強(qiáng),石林春,繆曉青,蘭進(jìn).  世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2019(04)
[3]馬尾松葉綠體基因組測序及特征分析[J]. 羅群鳳,馮源恒,賈婕,陳虎,楊章旗.  廣西林業(yè)科學(xué). 2018(04)
[4]玉米SLAF標(biāo)記的開發(fā)及其在玉米果皮纖維素含量BSA分析中的應(yīng)用[J]. 杜龍崗,王美興.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(08)
[5]動物基因組學(xué)重測序的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 汪文強(qiáng),趙生國,馬利青,郭繼軍,馬月輝,趙倩君.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(10)
[6]馬尾松4CL基因同源序列克隆與進(jìn)化分析[J]. 劉希華,張麗,邢建宏,梁一池.  貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[7]130份甘藍(lán)型油菜種質(zhì)分子身份證的構(gòu)建[J]. 馬琳,劉海珍,陸徐忠,倪金龍,張小娟,楊劍波.  中國油料作物學(xué)報(bào). 2013(03)
[8]馬尾松轉(zhuǎn)錄組測序和分析[J]. 王曉鋒,何衛(wèi)龍,蔡衛(wèi)佳,阮倩倩,潘婷,季孔庶.  分子植物育種. 2013(03)
[9]馬尾松紙漿材育種研究進(jìn)展及策略[J]. 楊章旗,舒文波.  廣西林業(yè)科學(xué). 2012(01)
[10]松屬近緣種形態(tài)和分子鑒定及其親緣關(guān)系探討[J]. 洑香香,趙虎,王玉.  林業(yè)科學(xué). 2011(10)



本文編號：3502628