為深入了解沙棘（Hippophae rhamnoides）根瘤細(xì)菌的多樣性及其隨時間變化,采用高通量測序技術(shù)對中國沙棘（H.rhamnoides subsp.sinensis）4個不同月份根瘤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行了分析對比。結(jié)果表明,在根瘤瘤瓣剛剛開始萌發(fā)的3月,沙棘根瘤細(xì)菌的多樣性和豐富度顯著高于5、7月和8月。4個采樣時間所獲得的根瘤細(xì)菌可歸類為21門36綱75目145科234屬,其中有8菌門的17菌綱在不同采樣時間一直存在。從相對豐度來看,放線菌門放線菌綱（Actinobacteria）始終為優(yōu)勢菌綱,其相對豐度3月為65.30%,5、7月和8月均超過96.05%;同時,根瘤細(xì)菌中還存在變形菌門的α-、β-和γ-變形菌綱（Alpha-,Beta-,Gammaproteobacteria）以及擬桿菌門噬纖維菌綱（Cytophagia）和鞘脂桿菌綱（Sphingobacteriia）等多種類型的非放線菌。弗蘭克氏菌目（Frankiales）細(xì)菌在整體根瘤細(xì)菌群落中的相對豐度3月為48.60%,顯著低于5月的93.54%、7月的95.48%和8月的94.73%;4個采樣時間共獲得5科6... 

【文章來源】：西北林學(xué)院學(xué)報. 2020,35(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

不同時間沙棘根瘤細(xì)菌在門水平上的Venn圖和主要細(xì)菌門的相對豐度

4次采集的根瘤樣品共出現(xiàn)36個綱的細(xì)菌,其中8門17菌綱的細(xì)菌在各個采樣時間一直存在,其余的細(xì)菌綱只在某些采樣時段出現(xiàn)(圖2A)。就相對豐度而言,這17個共有菌綱中,放線菌門的放線菌綱(Actinobacteria)始終為優(yōu)勢菌綱,其次為變形菌門的α-、β-和γ-變形菌綱(Alpha-,Beta-,Gammaproteobacteria)、以及擬桿菌門的噬纖維菌綱(Cytophagia)和鞘脂桿菌綱(Sphingobacteriia)(圖2B)。在7月的根瘤樣品中,共出現(xiàn)26個菌綱的細(xì)菌,但放線菌綱依然占據(jù)絕對主導(dǎo)地位,相對豐度為97.05%,而α-、β-和γ-變形菌綱的相對豐度僅僅分別為1.60%、0.63%和0.32%,噬纖維菌綱和鞘脂桿菌綱則分別只有0.05%和0.07%,其余菌綱的相對豐度均<0.05%(圖2B)。

在4個采樣時間,弗蘭克氏菌目始終是沙棘根瘤細(xì)菌的優(yōu)勢菌目,共獲得該目下的5科6屬10條OTU代表序列,但每個采樣時間都以歸屬于弗蘭克氏菌科弗蘭克氏菌屬的OTU235為主,在該目中的相對豐度始終保持在99%左右;其他OTUs的相對豐度極低(表3)。2.2.4 不同時間沙棘根瘤細(xì)菌在OTU水平上的組成及相對豐度

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號：3485262