水曲柳FmMYB轉(zhuǎn)錄因子生物信息學(xué)及表達(dá)模式分析
發(fā)布時間:2021-10-17 14:14
MYB蛋白廣泛存在于植物中,參與植物生長發(fā)育等多種代謝途徑。前期研究獲得2個FmMYB轉(zhuǎn)錄因子cDNA全長序列(FmMYB2和FmMYB20),已上傳至NCBI并獲得登錄號(KT261341和KT261342)。為揭示FmMYB轉(zhuǎn)錄因子功能,對這兩個MYB轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)特征、生化特性進(jìn)行分析,利用實時熒光定量PCR,對FmMYB2和FmMYB20的時空表達(dá)模式以及施加應(yīng)力后的轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行分析。結(jié)果表明:FmMYB轉(zhuǎn)錄因子的時空表達(dá)模式有所差異,FmMYB2基因在7月相對表達(dá)量最高,約為最低值5月的60倍;然而在8月,FmMYB20基因的相對表達(dá)量最高,約為最低值5月的5倍;同時在葉、木質(zhì)部、皮3個部位中,FmMYB2和FmMYB20基因在木質(zhì)部中表達(dá)量最高。FmMYB2與FmMYB20基因均對應(yīng)拉處理有響應(yīng),FmMYB20與木質(zhì)素合成相關(guān)基因4CL表達(dá)模式相似。研究結(jié)果初步說明FmMYB2和FmMYB20可能參與木質(zhì)素的合成。
【文章來源】:黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,(07)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
FmMYB2和FmMYB20轉(zhuǎn)錄因子與其他物種的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
以5月作為對照,比較不同月份水曲柳葉子的基因相對表達(dá)量。結(jié)果表明(圖5),FmMYB2基因在5月表達(dá)量逐漸升高,7月達(dá)到最大值,其相對表達(dá)量為5月的60倍,隨后8-9月表達(dá)量逐漸降低,但仍高于5月;FmMYB20在5-7月表達(dá)量基本一致,8月葉片中的相對表達(dá)量最高,為5月的5倍,9月稍有降低,為5月的3倍。對FmMYB2和FmMYB20轉(zhuǎn)錄因子在葉片、木質(zhì)部和皮3個部位的表達(dá)模式進(jìn)行分析,結(jié)果表明:FmMYB2和FmMYB20基因表達(dá)量最低的部位均是葉片,表達(dá)量最高的部位是木質(zhì)部。其中FmMYB2在木質(zhì)部中的表達(dá)量是葉片中的24倍,在皮中的表達(dá)量是葉片的5倍。FmMYB20在木質(zhì)部中的表達(dá)約為葉片中的5倍,在皮中的表達(dá)為葉片中的2倍(圖6)。這些結(jié)果表明,水曲柳FmMYB基因具有時空表達(dá)特異性。2.5.2 應(yīng)拉處理后FmMYB2和FmMYB20基因的表達(dá)水平分析
對水曲柳進(jìn)行應(yīng)拉處理,其中FmMYB2在第1天的OW表達(dá)量升高,約為對照的2倍,而TW表達(dá)量基本不變,第7天時二者表達(dá)量均低于對照;FmMYB20的表達(dá)量,在第1天TW較高,約為對照的2.5倍,第3天FmMYB20的表達(dá)量,無論TW還是OW均有所上升,分別為對照的7倍和4倍,第7天有所下降,但仍高于對照(圖7)?梢2個基因表達(dá)模式雖不相同,但均對應(yīng)拉處理有響應(yīng),初步說明FmMYB可能參與細(xì)胞壁木質(zhì)素的合成。圖7 水曲柳應(yīng)拉木FmMYB2和FmMYB20基因表達(dá)水平
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]光皮樺MYB基因的克隆及表達(dá)和調(diào)控分析[J]. 倪飛,勵文豪,林二培,童再康,黃華宏. 林業(yè)科學(xué). 2018(12)
[2]白樺BpNOS基因的生物信息及表達(dá)模式分析[J]. 周姍,孫豐坤,姜濤,詹亞光,曾凡鎖. 中草藥. 2015(08)
[3]歐美楊107正常木與應(yīng)拉木纖維形態(tài)和化學(xué)組成比較[J]. 周亮,劉盛全,高慧,錢良存. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(02)
本文編號:3441901
【文章來源】:黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,(07)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
FmMYB2和FmMYB20轉(zhuǎn)錄因子與其他物種的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
以5月作為對照,比較不同月份水曲柳葉子的基因相對表達(dá)量。結(jié)果表明(圖5),FmMYB2基因在5月表達(dá)量逐漸升高,7月達(dá)到最大值,其相對表達(dá)量為5月的60倍,隨后8-9月表達(dá)量逐漸降低,但仍高于5月;FmMYB20在5-7月表達(dá)量基本一致,8月葉片中的相對表達(dá)量最高,為5月的5倍,9月稍有降低,為5月的3倍。對FmMYB2和FmMYB20轉(zhuǎn)錄因子在葉片、木質(zhì)部和皮3個部位的表達(dá)模式進(jìn)行分析,結(jié)果表明:FmMYB2和FmMYB20基因表達(dá)量最低的部位均是葉片,表達(dá)量最高的部位是木質(zhì)部。其中FmMYB2在木質(zhì)部中的表達(dá)量是葉片中的24倍,在皮中的表達(dá)量是葉片的5倍。FmMYB20在木質(zhì)部中的表達(dá)約為葉片中的5倍,在皮中的表達(dá)為葉片中的2倍(圖6)。這些結(jié)果表明,水曲柳FmMYB基因具有時空表達(dá)特異性。2.5.2 應(yīng)拉處理后FmMYB2和FmMYB20基因的表達(dá)水平分析
對水曲柳進(jìn)行應(yīng)拉處理,其中FmMYB2在第1天的OW表達(dá)量升高,約為對照的2倍,而TW表達(dá)量基本不變,第7天時二者表達(dá)量均低于對照;FmMYB20的表達(dá)量,在第1天TW較高,約為對照的2.5倍,第3天FmMYB20的表達(dá)量,無論TW還是OW均有所上升,分別為對照的7倍和4倍,第7天有所下降,但仍高于對照(圖7)?梢2個基因表達(dá)模式雖不相同,但均對應(yīng)拉處理有響應(yīng),初步說明FmMYB可能參與細(xì)胞壁木質(zhì)素的合成。圖7 水曲柳應(yīng)拉木FmMYB2和FmMYB20基因表達(dá)水平
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]光皮樺MYB基因的克隆及表達(dá)和調(diào)控分析[J]. 倪飛,勵文豪,林二培,童再康,黃華宏. 林業(yè)科學(xué). 2018(12)
[2]白樺BpNOS基因的生物信息及表達(dá)模式分析[J]. 周姍,孫豐坤,姜濤,詹亞光,曾凡鎖. 中草藥. 2015(08)
[3]歐美楊107正常木與應(yīng)拉木纖維形態(tài)和化學(xué)組成比較[J]. 周亮,劉盛全,高慧,錢良存. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(02)
本文編號:3441901
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