隨著重金屬鎘（Cd）應(yīng)用范圍的擴(kuò)大,土壤Cd污染問題日益嚴(yán)重。以具有植物恢復(fù)潛力的旱柳（Saliz matsudana）作為研究對象,探究不同濃度的Cd脅迫后旱柳無性系1 d、7 d和30 d后基因表達(dá)與代謝通路的變化。轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果表明:共獲得102 595個Unigenes,相同濃度不同時間的差異基因總數(shù)為26 623和32 154個;相同時間不同濃度的差異基因總數(shù)為8 550、3 444和11 428個。從中篩選得到與Cd脅迫響應(yīng)密切相關(guān)的基因25個,其中金屬硫蛋白、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、鋅和錳轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白等基因的表達(dá)不僅會隨著Cd脅迫濃度變化而且同時受到脅迫時間的改變而發(fā)生改變;油菜素內(nèi)酯合成通路的3,6-脫氧油菜素淄酮酶（ROT3）和黃酮類化合物合成通路的黃酮醇合成酶（FLS）、黃烷酮-3-羥化酶（F3H）均明顯上調(diào)。此外旱柳響應(yīng)Cd脅迫的GO條目主要集中在代謝過程、細(xì)胞過程、膜、細(xì)胞器、細(xì)胞、細(xì)胞部分、催化活化和結(jié)合蛋白上,參與這些GO條目的差異表達(dá)基因數(shù)隨著Cd濃度和脅迫時間的增加而增加。通過轉(zhuǎn)錄組測序分析旱柳Cd脅迫后的響應(yīng)機(jī)制,旨為旱柳修復(fù)土壤Cd污染提供理論指導(dǎo)。 

【文章來源】：生物技術(shù)通報. 2020,36(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA提取及樣品檢測
        1.2.2文庫構(gòu)建及轉(zhuǎn)錄組測序
        1.2.3 De nove組裝
        1.2.4 生物信息學(xué)分析
        1.2.5 差異表達(dá)基因q-PCR驗(yàn)證
2 結(jié)果
    2.1 總RNA質(zhì)檢結(jié)果
    2.2 轉(zhuǎn)錄組測序與De nove組裝
    2.3 對Unigene的功能注釋
    2.4 Unigene GO功能分類
    2.5 Unigene的KEGG注釋和代謝通路分析
    2.6 差異表達(dá)基因分析
    2.7 差異基因的q-PCR
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3429003