為研究二倍體白花泡桐在四倍體形成過程中蛋白質(zhì)的變化,利用同位素標記相對定量和絕對定量（iTRAQ）以及液相串聯(lián)質(zhì)譜技術,分析了四倍體泡桐及其二倍體親本葉片中的蛋白質(zhì)表達變化,并通過與轉(zhuǎn)錄組的關聯(lián),篩選與四倍體形成相關的蛋白質(zhì)。研究結(jié)果共鑒定到696個蛋白質(zhì),其中,有75個差異表達,對這些差異蛋白質(zhì)進行基因本體論（GO）功能分析,其主要富集在液泡、胞漿和非生物刺激響應等40個基因本論條目中。對這些差異蛋白質(zhì)進行京都基因與基因組百科全書（KEGG）分析表明,其主要參與35個代謝通路,包括光合作用、植物病原相互作用和次生代謝產(chǎn)物的生物合成等。通過蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組關聯(lián)分析,篩選到9個與倍性相關的差異蛋白質(zhì),基中4個注釋到KEGG代謝通路,分別是鎂螯合酶H亞基、V型H+轉(zhuǎn)運ATPase亞基A、果糖二磷酸醛縮酶和細胞色素C氧化酶亞基5b。 

【文章來源】：森林與環(huán)境學報. 2020,40(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

總蛋白質(zhì)的鑒定與分析

為進一步了解四倍體優(yōu)良特性相關的特異蛋白質(zhì)，對B2和B4兩樣本鑒定到的總蛋白質(zhì)進行差異分析。結(jié)果共鑒定到75個差異表達的蛋白質(zhì)，其中，39個上調(diào)，36個下調(diào)。GO富集分析結(jié)果顯示，顯著性富集的GO條目有40個:細胞組分主要條目有胞漿、液泡、核糖體[圖2(a)];生物進程主要條目有非生物刺激響應、前體代謝物和能量的產(chǎn)生、滲透脅迫響應[圖2(b)];分子功能主要條目有銅離子結(jié)合、果糖二磷酸醛縮酶活性、醛裂合酶活性[圖2(c)]。KEGG通路富集分析參與了35條代謝通路，主要包括代謝途徑(29,48.33%)、糖酵解/糖異生(7,11.67%)、次生代謝產(chǎn)物的生物合成(17,28.33%)、光合生物的碳固定(8,13.33%)和氧化磷酸化(5,8.33%)等(表3)。2.3 蛋白質(zhì)組與轉(zhuǎn)錄組關聯(lián)分析

為了驗證測序結(jié)果的可靠性,在B2和B4文庫中隨機挑選m.13192(谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶)、m.29938(L-抗壞血酸氧化酶)、m.24953(果糖二磷酸醛縮酶)、m.40032(銅氧化酶)、m.32969(玉米黃質(zhì)環(huán)氧酶)、m.39316(蛋白二硫鍵異構酶A1)、m.9824(2-磷酸乙醇酸磷酸酶1)、m.16063(羧亞甲基丁烯酸酶)等8個差異蛋白質(zhì)進行qRT-PCR驗證(圖3)。B2表達量歸一化為1,18 S rRNA作為內(nèi)參。結(jié)果顯示:4個基因在蛋白質(zhì)水平和轉(zhuǎn)錄水平均上調(diào),4個基因在蛋白質(zhì)水平上調(diào)而在轉(zhuǎn)錄水平下調(diào),這種結(jié)果可能是由于基因轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)翻譯后加工和修飾,或者mRNA和蛋白質(zhì)的降解等因素造成的。3 討論與結(jié)論

【參考文獻】：
期刊論文
[1]四倍體泡桐對干旱脅迫的生理響應研究[J]. 張曉申,劉榮寧,范國強,趙振利,鄧敏捷.  河南農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(05)
[2]不同種四倍體泡桐光合特性的研究[J]. 張曉申,翟曉巧,趙振利,鄧敏捷,范國強.  河南農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(04)
[3]植物抗壞血酸氧化酶的研究進展[J]. 郭燕,朱杰,許自成,張水成.  中國農(nóng)學通報. 2008(03)
[4]白花泡桐同源四倍體的誘導[J]. 范國強,曹艷春,趙振利,楊志清.  林業(yè)科學. 2007(04)

博士論文
[1]甘蔗應答黑穗病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組與蛋白組研究及抗性相關基因挖掘[D]. 蘇亞春.福建農(nóng)林大學 2014



本文編號：3377775