果生刺盤孢Colletotrichum fructicola是油茶炭疽病優(yōu)勢病原菌。前期研究發(fā)現(xiàn)bZIP轉(zhuǎn)錄因子CfHac1參與調(diào)控該菌的生長發(fā)育和致病性。為了揭示轉(zhuǎn)錄因子CfHac1調(diào)控果生刺盤孢響應(yīng)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力和致病機理,本研究測定了ΔCfhac1突變體對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力脅迫劑的敏感性,發(fā)現(xiàn)突變體對二硫蘇糖醇（dithiothreitol,DTT）的耐受性下降,說明CfHAC1基因可能參與調(diào)控果生刺盤孢響應(yīng)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力脅迫過程。進一步利用高通量RNA-seq技術(shù)對該病菌野生型菌株和CfHAC1敲除突變體菌株在DTT脅迫下的轉(zhuǎn)錄組進行了比較分析,結(jié)果表明差異表達基因共有2 680個,其中上調(diào)表達基因有1 181個,下調(diào)表達基因有1 499個。Gene Ontology功能分析結(jié)果顯示,差異表達基因主要參與催化活性、結(jié)合、代謝過程、細胞過程、細胞成分合成、生物過程調(diào)控和應(yīng)激反應(yīng)等生物學(xué)過程。KEGG功能富集分析表明,上調(diào)表達基因主要被富集到核糖體、真核細胞的核糖體生物合成、RNA轉(zhuǎn)運和氰基氨基酸代謝通路中;下調(diào)表達基因顯著富集在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)加工、N-聚糖生物合成、類固醇合成和蛋白質(zhì)分泌等通路中。... 

【文章來源】：菌物學(xué)報. 2020,39(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

不同菌株對DTT的敏感性測定

GO功能分析表明，差異表達基因在生物學(xué)過程分布最多，達到2 188個；在細胞組分中，有3 489個差異表達基因；在分子功能中，有2 490個差異表達基因。這些差異表達基因被聚類到41個功能組中。在生物學(xué)過程中，差異表達基因主要分布在代謝過程、細胞過程、單細胞過程、定位、細胞成分組織和合成、生物調(diào)節(jié)、生物過程調(diào)控和應(yīng)激反應(yīng)；細胞組分中的膜和膜組分過程類型的差異表達基因所占比例最高；分子功能組分中催化活性和結(jié)合過程類型差異表達基因所占比例最高（圖3）。圖3 差異表達基因GO功能分類

圖2 總RNA電泳圖譜以校正后的P-value進行統(tǒng)計檢驗，差異表達基因共鑒定出顯著富集的GO term 240個，其中細胞組分、分子功能和生物過程分別為33、46和161個。從最顯著富集的前6個GO分類可以看出，差異表達基因主要與蛋白質(zhì)折疊（GO:0006457）、非折疊蛋白結(jié)合（GO:0051082）、核糖核蛋白復(fù)合體亞結(jié)構(gòu)（GO:0071826）、核糖體RNA結(jié)合（GO:0019843）、核糖體亞基（GO:0044391）和核仁（GO:0005730）相關(guān)（表2）。這些差異基因的表達可能對果生刺盤孢響應(yīng)DTT脅迫造成的非折疊蛋白具有十分重要的作用。

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3330803