獼猴桃病毒A和B在陜西省的分布、分子變異與基因組研究
發(fā)布時(shí)間:2023-03-11 21:50
系統(tǒng)調(diào)查了中國(guó)陜西省獼猴桃主產(chǎn)區(qū)周至、眉縣、楊凌和漢中‘徐香’、‘海沃德’、‘華優(yōu)’和‘秦美’獼猴桃上獼猴桃病毒A(Ac VA)和獼猴桃病毒B(Ac VB)的帶毒率和分布情況。結(jié)果表明,Ac VA和Ac VB在4個(gè)產(chǎn)區(qū)均有廣泛地分布和較高的帶毒率。其中,Ac VA和Ac VB分別在楊凌(36.7%)和眉縣(36.9%)有最高的帶毒率。按照品種劃分,Ac VA(32.3%)和Ac VB(32.9%)均在‘徐香’品種上有最高的帶毒率。通過高通量測(cè)序與分析獲得了Ac VA和Ac VB的基因組序列,其分別由7 654和7 454個(gè)核苷酸組成,與之前報(bào)道的TP7-93A和TP7-93B分離物對(duì)應(yīng)的同源率分別為82.7%和78.5%。Ac VA和Ac VB外殼蛋白基因系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,2種病毒分成2個(gè)組,存在較大的分子變異。
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 病毒的RT-PCR檢測(cè)
1.3 克隆、序列測(cè)定與分析
1.4 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 AcVA和Ac VB的帶毒率
2.2 轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果
2.3 AcVA和Ac VB的基因組分析
2.4 AcVA和Ac VB的分子變異
3 討論
本文編號(hào):3760318
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1 材料與方法
1.1 材料
1.2 病毒的RT-PCR檢測(cè)
1.3 克隆、序列測(cè)定與分析
1.4 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 AcVA和Ac VB的帶毒率
2.2 轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果
2.3 AcVA和Ac VB的基因組分析
2.4 AcVA和Ac VB的分子變異
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