新疆野蘋果NAC基因分析及抗腐爛病基因篩選
發(fā)布時(shí)間:2022-10-20 15:22
【目的】探明新疆野蘋果(Malus sieversii)中NAC基因資源,篩選潛在的抗腐爛病NAC基因!痉椒ā恳阅J街参飻M南芥(Arabidopsis thaliana)的NAC蛋白為種子構(gòu)建隱馬可夫模型,從新疆野蘋果轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中鑒定NAC轉(zhuǎn)錄因子,利用Protparam及qRT-PCR等手段對(duì)其理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、保守基序、系統(tǒng)進(jìn)化及腐爛病菌侵染后的表達(dá)譜進(jìn)行分析。【結(jié)果】從新疆野蘋果中鑒定到165個(gè)NAC基因,根據(jù)蛋白系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分為12個(gè)亞組,且MsNACs在各亞組間分布不均。蛋白理化性質(zhì)分析結(jié)果表明,MsNACs大多屬酸性,且多為親水性蛋白。保守基序分析結(jié)果表明,大多數(shù)MsNAC轉(zhuǎn)錄因子擁有由7個(gè)保守基序組成的完整NAC結(jié)構(gòu)域,少數(shù)存在亞結(jié)構(gòu)域的缺失。膜結(jié)合域分析結(jié)果表明,有18個(gè)MsNACs蛋白具有膜結(jié)合域,且大多定位于細(xì)胞核,少數(shù)定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、線粒體等其他細(xì)胞器。表達(dá)分析結(jié)果表明,34個(gè)MsNACs在腐爛病菌侵染后差異表達(dá),可根據(jù)表達(dá)模式分為A、B、C三個(gè)亞簇,其中MsNAC073和MsNAC102表達(dá)變化劇烈,分別在5 dpi下調(diào)近6倍和上調(diào)近140倍!窘Y(jié)論】基于...
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 材料及處理
1.2 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因檢索與鑒定
1.3 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、膜結(jié)合域及亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
1.4 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.5 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子NAC結(jié)構(gòu)域保守基序分析
1.6 野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因在腐爛病脅迫下的基因表達(dá)特征分析
2 結(jié)果與分析
2.1 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及理化性質(zhì)分析
2.2 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 新疆野蘋果NAC家族蛋白保守基序的鑒定及分析
2.4 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子的膜結(jié)合域分析
2.5 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因腐爛病脅迫下的表達(dá)特征分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]劃布輪法鑒定新疆野蘋果樹腐爛病抗性方法的建立[J]. 劉曉潔,李小雙,張燕,梁玉青,周平,趙津藝,張道遠(yuǎn). 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]基于RNA-seq數(shù)據(jù)的生姜NAC轉(zhuǎn)錄因子家族鑒定及分析[J]. 廖欽洪,鄒勇,李洪雷,姜玉松. 中國(guó)中藥雜志. 2018(03)
[3]天山野蘋果林蘋果小吉丁與蘋果腐爛病復(fù)合危害研究[J]. 劉愛華,張新平,溫俊寶,岳朝陽,阿里木,焦淑萍,張靜文,克熱曼. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[4]番茄NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及生物信息學(xué)分析[J]. 陳秀玲,王傲雪,張珍珠,李景富. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]新疆野蘋果和秦冠的抗黑星病特性[J]. 胡小平,張吉光,陳婧,周書濤,楊家榮,康振生. 植物病理學(xué)報(bào). 2010(06)
[6]中國(guó)天山野果林種子植物組成及資源狀況分析[J]. 羊海軍,崔大方,許正,林培鈞. 植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2003(02)
碩士論文
[1]新疆野蘋果(Malus sieversii)生物學(xué)特性和居群遺傳多樣性研究[D]. 楊美玲.天津農(nóng)學(xué)院 2014
本文編號(hào):3694788
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【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 材料及處理
1.2 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因檢索與鑒定
1.3 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、膜結(jié)合域及亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
1.4 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.5 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子NAC結(jié)構(gòu)域保守基序分析
1.6 野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因在腐爛病脅迫下的基因表達(dá)特征分析
2 結(jié)果與分析
2.1 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及理化性質(zhì)分析
2.2 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 新疆野蘋果NAC家族蛋白保守基序的鑒定及分析
2.4 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子的膜結(jié)合域分析
2.5 新疆野蘋果NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因腐爛病脅迫下的表達(dá)特征分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]劃布輪法鑒定新疆野蘋果樹腐爛病抗性方法的建立[J]. 劉曉潔,李小雙,張燕,梁玉青,周平,趙津藝,張道遠(yuǎn). 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]基于RNA-seq數(shù)據(jù)的生姜NAC轉(zhuǎn)錄因子家族鑒定及分析[J]. 廖欽洪,鄒勇,李洪雷,姜玉松. 中國(guó)中藥雜志. 2018(03)
[3]天山野蘋果林蘋果小吉丁與蘋果腐爛病復(fù)合危害研究[J]. 劉愛華,張新平,溫俊寶,岳朝陽,阿里木,焦淑萍,張靜文,克熱曼. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[4]番茄NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及生物信息學(xué)分析[J]. 陳秀玲,王傲雪,張珍珠,李景富. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]新疆野蘋果和秦冠的抗黑星病特性[J]. 胡小平,張吉光,陳婧,周書濤,楊家榮,康振生. 植物病理學(xué)報(bào). 2010(06)
[6]中國(guó)天山野果林種子植物組成及資源狀況分析[J]. 羊海軍,崔大方,許正,林培鈞. 植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2003(02)
碩士論文
[1]新疆野蘋果(Malus sieversii)生物學(xué)特性和居群遺傳多樣性研究[D]. 楊美玲.天津農(nóng)學(xué)院 2014
本文編號(hào):3694788
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