【背景】LM1212菌株是昆蟲病原菌蘇云金芽胞桿菌（Bacillus thuringiensis,Bt）中的一員,其芽胞和晶體分別產(chǎn)生于芽胞形成細(xì)胞和晶體產(chǎn)生細(xì)胞中,具有獨特的細(xì)胞分化表型。與野生株LM1212相比,突變株LM1212-DB芽胞細(xì)胞比例明顯降低并產(chǎn)生更高比例的晶體產(chǎn)生細(xì)胞,這使得LM1212-DB菌株成為研究晶體產(chǎn)生細(xì)胞形成機(jī)制和提高菌株殺蟲活性的絕佳實驗材料�！灸康摹勘容^LM1212菌株和LM1212-DB菌株的基因組差異,以便于揭示導(dǎo)致這兩個菌株表型差異的原因。【方法】利用單分子測序技術(shù)（single molecular real-time,SMRT）和Pacbio RS II測序平臺對兩個菌株進(jìn)行全基因組測序,對染色體和質(zhì)粒、雙組分信號系統(tǒng)和插入序列等進(jìn)行差異分析,并構(gòu)建表型特性相關(guān)基因的系統(tǒng)發(fā)育樹。【結(jié)果】基因組分析發(fā)現(xiàn),LM1212和LM1212-DB菌株均含有豐富的插入序列和雙組分信號系統(tǒng),暗示兩個菌株極易發(fā)生基因重排且具有較強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)性。與LM1212菌株相比,突變株LM1212-DB中發(fā)生了染色體和質(zhì)粒片段缺失、質(zhì)粒重排、質(zhì)�？截悢�(shù)變異。進(jìn)一步分析缺失... 

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 供試菌株
    1.2 主要試劑和儀器
    1.3 培養(yǎng)基
    1.4 基因組制備與測序
    1.5 測序數(shù)據(jù)的組裝及注釋
    1.6 插入序列鑒定及比較基因組分析
    1.7 CpcR同源序列系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 LM1212菌株和突變株LM1212-DB的全基因組概況
    2.2 LM1212菌株和突變株LM1212-DB的染色體結(jié)構(gòu)變異及功能分析
    2.3 LM1212菌株和突變株LM1212-DB的質(zhì)粒差異分析
    2.4 LM1212-DB菌株質(zhì)粒缺失片段的生物學(xué)功能分析
    2.5 LM1212-DB菌株中拷貝數(shù)增加的轉(zhuǎn)錄因子Cpc R的分布情況及系統(tǒng)發(fā)育樹
    2.6 LM1212菌株和突變株LM1212-DB雙組分信號系統(tǒng)分析
    2.7 LM1212菌株和突變株LM1212-DB的插入序列分析
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]細(xì)菌插入序列中的轉(zhuǎn)座酶和轉(zhuǎn)座機(jī)制[J]. 張孟思,朱德康,汪銘書.  中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2018(10)
[2]蘇云金芽胞桿菌LM1212質(zhì)粒缺失對細(xì)胞分化的影響[J]. 馬麗霞,彭琦,Lereclus Didier,張杰,郭淑元,宋福平.  微生物學(xué)通報. 2017(03)



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