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廣東省江門市捕獲鼠類的DNA條形碼分析

發(fā)布時間:2022-02-20 22:29
  目的應用DNA條形碼技術對廣東省江門市新會區(qū)農田捕獲的鼠類進行種類鑒定和分析,為研究鼠形動物的多樣性及鼠害防治奠定基礎。方法以2017年12月在廣東省江門市新會區(qū)農田捕獲的45只鼠為研究對象,分別提取鼠基因組DNA,采用通用引物擴增線粒體細胞色素C氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ)基因片段并進行測序,將測序結果在美國國立生物技術信息中心中進行BLAST序列同源性比對,采用鄰接法構建分子進化樹,基于雙參數模型計算遺傳距離。結果 45只鼠樣本均能通過PCR擴增出特異性基因片段,通過BLAST比對共鑒定出4種鼠(黃毛鼠、黃胸鼠、褐家鼠和黑緣齒鼠),37只鼠樣本與形態(tài)學鑒定結果一致,為黃毛鼠;8只鼠樣本存在形態(tài)鑒定錯誤,經復核,其中5只鼠重新鑒定為黃胸鼠,2只為幼年褐家鼠,另外1只為黑緣齒鼠。對45條序列進行比對分析發(fā)現有131個變異位點,單倍型分析結果顯示有12個不同的單倍型。黃毛鼠種內遺傳距離為0~1.2%,不同鼠種間遺傳距離為7.1%~11.6%,平均遺傳距離為(10.1±0.7)%,分子進化分析結果顯示,同一種鼠類的個體聚為一支,支持率均為100%,能區(qū)分不同鼠種。結論 DNA條形碼技術能夠有效區(qū)... 

【文章來源】:中國媒介生物學及控制雜志. 2020,31(03)

【文章頁數】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣品的采集
    1.2 鼠基因組DNA的提取
    1.3 COⅠ基因的擴增與測序
    1.4 COⅠ基因序列分析與系統發(fā)育樹的構建
2 結果
    2.1 COⅠ基因擴增與假基因甄別
    2.2 COⅠ基因的同源性比對與形態(tài)鑒定結果的修訂
    2.3 DNA條形碼分析
3 討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]甘肅省鼠疫疫源地嚙齒動物DNA條形碼分析[J]. 郭麗民,席進孝,蓋永志,吳斌,王世明,苗克軍,穆洮霞,徐大琴.  中國媒介生物學及控制雜志. 2019(02)
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[3]黑龍江地區(qū)農田害鼠發(fā)生特點及DNA條形碼鑒定技術的應用[J]. 李爭光,叢林,王大偉,羅嬋,田林,耿遠昭,宋英,馬曉慧,李寧,劉曉輝.  植物保護. 2018(06)
[4]How many species of Apodemus and Rattus occur in China? A survey based on mitochondrial cyt b and morphological analyses[J]. Shao-Ying Liu,Kai He,Shun-De Chen,Wei Jin,Robert W.Murphy,Ming-Kun Tang,Rui Liao,Feng-Jun Li.  Zoological Research. 2018(05)
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[7]DNA條形碼技術在河北省壩上地區(qū)夜行鼠鑒定中的應用[J]. 金圣浩,魯亮,閆東,史獻明,崔耀仁,李玉偉,劉起勇,孔令艷.  中國媒介生物學及控制雜志. 2015(01)
[8]DNA條形碼技術在小型獸類鑒定中的探索:以甘肅蓮花山為例[J]. 何鍇,王文智,李權,羅培鵬,孫悅華,蔣學龍.  生物多樣性. 2013(02)
[9]DNA條形碼技術在青海海東地區(qū)小型獸類鑒定中的應用[J]. 馬英,李海龍,魯亮,劉起勇.  生物多樣性. 2012(02)



本文編號:3635936

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