發(fā)布時(shí)間：2021-11-14 15:12

　　基于全基因組數(shù)據(jù),確定生防菌株P(guān)F-1的分類地位,驗(yàn)證其對(duì)植物病原菌的拮抗作用以及挖掘其潛在的生防功能。通過(guò)全基因組中16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析及基因組分析方法確定生防菌株P(guān)F-1的分類地位,通過(guò)平板對(duì)峙方法研究其對(duì)馬鈴薯枯萎病菌和棉花黃萎病菌的拮抗能力;利用antiSMASH軟件分析和預(yù)測(cè)菌株P(guān)F-1的抗生素相關(guān)基因并挖掘其生防潛力。基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析及基因組分析結(jié)果,PF-1被鑒定為防御假單胞菌（Pseudomonas protegens）,同時(shí)發(fā)現(xiàn)PF-1基因組中存在15種次生代謝產(chǎn)物基因簇,具有良好的抑制病原菌生長(zhǎng)和提高植物抗病性的能力,在農(nóng)業(yè)中具有良好的應(yīng)用前景。 

【文章來(lái)源】：浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,32(10)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

PF-1對(duì)棉花黃萎病菌和馬鈴薯枯萎病菌的抑制效果

P. protegens PF-1與親緣關(guān)系較近的P. protegens Pf-5和P. protegens CHA0具有類似的次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇構(gòu)成。與已知功能的次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇比對(duì),P. protegens PF-1中具有5個(gè)相似度超過(guò)50%的次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇,且均具有抗菌作用。表1 PF-1及其近緣菌種平均核苷酸一致性(ANI)和DNA同源性分析(DDH)數(shù)值Table 1 ANI and DDH analysis between PF1 and relative strains 菌株名稱Strain name DDH/% ANI/% Pseudomonas protegens Pf-5 99.1 99.99 Pseudomonas protegens CHA0T 89.6 98.87 Pseudomonas saponiphila DSM 9751T 37.8 90.15 Pseudomonas amygdali CFBP 3205T 23.1 84.42 Pseudomonas ficuserectae ICMP7848 22.7 83.60 Pseudomonas cerasi PL963 22.6 84.74 Pseudomonas meliae CFBP 3225T 22.2 85.00 Pseudomonas congelans DSM 14939T 21.8 84.28 Pseudomonas tremae ICMP 9151 20.1 83.45 Pseudomonas caspiana FBF 102T 20.0 83.65

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于全基因組的芽孢桿菌平均核苷酸同源性（ANI）分析[J]. 劉波,胡桂萍,唐唯其.  福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(09)
[2]生防細(xì)菌在植物病害防治中的應(yīng)用[J]. 嚴(yán)婉榮,趙廷昌,肖彤斌,肖敏,趙志祥,陳綿才.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2013(04)
[3]我國(guó)植物病害生物防治綜述[J]. 劉琴,劉翼,何月秋,林泋君,姜開梅.  安徽農(nóng)學(xué)通報(bào)(上半月刊). 2012(07)
[4]植物病害生物防治概述[J]. 付小軍,盛鑫,馬進(jìn),張毅,徐進(jìn).  陜西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(04)
[5]新型生物農(nóng)藥藤黃綠膿菌素[J]. 何延靜,胡洪波,許煜泉,張雪洪.  農(nóng)藥. 2006(03)



本文編號(hào)：3494866