多肉植物紅心蓮莖腐病尖孢鐮刀菌LAMP快速檢測技術的建立
發(fā)布時間:2021-11-13 20:19
【目的】建立一種景天科多肉植物紅心蓮莖腐病菌尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)快速、簡便、靈敏的LAMP可視化檢測方法,在莖腐病發(fā)生初期實現(xiàn)病原菌的快速準確檢測,為病害的早期監(jiān)測、診斷及防治提供依據(jù)�!痉椒ā恳訣F-1a(Elongation factor-1α)基因序列為靶序列,設計LAMP(Loopmediated isothermal amplification)特異性引物;以紅心蓮尖孢鐮刀菌DNA為模板,優(yōu)化反應溫度和反應時間,建立LAMP檢測反應體系,開展特異性和靈敏度驗證及田間病株檢測�!窘Y果】建立的LAMP反應體系可有效檢測出多肉植物紅心蓮莖腐病尖孢鐮刀菌,最佳反應溫度、反應時間分別為65℃,60 min;特異性驗證表明紅心蓮尖孢鐮刀菌DNA呈綠色陽性反應,靈敏度驗證表明LAMP檢測最小質量濃度是10 fg·μL-1,比常規(guī)PCR提高了10倍;采用LAMP法對15份疑似紅心蓮莖腐病田間樣本進行快速檢測,檢出率為100%�!窘Y論】本研究建立的多肉植物紅心蓮莖腐病菌LAMP快速檢測方法不僅特異性強、靈敏度高,而且檢測結果可視、假陽性低,適合田間尖孢鐮刀菌引起的...
【文章來源】:福建農業(yè)學報. 2020,35(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
LAMP靈敏度檢測驗證
特異性驗證:對27株供試菌株進行LAMP檢測,通過觀察LAMP產(chǎn)物顏色判定擴增結果;后從反應菌株中挑選1株從紅心蓮上分離的F.oxysporum,3株從多肉植物上分離的Colletotrichum destructivum、Corynespora cassiicola和Alternaria alternata,3株從其他寄主植物上分離的鐮刀菌屬菌株F.moniliforme、F.solani和F.sporotrichioides,共7株菌株進行瓊脂糖凝膠電泳,以無菌雙蒸水為陰性對照,通過判定電泳梯形條帶的有無驗證LAMP檢測的特異性。試驗設3次重復。靈敏度驗證:將紅心蓮尖孢鐮刀菌樣本DNA按10倍濃度梯度依次稀釋為10 ng·μL-1~1 fg·μL-18個不同濃度,同時進行LAMP檢測和PCR檢測,比對2種檢測方法的靈敏度差異;試驗設3次重復。
LAMP檢測結果可靠性驗證表明,陽性對照呈綠色,對應的瓊脂糖凝膠電泳擴增出梯形條帶;陰性對照呈現(xiàn)黃綠色,瓊脂糖凝膠電泳無梯形條帶(圖3)。表明建立的LAMP檢測方法可行,能可靠檢測到紅心蓮尖孢鐮刀菌F.oxysporum。圖3 LAMP檢測紅心蓮尖孢鐮刀菌Fusarium oxysporum
【參考文獻】:
期刊論文
[1]馬鈴薯S病毒PVSO株系RT-LAMP檢測方法的建立及應用[J]. 李華偉,許泳清,羅文彬,紀榮昌,劉中華,許國春,張鴻,李國良,林趙淼,邱永祥,邱思鑫,湯浩. 園藝學報. 2018(08)
[2]燕麥鐮孢菌環(huán)介導等溫擴增(LAMP)檢測方法的建立與應用[J]. 漆永紅,曹素芳,李雪萍,李敏權. 草地學報. 2018(04)
[3]大豆莖褐腐病菌環(huán)介導等溫擴增檢測技術的建立[J]. 吳旭東,陸辰晨,沈浩,吳翠萍,張海峰,王源超,鄭小波. 南京農業(yè)大學學報. 2015(04)
[4]河北和內蒙古馬鈴薯干腐病菌種類鑒定[J]. 魏巍,朱杰華,張宏磊,楊志輝. 植物保護學報. 2013(04)
碩士論文
[1]應用LAMP檢測技術快速診斷大豆根莖部真菌病害[D]. 宋必.南京農業(yè)大學 2015
本文編號:3493655
【文章來源】:福建農業(yè)學報. 2020,35(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
LAMP靈敏度檢測驗證
特異性驗證:對27株供試菌株進行LAMP檢測,通過觀察LAMP產(chǎn)物顏色判定擴增結果;后從反應菌株中挑選1株從紅心蓮上分離的F.oxysporum,3株從多肉植物上分離的Colletotrichum destructivum、Corynespora cassiicola和Alternaria alternata,3株從其他寄主植物上分離的鐮刀菌屬菌株F.moniliforme、F.solani和F.sporotrichioides,共7株菌株進行瓊脂糖凝膠電泳,以無菌雙蒸水為陰性對照,通過判定電泳梯形條帶的有無驗證LAMP檢測的特異性。試驗設3次重復。靈敏度驗證:將紅心蓮尖孢鐮刀菌樣本DNA按10倍濃度梯度依次稀釋為10 ng·μL-1~1 fg·μL-18個不同濃度,同時進行LAMP檢測和PCR檢測,比對2種檢測方法的靈敏度差異;試驗設3次重復。
LAMP檢測結果可靠性驗證表明,陽性對照呈綠色,對應的瓊脂糖凝膠電泳擴增出梯形條帶;陰性對照呈現(xiàn)黃綠色,瓊脂糖凝膠電泳無梯形條帶(圖3)。表明建立的LAMP檢測方法可行,能可靠檢測到紅心蓮尖孢鐮刀菌F.oxysporum。圖3 LAMP檢測紅心蓮尖孢鐮刀菌Fusarium oxysporum
【參考文獻】:
期刊論文
[1]馬鈴薯S病毒PVSO株系RT-LAMP檢測方法的建立及應用[J]. 李華偉,許泳清,羅文彬,紀榮昌,劉中華,許國春,張鴻,李國良,林趙淼,邱永祥,邱思鑫,湯浩. 園藝學報. 2018(08)
[2]燕麥鐮孢菌環(huán)介導等溫擴增(LAMP)檢測方法的建立與應用[J]. 漆永紅,曹素芳,李雪萍,李敏權. 草地學報. 2018(04)
[3]大豆莖褐腐病菌環(huán)介導等溫擴增檢測技術的建立[J]. 吳旭東,陸辰晨,沈浩,吳翠萍,張海峰,王源超,鄭小波. 南京農業(yè)大學學報. 2015(04)
[4]河北和內蒙古馬鈴薯干腐病菌種類鑒定[J]. 魏巍,朱杰華,張宏磊,楊志輝. 植物保護學報. 2013(04)
碩士論文
[1]應用LAMP檢測技術快速診斷大豆根莖部真菌病害[D]. 宋必.南京農業(yè)大學 2015
本文編號:3493655
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