轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子AbrB對生防短短芽胞桿菌X23中抗生素edeines生物合成的影響
發(fā)布時間:2021-11-02 06:54
非核糖體類抗生素edeines是短短芽胞桿菌Brevibacillus brevis X23產(chǎn)生的主要抑菌物質(zhì),提高其產(chǎn)量有助于增加生防效果。通過全基因組測序及生物信息學(xué)分析挖掘短短芽胞桿菌X23的全局性調(diào)控因子,基于Red/ET同源重組技術(shù)構(gòu)建溫敏型敲除載體,通過雙交換同源重組技術(shù)獲得短短芽胞桿菌X23全局性轉(zhuǎn)錄負(fù)調(diào)控因子缺失的突變株,然后采用平板抑菌、液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(HPLC-MS)和實(shí)時熒光定量PCR研究了全局性轉(zhuǎn)錄負(fù)調(diào)控因子敲除對短短芽胞桿菌X23不同生長時期發(fā)酵液的抑菌活性、edeines產(chǎn)量、ede操縱子轉(zhuǎn)錄水平的影響。從短短芽胞桿菌X23基因組中挖掘到了1個全局性轉(zhuǎn)錄負(fù)調(diào)控因子AbrB,敲除abrB基因后edeines生物合成基因簇操縱子的轉(zhuǎn)錄水平在生長前期顯著提高,在發(fā)酵48 h后abrB突變株中edeine A和edeine B總產(chǎn)量比出發(fā)菌株提高了1.1倍。結(jié)果顯示短短芽胞桿菌X23中AbrB是edeines生物合成過程中的負(fù)調(diào)控因子,敲除abrB提高了edeines的產(chǎn)量。
【文章來源】:中國生物防治學(xué)報. 2020,36(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
野生型X23菌株中abrB基因敲除流程以及轉(zhuǎn)化子菌落PCR鑒定
從野生型X23基因組(NCBI登錄號:NZ_CP023474.1)中找到了一個注釋為abr B的基因,長度249 bp,編碼的AbrB蛋白編號(登錄號:WP_007719913.1)。與土壤短芽胞桿菌Br.agri(登錄號:ELK42020.1)的AbrB蛋白序列相似性高達(dá)100%,與短芽胞桿菌屬Brevibacillus spp.內(nèi)的其他多個種的AbrB蛋白序列相似性在95%以上。與其他屬的相似性分析表明,野生型X23菌株的AbrB與類芽胞桿菌屬(Paenibacillus spp.,登錄號:AEI46109.1)的AbrB蛋白氨基酸相似性最高,在83%~89%,與芽胞桿菌屬(Bacillus spp.)的AbrB蛋白序列相似性也在70%以上,其中與模式菌枯草芽胞桿菌168的AbrB蛋白序列(登錄號:NC_000964.3)相似性達(dá)70.7%,其中N端的序列高度保守(圖2A),并在染色體中abrB基因上下游的基因也與枯草芽胞桿菌168一致(圖2B)。與解淀粉芽胞桿菌SQR9的abrB基因序列(登錄號:NZ_CP006890.1)的相似性達(dá)72.6%(圖2A);谏鲜龇治,初步確定該蛋白就是野生型X23菌株中全局調(diào)控因子AbrB。2.2 ΔabrB X23菌株的構(gòu)建
轉(zhuǎn)化子菌落PCR目的條帶大小與理論一致。PCR產(chǎn)物測序結(jié)果顯示無突變,表明野生型X23中的abrB基因已經(jīng)被成功敲除(圖3)。2.3 abrB敲除對X23菌株生長的影響
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兩種繪制枯草芽孢桿菌和大腸桿菌生長曲線方法的比較[J]. 何嵐,王柳懿,朱琪,喬家運(yùn),王文杰. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[2]煙草青枯病生防菌混合接種對其定殖及防效的影響[J]. 呂建林,劉二明,柏連陽,肖啟明,奉光平,燕瑋婷. 中國生物防治. 2010(02)
[3]青枯菌拮抗菌2-Q-9的分子鑒定及抑菌相關(guān)基因的克隆[J]. 張旭,陳武,楊玉婷,黎定軍,黃三文. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(03)
[4]側(cè)孢芽孢桿菌2-Q-9外泌抑菌物質(zhì)性質(zhì)[J]. 黎定軍,陳武,羅寬. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(04)
[5]細(xì)菌DNA提取方法比較[J]. 沈德新,封志純,杜江. 中原醫(yī)刊. 2004(10)
[6]湖南煙草青枯病土壤拮抗菌的篩選[J]. 黎定軍,廖曉蘭,羅寬. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1997(03)
碩士論文
[1]短短芽孢桿菌X23外泌edeineB純化和鑒定[D]. 盧行.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]生防菌Brevibacillus brevis X23的全基因組測序與抑菌機(jī)理研究[D]. 李林.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號:3471551
【文章來源】:中國生物防治學(xué)報. 2020,36(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
野生型X23菌株中abrB基因敲除流程以及轉(zhuǎn)化子菌落PCR鑒定
從野生型X23基因組(NCBI登錄號:NZ_CP023474.1)中找到了一個注釋為abr B的基因,長度249 bp,編碼的AbrB蛋白編號(登錄號:WP_007719913.1)。與土壤短芽胞桿菌Br.agri(登錄號:ELK42020.1)的AbrB蛋白序列相似性高達(dá)100%,與短芽胞桿菌屬Brevibacillus spp.內(nèi)的其他多個種的AbrB蛋白序列相似性在95%以上。與其他屬的相似性分析表明,野生型X23菌株的AbrB與類芽胞桿菌屬(Paenibacillus spp.,登錄號:AEI46109.1)的AbrB蛋白氨基酸相似性最高,在83%~89%,與芽胞桿菌屬(Bacillus spp.)的AbrB蛋白序列相似性也在70%以上,其中與模式菌枯草芽胞桿菌168的AbrB蛋白序列(登錄號:NC_000964.3)相似性達(dá)70.7%,其中N端的序列高度保守(圖2A),并在染色體中abrB基因上下游的基因也與枯草芽胞桿菌168一致(圖2B)。與解淀粉芽胞桿菌SQR9的abrB基因序列(登錄號:NZ_CP006890.1)的相似性達(dá)72.6%(圖2A);谏鲜龇治,初步確定該蛋白就是野生型X23菌株中全局調(diào)控因子AbrB。2.2 ΔabrB X23菌株的構(gòu)建
轉(zhuǎn)化子菌落PCR目的條帶大小與理論一致。PCR產(chǎn)物測序結(jié)果顯示無突變,表明野生型X23中的abrB基因已經(jīng)被成功敲除(圖3)。2.3 abrB敲除對X23菌株生長的影響
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兩種繪制枯草芽孢桿菌和大腸桿菌生長曲線方法的比較[J]. 何嵐,王柳懿,朱琪,喬家運(yùn),王文杰. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[2]煙草青枯病生防菌混合接種對其定殖及防效的影響[J]. 呂建林,劉二明,柏連陽,肖啟明,奉光平,燕瑋婷. 中國生物防治. 2010(02)
[3]青枯菌拮抗菌2-Q-9的分子鑒定及抑菌相關(guān)基因的克隆[J]. 張旭,陳武,楊玉婷,黎定軍,黃三文. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(03)
[4]側(cè)孢芽孢桿菌2-Q-9外泌抑菌物質(zhì)性質(zhì)[J]. 黎定軍,陳武,羅寬. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(04)
[5]細(xì)菌DNA提取方法比較[J]. 沈德新,封志純,杜江. 中原醫(yī)刊. 2004(10)
[6]湖南煙草青枯病土壤拮抗菌的篩選[J]. 黎定軍,廖曉蘭,羅寬. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1997(03)
碩士論文
[1]短短芽孢桿菌X23外泌edeineB純化和鑒定[D]. 盧行.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]生防菌Brevibacillus brevis X23的全基因組測序與抑菌機(jī)理研究[D]. 李林.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號:3471551
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