【目的】通過采用高通量技術(shù)篩選哈茨木霉菌株的效應(yīng)子�！痉椒ā扛鶕�(jù)哈茨木霉CBS 226.95菌株全基因組14 065個(gè)蛋白序列信息,利用SignalP、TMHMM、TargetP和Protcomp等生物信息學(xué)軟件和預(yù)測程序進(jìn)行分泌蛋白預(yù)測�！窘Y(jié)果】分析得到709個(gè)蛋白,占總蛋白的5.04%。再對709個(gè)分泌蛋白與胞外酶數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對分析、半胱氨酸含量、multiple tandem repeats分析,篩選獲得<300個(gè)氨基酸的小分子蛋白作為候選效應(yīng)蛋白。共獲得24個(gè)蛋白,其中有3個(gè)是碳水化合物結(jié)合模塊家族蛋白,其余21個(gè)為假定蛋白�！窘Y(jié)論】本研究利用生物信息學(xué)方法從哈茨木霉基因組中預(yù)測出候選效應(yīng)子,為進(jìn)一步研究效應(yīng)子在拮抗真菌與病原真菌及植物間的互作關(guān)系奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,33(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

709個(gè)哈茨木霉分泌蛋白的長度統(tǒng)計(jì)分析

396個(gè)哈茨木霉分泌蛋白的半胱氨酸殘基數(shù)量分布

【參考文獻(xiàn)】：
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