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育種企業(yè)_作科所玉米育種團(tuán)隊提出混合樣品分析新策略

發(fā)布時間:2016-10-16 16:07

  本文關(guān)鍵詞:育種,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


 

    近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所玉米分子育種技術(shù)和應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊鄒棖、王平喜、徐云碧將DNA混池分析方法擴(kuò)展為具有普遍適用性的混合樣品分析(bulked sample analysis),系統(tǒng)地闡述了適用于混合樣品分析的群體、抽樣和混合策略、標(biāo)記類型和鑒定平臺、實(shí)驗(yàn)設(shè)計原則及分析流程。相關(guān)評論和觀點(diǎn)文章《混合樣品分析在遺傳學(xué)、基因組學(xué)和作物改良中的應(yīng)用》發(fā)表在最新一期的《植物生物技術(shù)雜志》(Plant Biotechnology Journal)上。

 

    據(jù)介紹,上世紀(jì)90年代提出的混合分離體分析(bulked segregant analysis)或DNA混池分析(pooled DNA analysis)在遺傳學(xué)研究上得到廣泛應(yīng)用。隨著高通量測序和分析技術(shù)的發(fā)展,,DNA混池分析大大降低了分析成本,因而得到更為廣泛的應(yīng)用。玉米分子育種創(chuàng)新團(tuán)隊拓展的混合樣品分析方法可用于基因定位、 挖掘和克隆。它不受物種、群體或基因型分析平臺的限制,與物種是否具有參考基因組的無關(guān);既可以應(yīng)于自然群體中,也可以應(yīng)用于雙親分離群體;混合樣品分析適合于不同的基因型鑒定平臺,包括單個的分子標(biāo)記、高密度標(biāo)記芯片和基于測序的分子標(biāo)記系統(tǒng)等;旌蠘悠贩治隹稍诓煌姆肿铀缴线M(jìn)行,包括 DNA、RNA和蛋白質(zhì)。研究人員可以從任何遺傳或育種群體中采集極端個體,分類后進(jìn)行混合樣品的對比分析,也可以針對僅存的某種極端類型進(jìn)行混合樣品分析。高通量的基因型鑒定技術(shù)與混合樣品分析相結(jié)合已經(jīng)成為快速挖掘優(yōu)良等位基因及變異、開發(fā)重要農(nóng)藝性狀分子標(biāo)記的強(qiáng)大工具。混合樣品分析為利用基因組學(xué)技術(shù)和優(yōu)異種質(zhì)資源,挖掘重要農(nóng)藝性狀基因并應(yīng)用于作物改良提供了捷徑。 

 

    玉米分子育種創(chuàng)新團(tuán)隊近年來多次在國內(nèi)外重要學(xué)術(shù)會議上介紹混合樣品分析新策略。2016年5月17 -21日在“中德植物育種方法創(chuàng)新研討會”上,鄒棖博士系統(tǒng)介紹了混合樣品分析方法及其在遺傳學(xué)、基因組學(xué)和作物改良中的應(yīng)用。2016年8月16日在第七屆國際作物科學(xué)大會上,創(chuàng)新團(tuán)隊首席科學(xué)家徐云碧博士作了題為“利用混合樣本分析挖掘生物和非生物脅迫遺傳因子”的報告。與此同時,該創(chuàng)新團(tuán)隊與國內(nèi)外同行合作,已將混合樣品分析策略應(yīng)用于玉米大斑病和灰斑病抗性、低磷和漬害耐性等多個農(nóng)藝性狀的基因挖掘,并取得了預(yù)期的效果。

 

    該論文自從今年3月正式接受并上線以來已引起國內(nèi)外同行的廣泛關(guān)注,短期內(nèi)被大量下載并引用。

 

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  本文關(guān)鍵詞:育種,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:141908

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