育種企業(yè)_作科所玉米育種團隊提出混合樣品分析新策略
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近日,中國農業(yè)科學院作物科學研究所玉米分子育種技術和應用創(chuàng)新團隊鄒棖、王平喜、徐云碧將DNA混池分析方法擴展為具有普遍適用性的混合樣品分析(bulked sample analysis),系統(tǒng)地闡述了適用于混合樣品分析的群體、抽樣和混合策略、標記類型和鑒定平臺、實驗設計原則及分析流程。相關評論和觀點文章《混合樣品分析在遺傳學、基因組學和作物改良中的應用》發(fā)表在最新一期的《植物生物技術雜志》(Plant Biotechnology Journal)上。
據(jù)介紹,上世紀90年代提出的混合分離體分析(bulked segregant analysis)或DNA混池分析(pooled DNA analysis)在遺傳學研究上得到廣泛應用。隨著高通量測序和分析技術的發(fā)展,,DNA混池分析大大降低了分析成本,因而得到更為廣泛的應用。玉米分子育種創(chuàng)新團隊拓展的混合樣品分析方法可用于基因定位、 挖掘和克隆。它不受物種、群體或基因型分析平臺的限制,與物種是否具有參考基因組的無關;既可以應于自然群體中,也可以應用于雙親分離群體;混合樣品分析適合于不同的基因型鑒定平臺,包括單個的分子標記、高密度標記芯片和基于測序的分子標記系統(tǒng)等。混合樣品分析可在不同的分子水平上進行,包括 DNA、RNA和蛋白質。研究人員可以從任何遺傳或育種群體中采集極端個體,分類后進行混合樣品的對比分析,也可以針對僅存的某種極端類型進行混合樣品分析。高通量的基因型鑒定技術與混合樣品分析相結合已經成為快速挖掘優(yōu)良等位基因及變異、開發(fā)重要農藝性狀分子標記的強大工具;旌蠘悠贩治鰹槔没蚪M學技術和優(yōu)異種質資源,挖掘重要農藝性狀基因并應用于作物改良提供了捷徑。
玉米分子育種創(chuàng)新團隊近年來多次在國內外重要學術會議上介紹混合樣品分析新策略。2016年5月17 -21日在“中德植物育種方法創(chuàng)新研討會”上,鄒棖博士系統(tǒng)介紹了混合樣品分析方法及其在遺傳學、基因組學和作物改良中的應用。2016年8月16日在第七屆國際作物科學大會上,創(chuàng)新團隊首席科學家徐云碧博士作了題為“利用混合樣本分析挖掘生物和非生物脅迫遺傳因子”的報告。與此同時,該創(chuàng)新團隊與國內外同行合作,已將混合樣品分析策略應用于玉米大斑病和灰斑病抗性、低磷和漬害耐性等多個農藝性狀的基因挖掘,并取得了預期的效果。
該論文自從今年3月正式接受并上線以來已引起國內外同行的廣泛關注,短期內被大量下載并引用。
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本文編號:141908
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