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竹節(jié)參的遺傳多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2025-05-11 05:41
  竹節(jié)參(Panax japonicus(T.Nees)C.A.Meyer)為五加科(Araliaceae)人參屬(Panax L.)多年生草本植物,是人參屬植物中分布最廣泛的種類。竹節(jié)參可入藥,有較高藥用價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值,在中國有悠久的用藥歷史。由于中藥市場(chǎng)對(duì)其需求量大,而人工種植周期長,因此,野生資源被人為長期采挖,導(dǎo)致資源枯竭,亟需保護(hù)。本研究基于第二代測(cè)序技術(shù)開發(fā)了竹節(jié)參的微衛(wèi)星分子標(biāo)記,并采用該分子標(biāo)記對(duì)竹節(jié)參進(jìn)行群體遺傳分析,以期揭示其遺傳背景,為該物種的保護(hù)提供理論參考。采用Illumina二代測(cè)序技術(shù)建立竹節(jié)參基因組文庫和微衛(wèi)星文庫,分析微衛(wèi)星組成類型等特征。二代測(cè)序返回并組裝選取得到20 051條一致性序列,在其中的1 537條序列中查找出微衛(wèi)星位點(diǎn)1 998個(gè),含有微衛(wèi)星的片段占序列數(shù)的7.67%。所有微衛(wèi)星片段中單核苷酸重復(fù)數(shù)量最多,占總微衛(wèi)星位點(diǎn)數(shù)的39.99%,二核苷酸重復(fù)占比36.93%,在單核苷酸重復(fù)類型中A/T重復(fù)占據(jù)優(yōu)勢(shì)(占87.23%);二核苷酸重復(fù)類型中AT/AT占據(jù)優(yōu)勢(shì)(占51.76%),重復(fù)長度變異情況與微衛(wèi)星豐度呈負(fù)相關(guān)。設(shè)計(jì)并合成33對(duì)引物,通過...

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 緒論
    1.1 竹節(jié)參的生物學(xué)特性
        1.1.1 人參屬植物的概況
        1.1.2 竹節(jié)參的植物形態(tài)
        1.1.3 竹節(jié)參的地理分布
        1.1.4 竹節(jié)參的生存現(xiàn)狀
    1.2 竹節(jié)參的研究進(jìn)展
        1.2.1 竹節(jié)參的化學(xué)成分研究
        1.2.2 竹節(jié)參活性成分的作用研究
        1.2.3 竹節(jié)參的細(xì)胞學(xué)研究
        1.2.4 竹節(jié)參的生藥學(xué)研究
        1.2.5 竹節(jié)參的分類學(xué)研究
    1.3 竹節(jié)參的遺傳多樣性與研究方法
        1.3.1 遺傳多樣性與物種保護(hù)
        1.3.2 DNA分子標(biāo)記
        1.3.3 微衛(wèi)星分子標(biāo)記
    1.4 本研究的內(nèi)容及其意義
        1.4.1 本研究的目的
        1.4.2 研究內(nèi)容
        1.4.3 研究意義
第2章 竹節(jié)參微衛(wèi)星特征分析與分子標(biāo)記開發(fā)
    2.1 實(shí)驗(yàn)試劑儀器與材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備
        2.2.2 竹節(jié)參DNA的提取與檢測(cè)
        2.2.3 竹節(jié)參基因文庫的構(gòu)建與微衛(wèi)星特征分析
        2.2.4 竹節(jié)參微衛(wèi)星引物設(shè)計(jì)和篩選
        2.2.5 引物通用性檢測(cè)
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.3.1 竹節(jié)參DNA的完整度與純度檢測(cè)
        2.3.2 竹節(jié)參基因組序列的微衛(wèi)星組成與特征
        2.3.3 微衛(wèi)星不同重復(fù)單元的序列長度以及變異
        2.3.4 竹節(jié)參基因組SSR引物設(shè)計(jì)與篩選
        2.3.5 竹節(jié)參SSR引物的通用性檢測(cè)
    2.4 討論
第3章 竹節(jié)參的遺傳多樣性研究
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 樣本采集
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 竹節(jié)參DNA的提取及檢測(cè)
        3.2.2 竹節(jié)參的PCR擴(kuò)增與聚丙烯酰氨凝膠電泳檢測(cè)
        3.2.3 竹節(jié)參的遺傳多樣性分析
        3.2.4 竹節(jié)參的遺傳分化及其種群遺傳關(guān)系分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 竹節(jié)參DNA的提取及檢測(cè)結(jié)果
        3.3.2 竹節(jié)參的DNA擴(kuò)增效果
        3.3.3 竹節(jié)參的遺傳多樣性
        3.3.4 竹節(jié)參的遺傳分化分析
    3.4 討論
        3.4.1 竹節(jié)參的遺傳多樣性
        3.4.2 竹節(jié)參的遺傳分化
        3.4.3 竹節(jié)參的瀕危原因
        3.4.4 竹節(jié)參的保護(hù)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士期間學(xué)術(shù)成果
致謝



本文編號(hào):4044931

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