【摘要】：大黃魚(Larimichthys crocea)屬鱸形目、石首魚科、黃魚屬,是我國特有的重要海水經(jīng)濟(jì)魚類。隨著環(huán)境惡化和過度捕撈使得野生大黃魚資源遭到毀滅性的破壞,天然捕撈資源急劇下降,為了恢復(fù)和保護(hù)大黃魚資源,我國水產(chǎn)科技工作者對大黃魚人工繁殖與苗種培育進(jìn)行了大量的研究試驗(yàn),取得了一系列顯著性的成果,推動了大黃魚養(yǎng)殖業(yè)的快速發(fā)展,目前大黃魚資源已經(jīng)轉(zhuǎn)變?yōu)槿斯ゐB(yǎng)殖群體為主,野生群體為輔的狀況,但在漁業(yè)生產(chǎn)與管理過程中如何對大黃魚種質(zhì)資源進(jìn)行鑒定尚缺乏一套科學(xué)可靠的研究技術(shù)和方法。因此,本研究借助大黃魚的外部形態(tài)、鱗片特征、耳石輪紋,骨骼m(xù)icro CT掃描顯微結(jié)構(gòu),線粒體D-loop區(qū)和Cytb基因以及基于核基因的微衛(wèi)星標(biāo)記等技術(shù)手段,比較和分析了大黃魚野生群體和養(yǎng)殖群體的種質(zhì)差異,以期為大黃魚種質(zhì)鑒定和資源管理提供科學(xué)可靠的依據(jù)。具體研究結(jié)果如下:(1)通過對大黃魚野生群體和養(yǎng)殖群體的形態(tài)性狀、鱗片與矢耳石輪紋特征進(jìn)行了分析比較。形態(tài)性狀比較結(jié)果表明,養(yǎng)殖群體的肥滿度(Fatness)、體高(BH)/體長(BL)、體厚(BT)/體長(BL)和尾柄高(CPH)/尾長(TL)比值顯著大于野生群體(P0.01),野生群體軀干長(TL)/體長(BL)比值大于養(yǎng)殖群體(P0.05),養(yǎng)殖群體在體型上出現(xiàn)偏短、粗現(xiàn)象。養(yǎng)殖群體與野生群體在鱗片輪紋特征上無顯著差異,部分個(gè)體鱗片上觀察到有年輪和副輪分布。野生群體耳石輪紋較為致密,明暗帶間隔不均,耳石中心核及周圍區(qū)域?yàn)樯铧S色,年齡組成復(fù)雜,有0~2個(gè)年輪;養(yǎng)殖群體耳石輪紋較稀疏,明暗帶間隔均勻,耳石中心核及周圍區(qū)域較透明,觀察到有1個(gè)年輪。這些差異間接反映了兩個(gè)群體在生活環(huán)境條件、食物餌料供給方面的差異。(2)運(yùn)用Micro CT技術(shù)對大黃魚全魚骨骼系統(tǒng)進(jìn)行了掃描與三維重建,比較了野生群體和養(yǎng)殖群體背部和尾部脊椎骨顯微結(jié)構(gòu)參數(shù)差異。結(jié)果顯示,大黃魚脊椎骨與頭骨、尾骨相連,脊椎骨26個(gè),肋骨附著在第1~11腹椎,無肌間刺,胸鰭位于頭骨后,背鰭、腹鰭、臀鰭和尾鰭與脊椎骨不相連。大黃魚野生群體背部和尾部脊椎骨的組織礦物質(zhì)密度(TMD)和骨礦物質(zhì)密度(BMD)均顯著高于養(yǎng)殖群體(P0.01),骨體積分?jǐn)?shù)(BV/TV)較養(yǎng)殖群體大(P0.05),骨小梁間隔(Tb.Sp)較養(yǎng)殖群體小(P0.05),骨小梁數(shù)量(TB.N)、骨小梁厚度(Tb.Th)和結(jié)構(gòu)模型指數(shù)(SMI)上沒有差別(P0.05)。造成這些差異的主要原因可能與野生群體和養(yǎng)殖群體食物組成、生活環(huán)境以及活動情況等差異有關(guān)。(3)利用大黃魚線粒體(mtDNA)D-loop區(qū)和Cytb基因中的788bp和1028bp片段,比較分析了大黃魚野生群體和養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性與群體遺傳結(jié)構(gòu)差異,結(jié)果表明,在105個(gè)樣本Cytb的1028bp片段中,共檢測到20個(gè)變異位點(diǎn),大黃魚野生群體YS含19個(gè)變異位點(diǎn),繁育群體FY含15個(gè),選育群體F3代含14個(gè)、F4代含8個(gè),遺傳多樣性指數(shù)分析結(jié)果顯示,野生群體單倍型多樣性指數(shù)(Hd)為0.842,核苷酸多樣性指數(shù)(π)為0.00575,繁育群體相應(yīng)參數(shù)為0.789、0.00491,選育群體F3代、F4代相應(yīng)參數(shù)分別為0.699、0.00355,0.607、0.00332。單倍型多樣度顯示,野生群體含有12個(gè)單倍型,特有單倍型7個(gè),均高于養(yǎng)殖群體相應(yīng)參數(shù)。在109個(gè)樣本D-loop區(qū)的788bp片段中,共檢測到33個(gè)變異位點(diǎn),大黃魚野生群體YS含29個(gè)變異位點(diǎn),繁育群體FY含20個(gè),選育群體F3代18個(gè)、F4代14個(gè),遺傳多樣性指數(shù)分析結(jié)果顯示,野生群體單倍型多樣性指數(shù)(Hd)為0.901,核苷酸多樣性指數(shù)(π)為0.01826,繁育群體相應(yīng)參數(shù)為0.813、0.01778,選育群體F3代、F4代相應(yīng)參數(shù)分別為0.677、0.01391,0.727、0.1471。單倍型多樣度顯示野生群體含有15個(gè)單倍型,特有單倍型11個(gè),同樣高于養(yǎng)殖群體單倍型多樣度。由結(jié)果可知,大黃魚野生群體遺傳多樣性水平高于養(yǎng)殖群體。根據(jù)遺傳分化指數(shù)Fst值以及分子方差分析(AMOVA)可知,大黃魚遺傳變異主要來自群體內(nèi)個(gè)體之間,養(yǎng)殖群體內(nèi)部遺傳分化并不顯著,而大黃魚野生群體與養(yǎng)殖群體兩個(gè)組群間出現(xiàn)了顯著的中等水平遺傳分化,UPGMA系統(tǒng)進(jìn)化樹和單倍型網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖也支持這一觀點(diǎn)。由于D-loop區(qū)不編碼蛋白質(zhì),突變位點(diǎn)較多,進(jìn)化速率快更加適用于遺傳差異不顯著的種內(nèi)群體間,因此是大黃魚種質(zhì)鑒定中可靠的分析位點(diǎn)。(4)選用12對微衛(wèi)星(SSR)標(biāo)記對官井洋采捕的大黃魚野生群體YS和2005年從官井洋采捕的野生大黃魚經(jīng)過人工世代選育的F3代、F4代,以及繁育群體FY進(jìn)行了比較研究,結(jié)果表明,12個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)目范圍為4~10,平均觀測雜合度(HO),期望雜合度(HE)和多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.745,0.753和0.691,所選位點(diǎn)表現(xiàn)出高度多態(tài)性,其中含1個(gè)群體間特異性位點(diǎn)LYC08。野生群體YS觀測雜合度(H_O=0.791)、期望雜合度(H_E=0.776)和shannon指數(shù)(I=1.674),繁育群體FY、選育群體F3代、F4代相應(yīng)參數(shù)分別為0.744、0.764、1.552;0.728、0.736、1.483;0.717、0.735、1.401,表明野生群體具有較高的遺傳多樣性水平。近交系數(shù)結(jié)果顯示F_(IS)最高值出現(xiàn)在F4代群體(F_(IS)=0.019),其次為F3代群體(F_(IS)=0.013)、繁育群體FY(F_(IS)=0.011),3個(gè)人工養(yǎng)殖群體中均存在雜合子缺失現(xiàn)象。分子方差分析(AMOVA)表明野生群體與養(yǎng)殖群體組間的遺傳差異極顯著(P0.01)�；贜ei’s遺傳距離構(gòu)建的NJ樹、主成分分析(PCA)以及STRUCTURE遺傳聚類分析表明野生群體YS與繁育群體FY、選育群體F3代、F4代間均有較遠(yuǎn)的親緣關(guān)系。
【學(xué)位授予單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S917.4

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2568394