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一株傳染性胰腺壞死病毒基因組序列分析及反向遺傳操作系統(tǒng)的建立

發(fā)布時(shí)間:2019-11-22 16:05
【摘要】:傳染性胰腺壞死病(Infectious Pancreatic Necrosis,IPN)是由傳染性胰腺壞死病毒(Infectious Pancreatic Necrosis Virus,IPNV)引起的一種主要危害鮭鱒魚苗的高致死性疾病。自上世紀(jì)八十年代傳入中國至今仍沒有有效的防控藥物,而由于毒株存在變異及安全因素,國外商品化疫苗無法直接引進(jìn)及應(yīng)用。本課題組于2013年IPN暴發(fā)期間在中國云南省某虹鱒養(yǎng)殖場分離到一株IPNV強(qiáng)毒(命名為ChRtm213)。本文對該毒株的全基因組序列進(jìn)行了測定與分析,并在此基礎(chǔ)上利用反向遺傳操作技術(shù)構(gòu)建了重組IPNV病毒(rChRtm213)。本研究對全面了解IPNV的結(jié)構(gòu)與功能、揭示IPNV致病與免疫的分子機(jī)制等相關(guān)的研究具有重要意義。本研究利用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法,從IPNV-ChRtm213細(xì)胞培養(yǎng)物的總RNA中獲得了ChRtm213基因組片段并進(jìn)行了序列測定,與GenBank中IPNV序列進(jìn)行了比對,并運(yùn)用軟件對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。序列分析結(jié)果表明,ChRtm213毒株的全基因組序列包含一個(gè)A鏈(3099 bp)編碼多聚蛋白VP2-VP4-VP3,和一個(gè)B鏈(2789 bp)編碼一個(gè)RNA依賴的RNA聚合酶VP1蛋白。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,ChRtm213屬于基因1型,血清型為A9(Jasper),和日本IPNV毒株AM98具有最高的同源性,其中A鏈與B鏈相似性分別為96.3%和97.3%。本研究通過In-Fusion無縫連接的方法成功構(gòu)建了以T7 RNA聚合酶介導(dǎo)的IPNV高效反向遺傳操作系統(tǒng)。分別在ChRtm213株A、B鏈上引入分子沉默性標(biāo)簽并將其克隆在真核表達(dá)載體(NDV vector)的T7啟動(dòng)子下游,構(gòu)建了ChRtm213-NDV-A和ChRtm213-NDV-B重組質(zhì)粒,然后通過LipofectamineTM2000(Invitrogen)介導(dǎo),與表達(dá)T7RNA聚合酶的真核表達(dá)載體共轉(zhuǎn)染CHSE-214細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后96 h利用新的單層CHSE-214繼續(xù)擴(kuò)增。通過噬斑純化鑒定、電鏡觀察、間接免疫熒光檢測、酶切分子標(biāo)簽檢測證明了重組IPNV的存在。本研究成功構(gòu)建了IPNV高效反向遺傳操作系統(tǒng)。該系統(tǒng)具有穩(wěn)定、簡便等特點(diǎn),能在CHSE-214上高效獲得重組病毒。
【學(xué)位授予單位】:上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S943

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2564546

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