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陸地棉棉籽油分與蛋白質(zhì)含量QTL定位

發(fā)布時(shí)間:2019-09-16 11:17
【摘要】:棉花是世界上最重要的纖維經(jīng)濟(jì)作物,其副產(chǎn)物棉籽具有較高含量的蛋白質(zhì)和脂肪,是重要的油料和動(dòng)物飼料蛋白來(lái)源。陸地棉產(chǎn)生的原棉超過(guò)全世界總產(chǎn)量的95%,為現(xiàn)今種植面積最大的棉花栽培品種。棉籽油富含人體所必需的脂肪酸,特別是亞油酸。棉籽也被視為蛋白質(zhì)的重要來(lái)源之一,其幾乎涵蓋了所有氨基酸。由于棉籽油分含量和蛋白質(zhì)含量是受多基因控制的數(shù)量性狀,易受環(huán)境影響,且異源四倍體陸地棉基因組結(jié)構(gòu)復(fù)雜,現(xiàn)通過(guò)傳統(tǒng)育種的手段改良陸地棉的油分和蛋白質(zhì)含量十分困難。分子標(biāo)記技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展,為棉花的分子育種提供了重要的技術(shù)保障。高密度遺傳圖譜是進(jìn)行數(shù)量性狀QTL定位和圖位克隆等后續(xù)研究的基礎(chǔ)。但由于陸地棉遺傳基礎(chǔ)狹窄,DNA標(biāo)記的多態(tài)性較低,目前所公布出來(lái)的陸地棉種Qg遺傳圖譜標(biāo)記位點(diǎn)數(shù)較少,QTL檢測(cè)效率低,標(biāo)記間平均距離較大,難以滿足圖位克隆和分子標(biāo)記輔助育種的需求。因此,構(gòu)建高密度的遺傳連鎖圖譜以及定位棉花油份和蛋白含量等性狀QTL尤為重要。本研究利用根據(jù)雷蒙德式棉參考基因組序列設(shè)計(jì)的12560對(duì)SSR引物,對(duì)(渝棉1號(hào)×M11)F2:7重組近交系群體遺傳連鎖圖譜進(jìn)行了標(biāo)記加密,并對(duì)棉籽油分和蛋白質(zhì)含量進(jìn)行了QTL定位,主要結(jié)果如下:1.油分和蛋白質(zhì)含量在2015和2016年2個(gè)環(huán)境下,M11的油分含量比渝棉1號(hào)高9.82%;渝棉1號(hào)的蛋白質(zhì)含量比M11高1.18%。重組近交系群體的油分含量和蛋白質(zhì)含量分布范圍較大,且超親分離,呈連續(xù)分布趨勢(shì)。相關(guān)性分析表明,油分含量和蛋白質(zhì)含量呈極顯著的負(fù)相關(guān)。2.SSR引物多態(tài)性及重組近交系群體基因型檢測(cè)利用雷蒙德式棉參考基因組序列設(shè)計(jì)的12560對(duì)SSR引物,篩選親本渝棉1號(hào)與M11,共獲得497對(duì)多態(tài)性引物,多態(tài)性比例為3.96%。再用此多態(tài)性引物檢測(cè)(渝棉1號(hào)×M11)重組近交系群體的標(biāo)記基因型,共獲得501個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)。對(duì)新獲得的501個(gè)SSR標(biāo)記和實(shí)驗(yàn)室前期獲得的577個(gè)SSR標(biāo)記進(jìn)行c2檢測(cè),共有220個(gè)位點(diǎn)偏離1:1孟德?tīng)柗蛛x比(P0.05),偏分離比例為20.4%。其中,97個(gè)標(biāo)記偏向中渝棉1號(hào)(44.1%),123個(gè)標(biāo)記偏向M11(55.9%)。3.遺傳圖譜對(duì)1078個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)進(jìn)行遺傳連鎖分析,所構(gòu)建出來(lái)的圖譜包含1025個(gè)標(biāo)記位點(diǎn),覆蓋3446.5 cM,標(biāo)記間平均距離為3.36 cM。其中,At亞組包含366個(gè)位點(diǎn),重組長(zhǎng)度1631.1 cM,標(biāo)記間平均距離為4.46 cM;Dt亞組包含659個(gè)標(biāo)記位點(diǎn),重組長(zhǎng)度1815.4 cM,標(biāo)記間平均距離為2.75 cM。4.油分含量和蛋白質(zhì)含量QTL利用加密后的遺傳連鎖圖譜以及油分和蛋白質(zhì)含量數(shù)據(jù),一共檢測(cè)到8個(gè)油分含量QTL和6個(gè)蛋白質(zhì)含量QTL。8個(gè)油分含量QTL分布于8條染色體上,解釋表型變異10.7%-48.2%;6個(gè)蛋白質(zhì)含量QTL分布于5條染色體上,解釋表型變異11.1%-38.3%。其中,qOC17.1、qPC08.1和qPC17.1在2年環(huán)境中都被檢測(cè)到,為穩(wěn)定QTL。
【圖文】:

渝棉1號(hào),引物,親本,多態(tài)性


圖 4-3 SWU 引物在親本渝棉 1 號(hào)和 M11 間的多態(tài)性Figure 4-3 The polymorphism of SWU primers between Yumian1 and M11Marker:標(biāo)準(zhǔn)分子量 DNA;P1:渝棉 1 號(hào);P2:M11Marker: DNAmarker; P1:Yumian 1; P2: M11表 4-4 SSR 引物在親本間的多態(tài)性Table4-4 The polymorphism of SSR primers in parents引物名稱Primer name引物數(shù)目Primer pairs多態(tài)性引物對(duì)數(shù)Polymorphic primers多態(tài)性引物比例Polymorphic primer ratioBNL 592 63 10.64%DPL 838 71 8.47%COT 60 4 6.67%Gh 632 38 6.03%CGR 1133 69 6.01%SHIN 274 15 5.47%DC 423 21 4.96%

群體,引物,重組近交系,標(biāo)記基因


第 4 章 結(jié)果與分析4.3 重組近交系群體標(biāo)記基因型檢測(cè)利用新獲得的 497 對(duì)多態(tài)性引物對(duì)(渝棉 1 號(hào)×M11)F2:7重組近交系群體進(jìn)行標(biāo)記基因型檢測(cè)(圖 4-4),共獲得 501 個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),其中 4 對(duì)引物檢測(cè)出雙位點(diǎn)。加上實(shí)驗(yàn)室前期檢測(cè)的位點(diǎn),,共獲得 1078 個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】:西南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S562

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2536155

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