【摘要】：油菜是重要的油料作物,在世界范圍內(nèi)廣泛種植,也是我國主要的油料作物之一。濕害嚴(yán)重影響了油菜的產(chǎn)量和品質(zhì)。前人已經(jīng)做了許多關(guān)于油菜耐濕性的研究,但主要是針對其耐濕機制和生理反應(yīng)的研究,關(guān)于油菜耐濕性相關(guān)基因的研究相對較少。本研究以246份甘藍(lán)型油菜品種(系)為研究群體,首先結(jié)合油菜60K Illumina Infinium SNP芯片分析材料的群體結(jié)構(gòu)、親緣關(guān)系和連鎖不平衡衰減;其次,結(jié)合篩選出的24062個SNP標(biāo)記對地上部鮮重、根鮮重、鮮重根冠比、地上部干重、根干重、干重根冠比、綠葉數(shù)、植株含水量8個生長指標(biāo)和丙二醛含量、可溶性糖含量、可溶性蛋白含量、SOD活性、POD活性5個生理性狀在兩種水分條件下的差值進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,根據(jù)檢測出的顯著關(guān)聯(lián)SNP位點所在的候選區(qū)間及功能注釋預(yù)測候選基因。主要結(jié)果如下:1.甘藍(lán)型油菜苗期耐濕相關(guān)性狀的表型變異:在研究群體中,13個性狀差值都存在廣泛的表型變異,表現(xiàn)出典型的數(shù)量性狀特點。濕害脅迫處理后,根鮮重、根干重、根冠比、POD活性、可溶性糖含量和丙二醛含量的平均值都有所升高;而綠葉數(shù)、地上部鮮重、地上部干重、植株含水量及SOD活性、可溶性蛋白含量的平均值都有不同程度的降低。2.群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系分析:246份試驗材料被劃分為P1和P2兩個類群。其中P1包含111份(約45%)材料,其余材料為P2類群。群體內(nèi)有56.16%的任意兩份材料之間的親緣關(guān)系值為0,約有20%的任意兩份材料之間的親緣關(guān)系值介于0~0.1之間,表明群體中大部分材料之間沒有親緣關(guān)系或者親緣關(guān)系較弱,對關(guān)聯(lián)分析的影響較小。3.連鎖不平衡分析:全基因組及亞基因組的LD(r2)均隨物理距離的增加而下降,但衰減程度不同。C亞基因組的衰減比A亞基因組的衰減慢,全基因組的衰減則介于兩者之間。當(dāng)r2的閾值為0.2時,全基因組的衰減距離為600kb,A、C亞基因組的衰減距離分別為300kb和800kb。4.耐濕相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析:通過比較QQ圖下各個模型的分析結(jié)果,選擇最優(yōu)模型進(jìn)行關(guān)聯(lián)位點檢測。共檢測到15個SNP位點,分布于不同的染色體上,可解釋的遺傳變異均在10%左右。其中與丙二醛含量、POD活性和根干重相關(guān)的標(biāo)記位點各有2個,可溶性蛋白含量沒有檢測到位點,其余9個性狀各檢測到1個位點。5.耐濕性候選基因預(yù)測:將檢測到的顯著相關(guān)SNP位點所在的LD區(qū)間與法國甘藍(lán)型油菜基因組進(jìn)行對比,并借助擬南芥基因注釋信息,篩選獲得37個與耐濕性相關(guān)的基因。這些基因中有6個與植物內(nèi)源激素的平衡調(diào)節(jié)有關(guān),12個與逆境蛋白形成有關(guān),9個與活性氧代謝途徑有關(guān),其余為轉(zhuǎn)錄因子。
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圖片說明： 第 4 章 結(jié)果與分析第 4 章 結(jié)果與分析4.1 表型數(shù)據(jù)分析4.1.1 兩種水分條件下甘藍(lán)型油菜的外觀表現(xiàn)從圖 1 中可以看出，正常灌溉組的植株長勢旺盛，葉片數(shù)量多，顏色深綠且面積大；而濕害脅迫組的植株與正常灌溉相比，株高較低、莖稈偏細(xì)，，葉片數(shù)較少且葉片薄而發(fā)黃，底部有部分葉片脫落。
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圖片說明：濕害脅迫和正常灌溉下苗期性狀差值
【學(xué)位授予單位】：西南大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S565.4

【參考文獻(xiàn)】

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