基于線粒體控制區(qū)序列的中國沿海褐藍(lán)子魚遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2019-01-22 14:27
【摘要】:褐藍(lán)子魚(Siganus fuscescens)隸屬硬骨魚綱(Osteichthyes)輻鰭亞綱(Actinopterygii)鱸形目(Perciformes)刺尾魚亞目(Acanthuroidei)藍(lán)子魚科(Siganidae),刺少肉嫩,味道鮮美,花紋絢麗,具有較高的食用價(jià)值和觀賞價(jià)值,在中國華南地區(qū)、新加坡、菲律賓及其它東南亞國家相當(dāng)暢銷,極具人工養(yǎng)殖潛力。近年來受過度捕撈與環(huán)境污染等影響,中國野生褐藍(lán)子魚資源急劇下降,亟待采取有效保護(hù)與合理利用措施。遺傳多樣性是物種保護(hù)和開發(fā)利用的物質(zhì)基礎(chǔ),為此本文測定了浙江溫州,福建寧德和平潭,廣東汕頭、閘坡、硇州島、合浦、烏石,海南潭門、陵水、新盈和東方,以及廣西合浦等12個(gè)群體線粒體DNA控制區(qū)序列以分析遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu),旨在了解中國近海褐藍(lán)子魚遺傳多樣性的空間分布格局和種群歷史動(dòng)態(tài)等,為種質(zhì)資源的保護(hù)和開發(fā)利用提供科學(xué)依據(jù)。研究結(jié)果如下:1)在全部297尾標(biāo)本741bp線粒體控制區(qū)序列中,變異位點(diǎn)92個(gè),簡約信息位點(diǎn)62個(gè),分別占序列核苷酸總數(shù)的12.42%和8.37%。中國近海褐藍(lán)子魚總體呈現(xiàn)高單倍型多樣性(Hd=0.926±0.005)和低核苷酸多樣性(π=0.017±0.023)的特點(diǎn),其中遺傳多樣性最低的是汕頭(Hd=0.917±0.024,π=0.007±0.0129),其次是閘坡群體(Hd=0.867±0.029,π=0.009±0.0165);遺傳多樣性最高的是合浦(Hd=0.956±0.017,0.022±0.0212),其次是潭門群體(Hd=0.917±0.024,π=0.022±0.0024)。2)在鄰接樹和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖中,出現(xiàn)2個(gè)組群3個(gè)分支,每個(gè)組群和分支均有混雜不同地理來源的個(gè)體,推測組群間的分歧時(shí)間為72.6~21.8萬年前,分支間分歧時(shí)間為:Clade A與Clade B分支間的分歧時(shí)間為49.48~14.84萬年前,Clade A與Clade C之間以及Clade B與Clade C之間的分歧時(shí)間均為83.22~24.97萬年前,均在中更新世時(shí)期,可能是受到了更新世冰期循環(huán)的影響。3)就總體種群分化而言,中度分化出現(xiàn)在汕頭群體與硇洲島、寧德群體之間(FST:0.112~0.134且0.01P0.05,Nm:3.234~3.965)。汕頭群體與除平潭和新盈外的其余9個(gè)群體間存在的輕度而顯著分化(FST:0.039~0.134,0.01P0.05);閘坡群體則與寧德、平潭、汕頭、硇州島、潭門、陵水和合浦等7個(gè)群體間同樣存在輕度而顯著的分化(FST:0.039~0.100,0.01P0.05)。至于Clade A,中度分化出現(xiàn)在合浦與東方2個(gè)群體之間(FST=0.120且P0.05,Nm=3.67);輕度分化均出現(xiàn)在寧德群體與平潭、汕頭、硇洲島3個(gè)群體(FST:0.052~0.091,Nm:5.02~9.08);閘坡群體與平潭、汕頭及硇洲島3群體之間均存在輕微分化(FST:0.009~0.073且0.01P0.05);閘坡與合浦、平潭、硇洲島3個(gè)群體間出現(xiàn)低度分化(FST:0.060~0.091且P0.05);合浦與溫州、硇洲島、潭門3個(gè)群體(FST:0.008~0.120,P0.5)也出現(xiàn)低度分化。這些分化可能受到臺(tái)灣海峽、瓊州海峽、珠江沖淡水,中國近岸流和南海暖流以及褐藍(lán)子魚獨(dú)特的生理生態(tài)特征的共同影響所致。4)將中國近海褐藍(lán)子魚作為一個(gè)整體、2個(gè)組群與3個(gè)分支分別進(jìn)行中性檢驗(yàn)、不配對(duì)分析和R2檢測,結(jié)果均顯示經(jīng)歷了種群擴(kuò)張,整體擴(kuò)張時(shí)間分別為15.23~4.57萬年前,組群1和組群2的擴(kuò)張時(shí)間分別為10.85~3.26萬年前、8.153~2.446萬年前,分支A和分支C分支擴(kuò)張時(shí)間分別為14.19~4.26萬年前、8.15~2.44萬年前,可能是更新世冰后期海平面上升,主要在近海生活的褐藍(lán)子魚棲息生境因海侵而擴(kuò)張所致。5)基于不同地理群體間的遺傳分化與遺傳多樣性,建議優(yōu)先保護(hù)合浦群體與潭門群體,以及汕頭群體和閘坡群體。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:暨南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S917.4
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:暨南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S917.4
【參考文獻(xiàn)】
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1 李淵;張麗艷;王良明;張立;張然;林龍山;高天翔;;臺(tái)灣海峽斑,
本文編號(hào):2413301
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