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  本文關(guān)鍵詞：半滑舌鰨IGF1和IGF2基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《中國海洋大學》 2015年

半滑舌鰨IGF1和IGF2基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性研究

黃政舉  

【摘要】：本文以人工養(yǎng)殖的半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)為實驗對象,對半滑舌鰨IGF1和IGF2基因的多態(tài)性進行檢測,并分析其與激素、生長性狀、血液生理生化指標、基因表達的相關(guān)性。結(jié)果如下：1.雄性半滑舌鰨IGF1基因的SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性分析胰島素樣生長因子1(IGF1)在魚類生長內(nèi)分泌調(diào)節(jié)過程中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。本文探究了雄性半滑舌鰨IGF1基因外顯子的單核苷酸多態(tài)性,并分析了其基因型與生長性狀、血液生化指標及mRNA表達的相關(guān)性。結(jié)果顯示,IGF1基因外顯子5的884bp處一個位點發(fā)生突變,即C884A,此突變發(fā)生于終止密碼子之后,并且發(fā)生在WD40結(jié)構(gòu)域,可能對基因的轉(zhuǎn)錄、表達和生長性狀產(chǎn)生影響。此位點與體重(P0.05)和去內(nèi)臟重(P0.05)呈顯著相關(guān)性,AA基因型的體重和去內(nèi)臟重顯著高于AB基因型(P0.05),AA基因型的尿素含量顯著大于AB基因型(P0.05),AA基因型mRNA表達量也顯著高于AB基因型(P0.01)。研究表明,IGF1基因編碼區(qū)的多態(tài)性對半滑舌鰨生長性狀、血液生化指標和基因表達有顯著影響,可以作為選擇育種的一種分子標記,從遺傳學的角度輔助半滑舌鰨優(yōu)良品種的分子選育,提高半滑舌鰨優(yōu)良品種的產(chǎn)量。2.雌性半滑舌鰨IGFl基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性分析本研究中,運用SSCP和DNA測序方法檢測了雌性半滑舌鰨IGF1基因外顯子的單核苷酸多態(tài)性(SNPs),并分析其基因型與生長性狀及基因表達的相關(guān)性。結(jié)果顯示,雌性IGF1基因突變位點與雄性一致,也是外顯子5的884bp處,即C884A,此突變發(fā)生于終止密碼子之后,并且發(fā)生在WD40結(jié)構(gòu)域,可能對基因的轉(zhuǎn)錄、表達和生長性狀產(chǎn)生影響。此位點與體重(P0.01)和去內(nèi)臟重(P0.01)呈顯著相關(guān)性。與雄性相反,雌性半滑舌鰨個體的AB基因型個體的體重和去內(nèi)臟重顯著高于AA基因型(P0.01),AB基因型的mRNA表達量也顯著高于AA基因型(P0.01)。另外,AB基因型個體在體高、性腺指數(shù)等方面高于AA基因型,但是這種變化無顯著相關(guān)性(P0.05)。這些結(jié)果顯示,IGF1基因編碼區(qū)的多態(tài)性可以作為一類很好分子標記用于遺傳標記輔助選育。3.雌雄性半滑舌鰨IGF2基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性分析在魚類中,類胰島素生長因子2(IGF2)與其生長內(nèi)分泌調(diào)控有關(guān)。研究發(fā)現(xiàn)雄性半滑舌鰨1GF2基因有兩個突變(多態(tài)性1和多態(tài)性2),通過這兩個突變建立了四個二倍型(D1、D2、D3和D4)。但是,多態(tài)性1在翻譯過程中修復(fù)了。多態(tài)性2對于體重(P0.01)、去內(nèi)臟重(P0.01)和肝重(P0.05)有著顯著影響。T檢驗結(jié)果表明,多態(tài)性2的AA基因型個體的體重(P0.01)、去內(nèi)臟重(P0.01)和肝重(P0.05)顯著高于AB基因型。二倍型個體D2和D4的體重(P0.05)、去內(nèi)臟重(P0.01)顯著高于D1。AA基因型個體的總蛋白(TP)顯著高于AB基因型個體(P0.05)。除此以外,AA基因型個體的mRNA表達水平也顯著高于AB基因型個體(P0.01)。二倍型個體D2和D4的相關(guān)表達水平也是顯著高于D1(P0.05)。雌性半滑舌鰨的多態(tài)性位點1與雄性相同,無多態(tài)性位點2。綜上所述,半滑舌鰨IGF2基因編碼區(qū)的多態(tài)性的研究表明,雄性IGF2基因的SNP與生長性狀、血液生化和基因表達顯著相關(guān),本研究對于魚類生長分子生物學的研究具有一定的參考價值。

【關(guān)鍵詞】：
【學位授予單位】：中國海洋大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：S917.4
【目錄】：

摘要5-7

Abstract7-13

引言13-15

第一章 文獻綜述15-24

1 半滑舌鰨的簡介15-16

1.1 半滑舌鰨的生物學特性15

1.2 半滑舌鰨的研究現(xiàn)狀15-16

2 分子標記及其檢測方法16-19

2.1 分子標記的研究16-17

2.2 SNP的研究及檢測方法17-19

3 基因SNP與生長和表達的研究19-21

3.1 IGF1和IGF2基因的結(jié)構(gòu)和功能19-20

3.2 魚類IGF1基因SNP與生長和表達相關(guān)性20

3.3 魚類IGF1基因SNP與生長和表達的相關(guān)性20-21

4 魚類血液生理生化的研究21-22

4.1 魚類的血液生理生化指標21

4.2 魚類的血液生理生化的影響因素21-22

4.3 基因多態(tài)性與血液生理生化相關(guān)性的研究進展22

5 本研究的立項依據(jù)與研究意義22-24

第二章 雄性半滑舌鰨IGF1基因的SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性分析24-37

1 材料和方法25-29

1.1 材料25

1.2 方法25-29

1.3 統(tǒng)計學分析29

2 結(jié)果29-34

2.1 DNA提取及純度檢測29

2.2 PCR檢測結(jié)果29-30

2.3 PCR-SSCP檢測30

2.4 各基因型序列30-31

2.5 突變位點的基因結(jié)構(gòu)31

2.6 基因型和性狀的相關(guān)性分析31-33

2.7 血液生理生化與性狀的相關(guān)性分析33

2.8 基因的表達和相關(guān)性分析33-34

3 討論34-36

4 小結(jié)36-37

第三章 雌性半滑舌鰨IGF1基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性分析37-45

1 材料和方法37-38

1.1 材料37

1.2 方法37-38

1.3 統(tǒng)計學分析38

2 結(jié)果38-43

2.1 DNA提取及純度檢測38

2.2 PCR擴增38-39

2.3 PCR-SSCP檢測39-40

2.4 各基因型序列40

2.5 突變位點的基因結(jié)構(gòu)40-41

2.6 基因型和性狀的相關(guān)性分析41-42

2.7 表達結(jié)果42-43

3 討論43-44

4 小結(jié)44-45

第四章 雌雄性半滑舌鰨IGF2基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性分析45-60

1 材料和方法46-47

1.1 材料46

1.2 方法46-47

1.3 統(tǒng)計學分析47

2 結(jié)果47-56

2.1 DNA提取及純度檢測47-48

2.2 瓊脂糖檢測結(jié)果48

2.3 IGF2基因編碼區(qū)域的多態(tài)性48-50

2.4 基因型頻率和二倍體基因型頻率50-51

2.5 多態(tài)性與生長性狀的相關(guān)性51-54

2.6 基因型與血液生化指標的關(guān)系54

2.7 不同基因型的mRNA 的表達情況54-56

2.8 不同基因型的DNA和cDNA序列比較56

3 討論56-59

4 小結(jié)59-60

參考文獻60-71

附錄71-72

致謝72-73

個人簡歷73

發(fā)表學術(shù)論文73

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【參考文獻】

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5 鄭媛;半滑舌鰨（Cynoglossus semilaevis）細胞培養(yǎng)及細胞系建立研究[D];中國海洋大學;2012年

6 邵長偉;半滑舌鰨（Cynoglossus semilaevis）性別決定的基因組學研究[D];中國海洋大學;2012年

7 吳瑩瑩;半滑舌鰨精子發(fā)生及其受精過程[D];中國海洋大學;2008年

8 莊志猛;半滑舌鰨早期發(fā)育生物學與種質(zhì)資源研究[D];中國海洋大學;2006年

9 姜黎明;半滑舌鰨遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及染色體定位的初步研究[D];中國海洋大學;2013年

10 陳彩芳;四種細胞色素P450酶在半滑舌鰨繁殖生理機能中的作用研究[D];中國海洋大學;2010年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 趙敏;飼料中不同水平牛磺酸和磷蝦粉對半滑舌鰨繁殖性能及后代質(zhì)量的影響[D];上海海洋大學;2015年

2 邢賀飛;半滑舌鰨抗病相關(guān)SNP標記的篩選及兩種免疫相關(guān)基因的克隆與初步分析[D];上海海洋大學;2015年

3 吳婭紅;半滑舌鰨LGR8基因克隆和CSW3基因的功能驗證[D];上海海洋大學;2015年

4 修旺珊;半滑舌鰨DKKL-1基因的克隆與表達分析[D];大連海洋大學;2015年

5 向晉松;半滑舌鰨補體調(diào)控因子I的鑒定、重組表達、功能分析及C3-1基因的初步研究[D];上海海洋大學;2015年

6 宋超;半滑舌鰨性別分化的遺傳特性研究[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學;2015年

7 史學營;養(yǎng)殖半滑舌鰨無眼側(cè)黑化機制的初步研究[D];上海海洋大學;2015年

8 劉田田;半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis）R-spondin1和R-spondin3基因的克隆與表達分析[D];中國海洋大學;2015年

9 楊芳;半滑舌鰨（Cynoglossus semilaevis）R-spondin2基因的分子克隆、表達模式及其在肌肉發(fā)育過程中功能的初步探究[D];中國海洋大學;2015年

10 黃政舉;半滑舌鰨IGF1和IGF2基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性研究[D];中國海洋大學;2015年

  本文關(guān)鍵詞：半滑舌鰨IGF1和IGF2基因SNP與mRNA表達和生長性狀的相關(guān)性研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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