本文關(guān)鍵詞：蝦夷扇貝（Patinopecten yessoensis）MAPKK基因家族結(jié)構(gòu)及表達(dá)分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《中國(guó)海洋大學(xué)》 2015年

蝦夷扇貝（Patinopecten yessoensis）MAPKK基因家族結(jié)構(gòu)及表達(dá)分析

鄒佳君  

【摘要】：有絲分裂原活化蛋白激酶MAPK(Mitogen-activated protein kinase)信號(hào)通路將細(xì)胞外刺激逐級(jí)傳遞至細(xì)胞內(nèi)部,誘導(dǎo)產(chǎn)生一系列的細(xì)胞反應(yīng),調(diào)控細(xì)胞活動(dòng)和免疫反應(yīng)。MKK將上游MKKK信號(hào)整合傳遞至下游MAPK,被認(rèn)為是MAPK信號(hào)通路的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。本文利用生物信息技術(shù)對(duì)蝦夷扇貝MKK基因進(jìn)行了基因組和轉(zhuǎn)錄組篩查,并對(duì)其系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系進(jìn)行了分析。研究結(jié)果表明,蝦夷扇貝基因組共含有5個(gè)MKK基因(PyMKK),其中PyMKK5含有特殊的Gln重復(fù),同一MKK在物種間的保守性高于同一物種內(nèi)不同MKK家族成員間的保守性；在蝦夷扇貝胚胎幼蟲(chóng)各發(fā)育階段、成體各組織中均檢測(cè)到5個(gè)PyMKK基因的表達(dá)；細(xì)菌脅迫后,蝦夷扇貝血細(xì)胞中5個(gè)PyMKK基因的表達(dá)量均發(fā)生顯著改變,部分基因間的表達(dá)量變化呈顯著相關(guān)。主要研究結(jié)果如下：1蝦夷扇貝,MKK基因家族結(jié)構(gòu)分析本研究通過(guò)全面篩查蝦夷扇貝基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),獲得蝦夷扇貝MKK家族全部基因,包括五個(gè)成員,PyMKK1/2, PyMKK4, PyMM5, PyMK3/6和PyMKK7,其開(kāi)放閱讀框(Open reading frames, ORF)分別為1206,1143,1401,]107和927 bp,分別編碼401,380,466,368和308個(gè)氨基酸：理論分子量分別為44.40,43.69,53.21,41.69和35.21 kDa；等電點(diǎn)p1分別為6.35,6.28,5.44,7.05和8.20。進(jìn)化分析和蛋白分析結(jié)果表明：PyMKK與其它軟體動(dòng)物MKK聚類為單獨(dú)亞支,其次與其它無(wú)脊椎動(dòng)物MKK聚類。MKK在物種間的保守性高于家族間成員的保守性。PyMKK在結(jié)構(gòu)上也高度保守,相關(guān)的保守功能位點(diǎn)包括：MAPK對(duì)接位點(diǎn),PyMKK1含2個(gè),PyMKK4含2個(gè),PyMKK5含1個(gè),PyMKK3/6含1個(gè),PyMKK7含1個(gè);14-3-3蛋白家族作用結(jié)構(gòu)域,PyMKK1/2含4個(gè),PyMKK5含1個(gè),PyMKK3/6含1個(gè)。功能結(jié)構(gòu)保守的結(jié)構(gòu)基元包括：GxGxxGxV結(jié)構(gòu)基元,包裹ATP的α、γ-磷酸基團(tuán)；亞結(jié)構(gòu)序列HRD KxxN,催化環(huán)內(nèi)提供質(zhì)子受體,螯合Mg2+;VAIVK, DFG和APE基元,調(diào)控ATP反應(yīng)和MKK結(jié)合；MKK5特有的PB1(Phox and Beml)結(jié)構(gòu)域,介導(dǎo)蛋白間的二聚化實(shí)現(xiàn)信號(hào)傳遞。2蝦夷扇貝MKK時(shí)空表達(dá)及其在細(xì)菌脅迫后的表達(dá)變化分析蝦夷扇貝MKK在胚胎及幼蟲(chóng)發(fā)育時(shí)期呈現(xiàn)出三種表達(dá)模式,在殼頂幼蟲(chóng)至眼點(diǎn)幼蟲(chóng)的變態(tài)時(shí)期,PyMKX的表達(dá)水平均相對(duì)較低。在成體蝦夷扇貝各組織中,PyMKK在外套膜,鰓絲,肉柱和血細(xì)胞的表達(dá)量較高,在肝胰腺,性腺,足和眼呈現(xiàn)低表達(dá)。在藤黃微球菌和鰻弧菌脅迫侵染后,pyMKK呈現(xiàn)表達(dá)水平變化,在鰻弧菌侵染下的變化相比藤黃微球菌更為明顯,但在細(xì)菌侵染的急性期的表達(dá)模式相似,變化差異主要表現(xiàn)在侵染后24h,表明其在扇貝免疫反應(yīng)方面可能發(fā)揮作用。研究成果豐富了對(duì)海洋貝類MKK及MAPK信號(hào)通路的認(rèn)識(shí),為深入研究MKK在貝類免疫反應(yīng)中的作用機(jī)制打下了基礎(chǔ)。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S917.4
【目錄】：

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