化學(xué)空間分析軟件與Web開發(fā)及其在NA抑制劑設(shè)計(jì)中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-03-31 09:34
隨著藥物篩選技術(shù)的發(fā)展,藥物研發(fā)數(shù)據(jù)呈指數(shù)級增長,涉及到分子結(jié)構(gòu)、活性、理化性質(zhì)、毒性、靶點(diǎn)、基因和信號通路等多維度的信息。這些醫(yī)藥大數(shù)據(jù)所分布的化學(xué)空間和維度越來越大,給藥物數(shù)據(jù)分析和可視化帶來了巨大的機(jī)遇和挑戰(zhàn)。為了從這些化學(xué)空間里面找到藥物研究的活性小分子,需要采用多種分析和可視化手段,從不同的角度,聚焦到更小空間來進(jìn)行研究。因此本論文開發(fā)了化學(xué)空間分析與可視化工具來輔助藥物設(shè)計(jì)。具體的研究內(nèi)容如下:(1)化學(xué)空間分析與可視化軟件和Web開發(fā)基于開源的HighCharts和vis.js圖表插件,根據(jù)化學(xué)空間分析的需求,開發(fā)可顯示化學(xué)信息的Python可視化工具包easyHighcharts和easyVisjs;基于以上可視化工具和RDKit,開發(fā)模塊化的化學(xué)空間分析Python工具包pyChemspace,以實(shí)現(xiàn)化合物庫理化性質(zhì)、分子結(jié)構(gòu)和片段信息的分析與可視化;為進(jìn)一步降低藥物研發(fā)者分析化學(xué)空間的門檻,加快數(shù)據(jù)分析的效率,基于以上研究,開發(fā)了化學(xué)空間交互式分析與可視化Web服務(wù)器IChemSpace(http://mwxiao.com/ichemspace)。(2)流感神經(jīng)氨酸...
【文章來源】:湖南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:176 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
現(xiàn)有的化學(xué)空間大小呈指數(shù)級增長
藥物發(fā)現(xiàn)與開發(fā)中常見的化學(xué)反應(yīng)類型如表1.4,總結(jié)了近年來出現(xiàn)的一些虛擬化學(xué)空間資源
COX-1/COX-2抑制活性(2)氣泡圖
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]含噻唑環(huán)或哌嗪環(huán)的酰胺衍生物的合成與NA抑制活性研究[D]. 崔滿營.湖南大學(xué) 2019
本文編號:3111210
【文章來源】:湖南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:176 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
現(xiàn)有的化學(xué)空間大小呈指數(shù)級增長
藥物發(fā)現(xiàn)與開發(fā)中常見的化學(xué)反應(yīng)類型如表1.4,總結(jié)了近年來出現(xiàn)的一些虛擬化學(xué)空間資源
COX-1/COX-2抑制活性(2)氣泡圖
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]含噻唑環(huán)或哌嗪環(huán)的酰胺衍生物的合成與NA抑制活性研究[D]. 崔滿營.湖南大學(xué) 2019
本文編號:3111210
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/xxkjbs/3111210.html
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