化學空間分析軟件與Web開發(fā)及其在NA抑制劑設計中的應用
發(fā)布時間:2021-03-31 09:34
隨著藥物篩選技術的發(fā)展,藥物研發(fā)數據呈指數級增長,涉及到分子結構、活性、理化性質、毒性、靶點、基因和信號通路等多維度的信息。這些醫(yī)藥大數據所分布的化學空間和維度越來越大,給藥物數據分析和可視化帶來了巨大的機遇和挑戰(zhàn)。為了從這些化學空間里面找到藥物研究的活性小分子,需要采用多種分析和可視化手段,從不同的角度,聚焦到更小空間來進行研究。因此本論文開發(fā)了化學空間分析與可視化工具來輔助藥物設計。具體的研究內容如下:(1)化學空間分析與可視化軟件和Web開發(fā)基于開源的HighCharts和vis.js圖表插件,根據化學空間分析的需求,開發(fā)可顯示化學信息的Python可視化工具包easyHighcharts和easyVisjs;基于以上可視化工具和RDKit,開發(fā)模塊化的化學空間分析Python工具包pyChemspace,以實現化合物庫理化性質、分子結構和片段信息的分析與可視化;為進一步降低藥物研發(fā)者分析化學空間的門檻,加快數據分析的效率,基于以上研究,開發(fā)了化學空間交互式分析與可視化Web服務器IChemSpace(http://mwxiao.com/ichemspace)。(2)流感神經氨酸...
【文章來源】:湖南大學湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:176 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
現有的化學空間大小呈指數級增長
藥物發(fā)現與開發(fā)中常見的化學反應類型如表1.4,總結了近年來出現的一些虛擬化學空間資源
COX-1/COX-2抑制活性(2)氣泡圖
【參考文獻】:
碩士論文
[1]含噻唑環(huán)或哌嗪環(huán)的酰胺衍生物的合成與NA抑制活性研究[D]. 崔滿營.湖南大學 2019
本文編號:3111210
【文章來源】:湖南大學湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:176 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
現有的化學空間大小呈指數級增長
藥物發(fā)現與開發(fā)中常見的化學反應類型如表1.4,總結了近年來出現的一些虛擬化學空間資源
COX-1/COX-2抑制活性(2)氣泡圖
【參考文獻】:
碩士論文
[1]含噻唑環(huán)或哌嗪環(huán)的酰胺衍生物的合成與NA抑制活性研究[D]. 崔滿營.湖南大學 2019
本文編號:3111210
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