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文蛤弧菌抗性相關(guān)基因表達(dá)性狀的分析及其遺傳力估計(jì)

發(fā)布時(shí)間:2024-06-04 00:42
  文蛤(Meretrix petechialis)是我國重要的經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖貝類之一。近年來,養(yǎng)殖過程中時(shí)有弧菌病和規(guī)模性死亡的發(fā)生,給文蛤養(yǎng)殖業(yè)帶來了沉重的打擊。這固然與養(yǎng)殖環(huán)境惡化、養(yǎng)殖密度增加等因素有關(guān),但抗性優(yōu)良品種的缺乏也是造成上述問題的重要原因。因此,通過遺傳選育的方式培育抗病、抗逆的文蛤新品系具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。然而,由于抗病性的遺傳機(jī)制非常復(fù)雜,受環(huán)境影響較大以及抗性性狀難以準(zhǔn)確測量等原因,使得貝類抗性選育工作的進(jìn)程十分緩慢。在抗性選育中,遺傳參數(shù)的準(zhǔn)確估計(jì)是制定有效選育策略的前提和基礎(chǔ),而與弧菌抗性顯著相關(guān)的分子標(biāo)記的應(yīng)用,可以加速抗性品系的培育進(jìn)程。本研究通過建立的具有抗性差異的全同胞家系材料,基于文蛤的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),對文蛤的弧菌抗性和免疫基因的表達(dá)性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析,并估計(jì)了基因表達(dá)性狀的遺傳參數(shù),研究結(jié)果將有助于指導(dǎo)文蛤的弧菌抗性選育工作。本研究的主要結(jié)果如下:1、本研究采用RNA-seq技術(shù)檢測了文蛤感染弧菌后的肝胰腺中的基因表達(dá)變化。Illumina測序共獲得了199,318,966條clean reads,進(jìn)一步拼接得到214,577條轉(zhuǎn)錄本,其中,N50長度為...

【文章頁數(shù)】:124 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1.1先天免疫中的TLR信號(hào)通路(Bosch,2013)

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圖1.1先天免疫中的TLR信號(hào)通路(Bosch,2013)1InnateimmunerecognitionbyToll-likereceptor(TLR)si椎動(dòng)物中已經(jīng)被確認(rèn)的TLRs家族成員至少有13。TLRs的胞外段LRR能夠識(shí)別不同的模....


圖1.2補(bǔ)體系統(tǒng)級聯(lián)激活途徑(Stephanetal.,2012)

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圖1.3參與長牡蠣抗逆免疫應(yīng)答途徑的主要基因(Zhangetal.,2016b)

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參與長牡蠣抗逆免疫應(yīng)答途徑的主要基因(Zhangetal.,2016b.3Themajorstress-responsivepathway-relatedgenesinCrassostreagig亡途徑是通過線粒體釋放的凋亡酶激活因子激活Caspase,凋亡....


圖2.2Unigenes的KOG分類Fig2.2ClassificationoftheunigenesannotatedinKOG.

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本文編號(hào):3988621

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