菌群發(fā)育窗口期早期干預對仔豬腸道菌群與腸道先天性免疫系統(tǒng)發(fā)育的影響及機制
發(fā)布時間:2024-02-25 18:48
仔豬早期腹瀉和斷奶應激是嚴重影響?zhàn)B豬生產(chǎn)效益的主要因素,過去幾十年通常用抗生素促生長添加劑(Antibiotic Growth Promoters,AGPs)來控制。隨著飼用抗生素添加劑的禁止使用,如何在飼料無抗的條件下有效預防仔豬腹瀉,緩解仔豬斷奶應激,成為保障養(yǎng)豬生產(chǎn)高效健康發(fā)展亟待解決的重要問題。完善而成熟的免疫系統(tǒng)是宿主抵抗疾病的重要保證。然而,新生仔豬的免疫系統(tǒng)尚未成熟,對病原感染的抵抗力差。仔豬出生后腸道免疫系統(tǒng)的快速發(fā)育與腸道菌群的演替密切相關。在腸道菌群發(fā)育的關鍵“窗口期”實施早期干預,可能是加速菌群演替,從而促進仔豬免疫發(fā)育的重要途徑。本實驗室前期研究發(fā)現(xiàn),將妊娠母豬糞便菌群移植至新生仔豬體內(nèi)能夠調(diào)節(jié)仔豬腸道菌群,增強仔豬腸道屏障功能,從而控制腹瀉促進仔豬生長性能,但尚未闡明具體機制;谀c道菌群的定植具有“先到先留”、“供體-受體相容性”以及“氧氣調(diào)控”等特點,我們假設在仔豬出生后早期,運用糞菌移植聯(lián)合特定的益生菌干預,可能加速腸道菌群的演替和免疫成熟,有利于控制仔豬腹瀉,提高仔豬生長速度。因此,本研究首先運用Meta分析方法,分析了限制益生菌在仔豬生產(chǎn)中效果的影響...
【文章頁數(shù)】:140 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
第一章 文獻綜述
1 前言
2 仔豬腹瀉與斷奶應激
2.1 仔豬腹瀉與調(diào)控
2.2 斷奶應激與調(diào)控
3 豬腸道免疫系統(tǒng)
3.1 腸道免疫系統(tǒng)的組成
3.1.1 先天性免疫系統(tǒng)
3.1.2 獲得性免疫系統(tǒng)
3.2 腸道免疫系統(tǒng)的功能與發(fā)育
3.2.1 先天性免疫系統(tǒng)的功能及發(fā)育
3.2.2 獲得性免疫系統(tǒng)的功能及發(fā)育特點
4 豬的腸道菌群
4.1 豬腸道菌群的組成和演替
4.1.1 豬腸道菌群的組成
4.1.2 腸道菌群的定植和演替
4.2 影響豬腸道菌群的因素
4.2.1 宿主內(nèi)因?qū)δc道菌群的影響
4.2.2 宿主外因?qū)δc道菌群的影響
4.2.3 環(huán)境因素
4.2.4 微生物因素
5 腸道菌群與腸道免疫的互作
5.1 腸道菌群與先天性免疫的互作
5.1.1 先天性免疫調(diào)節(jié)腸道菌群
5.1.2 腸道菌群調(diào)節(jié)先天性免疫
5.2 腸道菌群與獲得性免疫的互作
5.2.1 腸道菌群與B細胞和T細胞的互作
5.2.2 腸道菌群調(diào)控疫苗效力
6 腸道菌群的干預與調(diào)控
6.1 腸道菌群調(diào)控的“窗口期”
6.2 腸道菌群的調(diào)控方式
6.2.1 糞菌移植
6.2.2 益生菌
7 Meta分析
7.1 概念
7.2 必要性
7.3 優(yōu)缺點
7.4 Meta分析研究益生菌對仔豬腹瀉的效果
8 研究目的與意義
第二章 運用Meta分析研究益生菌對仔豬腹瀉的效果
1 前言
2 材料與方法
2.1 文獻檢索
2.2 文獻篩選
2.3 數(shù)據(jù)整理
2.4 文獻質(zhì)量評估
3 結(jié)果
3.1 文獻篩選與數(shù)據(jù)庫建立
3.2 納入文獻質(zhì)量評價
3.3 益生菌對仔豬腹瀉的總體效果
3.4 益生菌種類
3.5 益生菌數(shù)量
3.6 仔豬生長階段
3.7 試驗設計分配質(zhì)量分數(shù)
4 討論
第三章 糞菌移植聯(lián)合益生菌早期干預對仔豬生長性能和腸道的影響
1 前言
2 材料與方法
2.1 糞菌懸液制備
2.2 試驗動物
2.3 處理時間與方式
2.4 飼養(yǎng)管理
2.5 樣品采集
2.5.1 糞樣采集
2.5.2 血樣采集
2.6 指標測定
2.6.1 仔豬生長性能測定
2.6.2 仔豬腹瀉率及腹瀉指數(shù)計算
2.6.3 腸道屏障功能指標測定方法
2.6.4 糞便中短鏈脂肪酸測定
2.6.5 糞便菌群相對定量分析
2.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
3 結(jié)果
3.1 哺乳期和保育期生長性能的影響
3.2 腹瀉情況
3.3 腸道屏障功能
3.4 糞便中短鏈脂肪酸及琥珀酸產(chǎn)量
3.5 糞便中微生物菌群
4 討論
第四章 腸道菌群發(fā)育窗口期早期干預對哺乳仔豬和斷奶仔豬的影響
1 前言
2 材料與方法
2.1 試驗動物與分組
2.2 疫苗接種
2.3 樣品收集
2.4 菌群16SRRNA測序
2.4.1 DNA提取,16S rRNA基因擴增和Illumina Miseq測序
2.4.2 測序數(shù)據(jù)分析
2.5 免疫因子檢測
2.6 腸道屏障功能測定
2.7 抗氧化應激能力測定
2.8 炎癥水平測定
2.9 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果
3.1 早期干預對仔豬糞菌多樣性的影響
3.1.1 腸道菌群alpha多樣性
3.1.2 腸道菌群beta多樣性
3.2 早期干預影響仔豬早期腸道菌群組成和結(jié)構(gòu)的影響
3.2.1 糞菌結(jié)構(gòu)
3.2.2 腸道細菌表型
3.2.3 菌群變化模式
3.3 對仔豬腸道菌群代謝功能的影響
3.4 對仔豬免疫發(fā)育的影響
3.4.1 對先天性免疫發(fā)育的影響
3.4.2 對仔豬獲得性免疫發(fā)育的影響
3.4.3 對仔豬疫苗效力的影響
3.5 早期干預對仔豬斷奶應激的影響
4 討論
第五章 總體討論和結(jié)語
1 總體討論
2 研究結(jié)論
3 創(chuàng)新點
4 研究不足指出與展望
參考文獻
附錄Ⅰ 研究生期間發(fā)表的主要論文
附表Ⅰ 納入研究明細
致謝
本文編號:3910738
【文章頁數(shù)】:140 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
第一章 文獻綜述
1 前言
2 仔豬腹瀉與斷奶應激
2.1 仔豬腹瀉與調(diào)控
2.2 斷奶應激與調(diào)控
3 豬腸道免疫系統(tǒng)
3.1 腸道免疫系統(tǒng)的組成
3.1.1 先天性免疫系統(tǒng)
3.1.2 獲得性免疫系統(tǒng)
3.2 腸道免疫系統(tǒng)的功能與發(fā)育
3.2.1 先天性免疫系統(tǒng)的功能及發(fā)育
3.2.2 獲得性免疫系統(tǒng)的功能及發(fā)育特點
4 豬的腸道菌群
4.1 豬腸道菌群的組成和演替
4.1.1 豬腸道菌群的組成
4.1.2 腸道菌群的定植和演替
4.2 影響豬腸道菌群的因素
4.2.1 宿主內(nèi)因?qū)δc道菌群的影響
4.2.2 宿主外因?qū)δc道菌群的影響
4.2.3 環(huán)境因素
4.2.4 微生物因素
5 腸道菌群與腸道免疫的互作
5.1 腸道菌群與先天性免疫的互作
5.1.1 先天性免疫調(diào)節(jié)腸道菌群
5.1.2 腸道菌群調(diào)節(jié)先天性免疫
5.2 腸道菌群與獲得性免疫的互作
5.2.1 腸道菌群與B細胞和T細胞的互作
5.2.2 腸道菌群調(diào)控疫苗效力
6 腸道菌群的干預與調(diào)控
6.1 腸道菌群調(diào)控的“窗口期”
6.2 腸道菌群的調(diào)控方式
6.2.1 糞菌移植
6.2.2 益生菌
7 Meta分析
7.1 概念
7.2 必要性
7.3 優(yōu)缺點
7.4 Meta分析研究益生菌對仔豬腹瀉的效果
8 研究目的與意義
第二章 運用Meta分析研究益生菌對仔豬腹瀉的效果
1 前言
2 材料與方法
2.1 文獻檢索
2.2 文獻篩選
2.3 數(shù)據(jù)整理
2.4 文獻質(zhì)量評估
3 結(jié)果
3.1 文獻篩選與數(shù)據(jù)庫建立
3.2 納入文獻質(zhì)量評價
3.3 益生菌對仔豬腹瀉的總體效果
3.4 益生菌種類
3.5 益生菌數(shù)量
3.6 仔豬生長階段
3.7 試驗設計分配質(zhì)量分數(shù)
4 討論
第三章 糞菌移植聯(lián)合益生菌早期干預對仔豬生長性能和腸道的影響
1 前言
2 材料與方法
2.1 糞菌懸液制備
2.2 試驗動物
2.3 處理時間與方式
2.4 飼養(yǎng)管理
2.5 樣品采集
2.5.1 糞樣采集
2.5.2 血樣采集
2.6 指標測定
2.6.1 仔豬生長性能測定
2.6.2 仔豬腹瀉率及腹瀉指數(shù)計算
2.6.3 腸道屏障功能指標測定方法
2.6.4 糞便中短鏈脂肪酸測定
2.6.5 糞便菌群相對定量分析
2.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
3 結(jié)果
3.1 哺乳期和保育期生長性能的影響
3.2 腹瀉情況
3.3 腸道屏障功能
3.4 糞便中短鏈脂肪酸及琥珀酸產(chǎn)量
3.5 糞便中微生物菌群
4 討論
第四章 腸道菌群發(fā)育窗口期早期干預對哺乳仔豬和斷奶仔豬的影響
1 前言
2 材料與方法
2.1 試驗動物與分組
2.2 疫苗接種
2.3 樣品收集
2.4 菌群16SRRNA測序
2.4.1 DNA提取,16S rRNA基因擴增和Illumina Miseq測序
2.4.2 測序數(shù)據(jù)分析
2.5 免疫因子檢測
2.6 腸道屏障功能測定
2.7 抗氧化應激能力測定
2.8 炎癥水平測定
2.9 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果
3.1 早期干預對仔豬糞菌多樣性的影響
3.1.1 腸道菌群alpha多樣性
3.1.2 腸道菌群beta多樣性
3.2 早期干預影響仔豬早期腸道菌群組成和結(jié)構(gòu)的影響
3.2.1 糞菌結(jié)構(gòu)
3.2.2 腸道細菌表型
3.2.3 菌群變化模式
3.3 對仔豬腸道菌群代謝功能的影響
3.4 對仔豬免疫發(fā)育的影響
3.4.1 對先天性免疫發(fā)育的影響
3.4.2 對仔豬獲得性免疫發(fā)育的影響
3.4.3 對仔豬疫苗效力的影響
3.5 早期干預對仔豬斷奶應激的影響
4 討論
第五章 總體討論和結(jié)語
1 總體討論
2 研究結(jié)論
3 創(chuàng)新點
4 研究不足指出與展望
參考文獻
附錄Ⅰ 研究生期間發(fā)表的主要論文
附表Ⅰ 納入研究明細
致謝
本文編號:3910738
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