近年來通過高通量測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了一類新型分節(jié)段黃病毒—荊門病毒屬(Jingmenvirus),主要成員包括Jingmen tick virus、Mogiana tick virus及Guaico Culex virus。該類病毒基因組分為4或5個(gè)節(jié)段,其中有2個(gè)節(jié)段來源于黃病毒的非結(jié)構(gòu)蛋白,其他節(jié)段則表達(dá)病毒結(jié)構(gòu)蛋白。該類病毒可感染蜱、蚊、牛、猴等動(dòng)物,并且在中國(guó)、巴西、美國(guó)、烏干達(dá)地區(qū)都有分布。本研究在我國(guó)東北地區(qū)蜱咬傷病人血液中分離鑒定了一種新型分節(jié)段黃病毒-阿龍山病毒(Alongshan virus,ALSV),并開展了人及動(dòng)物流行病學(xué)研究。1.阿龍山病毒的分離鑒定:2017年4月采集哨點(diǎn)醫(yī)院蜱咬傷病人血樣進(jìn)行宏病毒組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)1例病人血樣中含有類似荊門蜱病毒(Jingmen tick virus,JMTV)的核酸序列,同源性57.4–74.5%。將血樣接種Vero細(xì)胞,5–7天后可見輕微細(xì)胞病變;電鏡負(fù)染觀察,可見直徑80–100 nm的帶囊膜的近球形病毒粒子,切片觀察可見胞質(zhì)中有病毒顆粒。病毒基因全長(zhǎng)為11350 bp,分為4個(gè)節(jié)段。由于病人發(fā)現(xiàn)于內(nèi)蒙古阿龍山地區(qū),因此命名為...

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 黃病毒概述
        1.1.1 黃病毒研究史
        1.1.2 黃病毒生命周期機(jī)制
        1.1.3 黃病毒主要蛋白結(jié)構(gòu)及功能
        1.1.4 黃病毒的宿主范圍及流行病學(xué)
        1.1.5 黃病毒檢測(cè)方法
    1.2 分節(jié)段黃病毒的研究進(jìn)展
        1.2.1 分節(jié)段黃病毒研究史
        1.2.2 分節(jié)段黃病毒基因組結(jié)構(gòu)及編碼蛋白功能
        1.2.3 分節(jié)段黃病毒系統(tǒng)發(fā)育分析
        1.2.4 分節(jié)段黃病毒宿主范圍及地域分布
    1.3 東北地區(qū)重要的蜱傳人獸共患病原流行情況
        1.3.1 蜱傳森林腦炎病毒
        1.3.2 發(fā)熱伴血小板減少綜合征病毒
        1.3.3 淋巴細(xì)胞性脈絡(luò)叢腦膜炎病毒
        1.3.4 斑點(diǎn)熱群立克次體
        1.3.5 無形體
        1.3.6 伯氏疏螺旋體
        1.3.7 巴貝西蟲
    1.4 總結(jié)與展望
第二章 ALSV的分離鑒定
    2.1 材料與方法
        2.1.1 病人樣品及細(xì)胞
        2.1.2 主要儀器與試劑
        2.1.3 病人樣品病毒宏基因組學(xué)前期制備
        2.1.4 ALSV陽(yáng)性樣品篩選
        2.1.5 病毒的分離與鑒定
        2.1.6 病毒的全基因組擴(kuò)增
        2.1.7 病毒在不同細(xì)胞的增殖能力分析
    2.2 結(jié)果
        2.2.1 病毒宏基因組學(xué)測(cè)序結(jié)果
        2.2.2 病毒的分離與鑒定結(jié)果
        2.2.3 病毒全基因組擴(kuò)增結(jié)果
        2.2.4 病毒在不同細(xì)胞的增殖能力檢測(cè)結(jié)果
    2.3 討論
第三章 ALSV全基因組的生物信息學(xué)分析
    3.1 方法
        3.1.1 基因序列選取
        3.1.2 同源性分析
        3.1.3 糖基化位點(diǎn)分析
        3.1.4 信號(hào)肽分析
        3.1.5 跨膜區(qū)域分析
        3.1.6 ALSV基因組序列保守區(qū)分析
        3.1.7 ALSV的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 ALSV與黃病毒其他成員同源性分析結(jié)果
        3.2.2 ALSV基因組序列糖基化位點(diǎn)分析結(jié)果
        3.2.3 ALSV基因組序列信號(hào)肽分析結(jié)果
        3.2.4 ALSV基因組序列跨膜區(qū)分析結(jié)果
        3.2.5 ALSV基因組序列保守區(qū)分析結(jié)果
        3.2.6 ALSV的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析結(jié)果
    3.3 討論
第四章 ALSV在蜱咬病人的流行病學(xué)分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 毒株、細(xì)胞與病人血樣
        4.1.2 主要儀器與試劑
        4.1.3 蜱叮咬住院病人的ALSV感染情況篩查
        4.1.4 ALSV感染病人其他蜱傳病原體檢測(cè)
        4.1.5 ALSV感染病人病例整理分析
        4.1.6 ALSV感染病人陽(yáng)轉(zhuǎn)情況檢測(cè)
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 蜱叮咬住院病人ALSV檢測(cè)結(jié)果及人口統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果
        4.2.2 ALSV感染病人其他蜱傳病檢測(cè)結(jié)果
        4.2.3 ALSV感染病人臨床癥狀及生化指標(biāo)統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果
        4.2.4 ALSV感染病人陽(yáng)轉(zhuǎn)情況檢測(cè)結(jié)果
    4.3 討論
第五章 ALSV在動(dòng)物中的流行病學(xué)分析
    5.1 材料與方法
        5.1.1 毒株、細(xì)胞與樣品采集
        5.1.2 主要儀器與試劑
        5.1.3 主要溶液及配置
        5.1.4 ALSV VP2 原核表達(dá)
        5.1.5 牛羊血清ALSV抗體ELISA方法檢測(cè)
        5.1.6 牛羊血清ALSV中和抗體實(shí)驗(yàn)
        5.1.7 牛羊血清樣品ALSV實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)
        5.1.8 ALSV陽(yáng)性樣品的病毒分離與鑒定
        5.1.9 系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析
        5.1.10 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
    5.2 結(jié)果
        5.2.1 ALSV VP2 蛋白重組表達(dá)
        5.2.2 牛羊血清ALSV抗體ELISA檢測(cè)結(jié)果
        5.2.3 牛羊血清中和抗體檢測(cè)結(jié)果
        5.2.4 ALSV熒光定量RT-q PCR檢測(cè)方法建立
        5.2.5 牛羊血清樣品分子生物學(xué)檢測(cè)結(jié)果
        5.2.6 牛羊樣品血清學(xué)及分子生物學(xué)檢測(cè)結(jié)果比較
        5.2.7 蜱樣品分子生物學(xué)檢測(cè)結(jié)果
        5.2.8 ALSV陽(yáng)性樣品病毒分離
        5.2.9 不同宿主分離ALSV毒株遺傳進(jìn)化分析
    5.3 討論
第六章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介



本文編號(hào)：3859408