珍珠作為一種有機(jī)寶石廣泛用于飾品、化妝品等領(lǐng)域,而其仿生學(xué)材料的研發(fā)也是當(dāng)前的研究熱點(diǎn)。珍珠質(zhì)量的決定因素包括顏色、大小、形狀、光澤、光潔度、有核珍珠珠層厚度等6個(gè)方面,其中,顏色是決定珍珠質(zhì)量的重要因素,不同顏色的珍珠價(jià)格相差較大。同時(shí),根據(jù)幾丁質(zhì)在珍珠質(zhì)有機(jī)基質(zhì)中所起的關(guān)鍵作用,以及幾丁質(zhì)合成酶抑制后的貝殼形成情況,可以推測(cè)幾丁質(zhì)與珍珠的大小、形狀、光澤等相關(guān)。與顏色決定、幾丁質(zhì)形成等珍珠質(zhì)量有關(guān)的分子機(jī)制仍不完全清楚,但均與珍珠形成過(guò)程密切相關(guān)。本研究利用三角帆蚌紫色和白色貝殼珍珠質(zhì)顏色品系,應(yīng)用羅氏454測(cè)序技術(shù),開(kāi)展轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究,篩選與珍珠形成有關(guān),特別是與珍珠質(zhì)量有關(guān)的基因,篩查與珍珠質(zhì)不同顏色有關(guān)的差異表達(dá)基因,研究幾丁質(zhì)合成途徑的重要基因,豐富對(duì)淡水珍珠質(zhì)量形成機(jī)制的認(rèn)識(shí)。1.三角帆蚌外套膜c DNA文庫(kù)的構(gòu)建和珍珠形成相關(guān)基因分析采用羅氏454測(cè)序技術(shù)從分泌紫色和白色珍珠質(zhì)的三角帆蚌外套膜中獲得了981,302個(gè)高質(zhì)量EST序列。從分泌紫色珍珠質(zhì)的三角帆蚌外套膜c DNA文庫(kù)中獲得了541,268條序列,平均長(zhǎng)度為298 bp;從分泌白色珍珠質(zhì)的三角帆蚌外套膜c DN... 

【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

受體蚌和供體蚌手術(shù)植片示意圖

分子功能一類中，大部分為具有結(jié)合功能的基因，占27.1%，其次為代謝活性（占16.2%）和蛋白結(jié)合（占15.9%）；細(xì)胞的生物學(xué)過(guò)程一類中主要為細(xì)胞過(guò)程和代謝過(guò)程，分別占20.4%和16.3%。具體的分類見(jiàn)圖2-2。圖2-2 根據(jù)推導(dǎo)的蛋白質(zhì)序列的GO分類Fig 2-2 Gene Ontology classification of deduced protein sequences采用KEGG方法，共有5,023條推導(dǎo)的蛋白序列被歸類為特定的生物過(guò)程蛋白。在所有推導(dǎo)的蛋白質(zhì)序列中，參與代謝過(guò)程的蛋白序列占24.7%，主要包括以下三種：糖類代謝、脂類代謝和氨基酸代謝。其他參與生物過(guò)程的蛋白序列有遺傳信息過(guò)程（15.5%）、細(xì)胞過(guò)程（11.5%）、生物系統(tǒng)（17.5%）、人類疾病（16.7%）和環(huán)境信息過(guò)程（7.9%）等（圖2-3）。結(jié)構(gòu)域是蛋白質(zhì)分子中能獨(dú)立存在具有明顯功能或結(jié)構(gòu)的功能單位，是重復(fù)出現(xiàn)的序列或結(jié)構(gòu)單位，可能存在于多種生物或者多條序列中。在分子進(jìn)化過(guò)程中，結(jié)構(gòu)域作為一種可移動(dòng)“積木”通過(guò)在基因中不同排列從而調(diào)節(jié)蛋白的功能。保守結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫(kù)（CDD）是NCBI Entrez查詢和檢索系統(tǒng)的一部分，CDD提供了帶有保守結(jié)構(gòu)域足跡定位和從這些足跡中推斷的功能位點(diǎn)的蛋白質(zhì)序列注釋[172]。通過(guò)COG搜索真核生物完整基因組數(shù)據(jù)庫(kù)，所有推導(dǎo)的蛋白序列均被注釋（E-value >1e-3）。共有23,727條蛋白序列參與信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制

上海海洋大學(xué)博士論文19圖2-3 推導(dǎo)的蛋白質(zhì)的KEGG分類Fig 2-3 KEGG classification of deduced protein sequences

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3611069