生長、屠宰及肉品質(zhì)性狀是肉雞產(chǎn)業(yè)重點關(guān)注的性狀,生長速度、產(chǎn)肉性能及肉品質(zhì)直接影響產(chǎn)業(yè)的經(jīng)濟效益。隨著科技的飛速發(fā)展,傳統(tǒng)育種方法與現(xiàn)代生物技術(shù)相結(jié)合,將大大縮短育種周期,這也成為當(dāng)前育種工作的重點。目前關(guān)于肉雞生長發(fā)育規(guī)律和經(jīng)濟性狀遺傳機理的研究越來越多,研究的成果正逐步解析這些性狀形成的分子奧秘。因此,針對雞復(fù)雜的性狀選擇合適的研究方法成為科研工作者突破創(chuàng)新必經(jīng)之路。RNA-seq技術(shù)在轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方面,具有高效快捷、精確度高、技術(shù)成本相對較低的優(yōu)點,可對任意物種的任意細胞類型的轉(zhuǎn)錄組進行全局性檢測,它不僅能夠分析轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)和表達模式,而且還能精確識別cSNP（編碼序列單核苷酸多態(tài)性）以及可變剪接位點,因此,被認為是研究復(fù)雜性狀最有效的工具之一。本研究以金茅黑雞（A系）為試驗動物,在生長期采取2周齡、6周齡、10周齡（接近生長拐點）和14周齡（上市日齡）胸肌樣本,利用RNA-seq測序和基因共表達研究方法,探索金茅黑雞生長過程中全基因組范圍內(nèi)基因表達的變化情況,篩選出不同生長階段特異性基因;在14周齡對金茅黑雞進行群體屠宰,采取胸肌組織,測定體重、屠宰性狀和肉品質(zhì)性狀并進行轉(zhuǎn)錄組關(guān)... 

【文章來源】：揚州大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】：102 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖２－８各樣品ＦＰＫＭ密度分布對比圖??

終采用ＦＤＲ作為差異表達基因篩選的關(guān)鍵指標(biāo)。火山圖（Ｖｏｌｃａｎｏ?Ｐｌｏｔ）可以快速地查看基??因在兩個（組）樣品中表達水平的差異，以及差異的統(tǒng)計學(xué)顯著性。４組兩兩比較形成的表??達火山圖（圖２－９）。??Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ??１?＾?Ｉ?ｒｎ?１?＿??Ｉ?－?Ｉ?－?｜?＝??？?－?．．??ｌ°ｇ２，ＦＣ，?呦阢丨?Ｉ０Ｑ２，ＦＣ）??Ｗ２＿ｖｓ＿Ｗ６?Ｗ２＿ｖｓ＿ＷＩ（）?Ｗ２?ｖｓ?ＷＩ４??Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ??？?ｉｔｑｎｉｔＫｍ?５?Ｓ＜〇ｍｎｃａｎｉ?ｇ?Ｓｔ〇ｎＨｔＭ〇ｉ??ｓ?ｆｔＬＳｉ?５?＾?ｓ??＾?＾?ＴｆｔＵＣ?ａ?ＴＢｕｔ??ｉ〇〇２｜ＦＣ｜?ｌ〇８２｜ＦＣ）?ｌ〇〇２（ＦＣ）??Ｗ６?＿ｖｓ＿ＷＩ０?Ｗ６＿ｖｓ＿ＷＩ４?ＷＩＯ?ｖｓ?ＷＩ４??圖２－９差異表迗基因的火山圖??Ｆｉｇ．２－９?Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｏｆ?ｖｏｌｃａｎｉｃ??

ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅ，ＧＳ）和模塊成員（ＭＭ）值之間的相關(guān)性，我們鑒定金茅黑雞胸肌生長發(fā)育過程??中的階段特異性模塊，計算了每個模塊中所有基因的基因顯著性（ＧＳ）和模塊關(guān)系值??圖２－１１）。ＧＳ定義為基因與生長階段之間的相關(guān)性的絕對值，ＭＭ值則定義為模塊??基因表達模式第一主成分與基因表達模式之間的相關(guān)性。如果模塊中基因ＧＳ值與ＭＭ值??之間高度相關(guān)（Ｐ＜〇．〇５），則說明基因與性狀顯著相關(guān)，或者說這些基因可能為階段特異性??模塊中的重要因子。此外，我們以ＭＥ值代表每個模塊中基因的表達水平，來計算每個模??塊表達水平與不同生長階段之間的相關(guān)性（圖２－１２）。本研究中具有高度相關(guān)的ＧＳ和ＭＭ??值（Ｐ值＜０．０５）和ｃｏｒ（相關(guān)系數(shù)）＞０．８的的模塊被確定為不同生長階段特定模塊［９４１。ＧＳ＞０．２??和ＭＭ＞０．８的基因在相應(yīng)模塊中被鑒定為樞紐基因。最終，共鑒定出４個階段特異型模??塊，每個生長階段（Ｗ２，Ｗ６，Ｗ１０，Ｗ１４）鑒定出一個最顯著的模塊，分別為粉色（Ｗ２）、??

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3577557