雞卵泡發(fā)育過(guò)程中circRNA和mRNA表達(dá)和功能預(yù)測(cè)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-28 00:00
母禽繁殖性能取決于卵巢的發(fā)育水平,卵巢的主要功能作用則由卵泡體現(xiàn),在性成熟啟動(dòng)后卵泡依次經(jīng)過(guò)生長(zhǎng)、募集、選擇、等級(jí)卵泡發(fā)育并最終排卵。卵泡的主要結(jié)構(gòu)由膜細(xì)胞(Thecacell,TC or T)、顆粒細(xì)胞(Granulosacell,GC or G)和卵母細(xì)胞構(gòu)成。為了研究在卵泡發(fā)育過(guò)程轉(zhuǎn)錄組水平上的變化,本試驗(yàn)以京海黃雞為研究對(duì)象,利用RNA-seq技術(shù)對(duì)卵泡發(fā)育過(guò)程中卵泡顆粒細(xì)胞和膜細(xì)胞的circRNA進(jìn)行鑒定,并對(duì)circRNA和mRNA進(jìn)行差異表達(dá)和功能分析,主要結(jié)果如下:研究一:取相同生理?xiàng)l件半同胞關(guān)系的母雞卵泡顆粒細(xì)胞,利用RNA-seq技術(shù)分析小黃卵泡(Small yellow follicle,SYF)、F6 卵泡(The smallest hierarchical follicle,F6)和 F1 卵泡(The largest hierarchical follicle,F1)的顆粒細(xì)胞中 circRNA 和 mRNA 表達(dá)情況,進(jìn)行各發(fā)育階段的差異表達(dá)基因鑒定、基因功能富集分析等生物信息學(xué)方法,預(yù)測(cè)其可能參與的生物學(xué)過(guò)程。1、顆粒細(xì)胞中共鑒定出11,641個(gè)circ...
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:143 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1雞卵巢結(jié)構(gòu)圖?(Johoson,2015[10】)??Figure?1.1?Structure?of?chicken?ovary??注:F1-F6代表由大至小的等級(jí)卵泡,黑色前頭代表小黃卵泡,白色箭頭代表大白卵泡;??-
圖1.2排卵前卵泡解剖圖(Bahr,?1991間)??Figure?1.2?Anatomical?drawing?of?preovulatory?follicle??
圖1.3?111丨1^八形成和調(diào)控機(jī)制楔型圖(\^1111〇丨(^,20051611)??Figure?1.3?A?model?for?miRNA?biogenesis?pathway?and?mecha?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]家禽卵泡選擇過(guò)程中顆粒細(xì)胞的分子調(diào)控機(jī)制[J]. 魏澤輝,賈存靈. 中國(guó)家禽. 2017(21)
[2]高產(chǎn)與低產(chǎn)蛋雞卵巢和卵泡及相關(guān)基因的表達(dá)差異[J]. 李佳宜,陸應(yīng)林,劉小凡,虞德兵. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(05)
[3]連產(chǎn)性在家禽育種工作中的研究概述[J]. 沈曼曼,王克華,曲亮,郭軍,竇套存. 中國(guó)畜牧雜志. 2014(08)
[4]京海黃雞生長(zhǎng)和產(chǎn)蛋率曲線(xiàn)的擬合[J]. 顧玉萍,侯啟瑞,王金玉,施會(huì)強(qiáng),俞亞波. 中國(guó)家禽. 2010(20)
[5]促卵泡素對(duì)雞等級(jí)前卵泡細(xì)胞發(fā)育的影響[J]. 慈光新,葛楚天,金艷梅,張才喬. 中國(guó)畜牧雜志. 2009(09)
[6]京海Ⅰ號(hào)黃雞DNA指紋中J帶與體重的相關(guān)性研究[J]. 張鵬,顧玉萍,王金玉,盛浩偉,施會(huì)強(qiáng). 中國(guó)家禽. 2004(S1)
[7]番鴨產(chǎn)蛋期和休產(chǎn)期血清雌二醇變化的研究[J]. 鄭嫩珠,王長(zhǎng)康,李昂,王光瑛. 福建畜牧獸醫(yī). 2002(03)
博士論文
[1]京海黃雞脂肪沉積關(guān)鍵基因的篩選[D]. 張濤.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[2]文昌雞性成熟啟動(dòng)前后下丘腦部分功能基因和miRNA表達(dá)譜的變化[D]. 韓威.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA調(diào)控小鼠卵巢發(fā)育的初步研究[D]. 李加宇.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3553000
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:143 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1雞卵巢結(jié)構(gòu)圖?(Johoson,2015[10】)??Figure?1.1?Structure?of?chicken?ovary??注:F1-F6代表由大至小的等級(jí)卵泡,黑色前頭代表小黃卵泡,白色箭頭代表大白卵泡;??-
圖1.2排卵前卵泡解剖圖(Bahr,?1991間)??Figure?1.2?Anatomical?drawing?of?preovulatory?follicle??
圖1.3?111丨1^八形成和調(diào)控機(jī)制楔型圖(\^1111〇丨(^,20051611)??Figure?1.3?A?model?for?miRNA?biogenesis?pathway?and?mecha?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]家禽卵泡選擇過(guò)程中顆粒細(xì)胞的分子調(diào)控機(jī)制[J]. 魏澤輝,賈存靈. 中國(guó)家禽. 2017(21)
[2]高產(chǎn)與低產(chǎn)蛋雞卵巢和卵泡及相關(guān)基因的表達(dá)差異[J]. 李佳宜,陸應(yīng)林,劉小凡,虞德兵. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(05)
[3]連產(chǎn)性在家禽育種工作中的研究概述[J]. 沈曼曼,王克華,曲亮,郭軍,竇套存. 中國(guó)畜牧雜志. 2014(08)
[4]京海黃雞生長(zhǎng)和產(chǎn)蛋率曲線(xiàn)的擬合[J]. 顧玉萍,侯啟瑞,王金玉,施會(huì)強(qiáng),俞亞波. 中國(guó)家禽. 2010(20)
[5]促卵泡素對(duì)雞等級(jí)前卵泡細(xì)胞發(fā)育的影響[J]. 慈光新,葛楚天,金艷梅,張才喬. 中國(guó)畜牧雜志. 2009(09)
[6]京海Ⅰ號(hào)黃雞DNA指紋中J帶與體重的相關(guān)性研究[J]. 張鵬,顧玉萍,王金玉,盛浩偉,施會(huì)強(qiáng). 中國(guó)家禽. 2004(S1)
[7]番鴨產(chǎn)蛋期和休產(chǎn)期血清雌二醇變化的研究[J]. 鄭嫩珠,王長(zhǎng)康,李昂,王光瑛. 福建畜牧獸醫(yī). 2002(03)
博士論文
[1]京海黃雞脂肪沉積關(guān)鍵基因的篩選[D]. 張濤.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[2]文昌雞性成熟啟動(dòng)前后下丘腦部分功能基因和miRNA表達(dá)譜的變化[D]. 韓威.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA調(diào)控小鼠卵巢發(fā)育的初步研究[D]. 李加宇.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3553000
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