自然條件下,植物在整個(gè)生命周期中經(jīng)常受到多種脅迫。干旱是主要制約植物生長(zhǎng)發(fā)育,作物產(chǎn)量減少的非生物脅迫之一（僅次于病蟲害）。植物在分子、細(xì)胞和生理水平等多方面應(yīng)答反應(yīng)和防御系統(tǒng)來(lái)適應(yīng)脅迫環(huán)境,許多基因都參與植物對(duì)非生物脅迫的應(yīng)答。因此,非生物脅迫響應(yīng)的相關(guān)基因研究具有重要理論和現(xiàn)實(shí)意義。轉(zhuǎn)錄因子參與生物和非生物脅迫的應(yīng)答反應(yīng),在調(diào)節(jié)植物適應(yīng)環(huán)境變化中起重要作用。轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)調(diào)節(jié)下游基因的表達(dá),實(shí)現(xiàn)對(duì)植物的形態(tài)建成、生長(zhǎng)發(fā)育及抵抗生物和非生物脅迫的調(diào)節(jié)作用。轉(zhuǎn)錄因子除了可應(yīng)答外界刺激和環(huán)境脅迫,還可控制目的基因的時(shí)空特異性表達(dá),通過(guò)基因產(chǎn)物的作用對(duì)內(nèi)、外界信號(hào)作出應(yīng)答,引起植物的生理、生化發(fā)生變化,提高抗逆性。我國(guó)是蠶桑生產(chǎn)的發(fā)源地,桑樹種質(zhì)資源極其豐富。桑樹不僅具有藥用價(jià)值的經(jīng)濟(jì)作物,還形成了較強(qiáng)的適應(yīng)性,抗逆境的特性,可用于受損生態(tài)環(huán)境的治理。多種逆境條件常常對(duì)桑樹的生長(zhǎng)產(chǎn)生重大的影響。桑樹一些重要調(diào)控基因及其脅迫下分子機(jī)制的研究,對(duì)提高桑樹產(chǎn)量、抗逆性及保存桑樹種質(zhì)資源有重要作用。目前,植物抗逆相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子研究主要集中在MYB、WRKY、b ZIP、AP2/ERF和NAC等幾大類... 

【文章來(lái)源】：江蘇科技大學(xué)江蘇省

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 緒論
    1.1 研究的背景及意義
    1.2 轉(zhuǎn)錄因子
        1.2.1 植物轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)
        1.2.2 轉(zhuǎn)錄因子在逆境脅迫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用
    1.3 植物抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子
    1.4 植物轉(zhuǎn)錄因子功能
        1.4.1 轉(zhuǎn)錄因子參與植物生長(zhǎng)及形態(tài)建成
        1.4.2 轉(zhuǎn)錄因子與植物抗逆
    1.5 植物轉(zhuǎn)錄因子研究方法
        1.5.1 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)域分析研究
        1.5.2 轉(zhuǎn)錄因子亞細(xì)胞定位分析
        1.5.3 轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄激活作用分析
        1.5.4 轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合體研究
        1.5.5 研究轉(zhuǎn)錄因子功能的方法
    1.6 轉(zhuǎn)錄因子功能分析
        1.6.1 構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹-預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄因子功能
        1.6.2 表達(dá)特性分析推測(cè)轉(zhuǎn)錄因子功能
        1.6.3 基因缺失表型分析鑒定轉(zhuǎn)錄因子功能
        1.6.4 基因過(guò)表達(dá)表型分析鑒定轉(zhuǎn)錄因子功能
        1.6.5 下游相關(guān)基因分析鑒定轉(zhuǎn)錄因子功能
    1.7 生物信息學(xué)在基因組學(xué)和蛋白組學(xué)上的應(yīng)用研究進(jìn)展
        1.7.1 生物信息學(xué)概況
        1.7.2 生物信息學(xué)的主要應(yīng)用
        1.7.3 生物信息學(xué)在基因組學(xué)研究中應(yīng)用
        1.7.4 生物信息學(xué)在蛋白組學(xué)研究中應(yīng)用
    1.8 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)及應(yīng)用
    1.9 研究的主要內(nèi)容
第2章 桑樹Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定和分析
    2.1 材料和方法
        2.1.1 Trihelix基因家族數(shù)據(jù)獲取與分析
        2.1.2 桑樹Trihelix家族基因的分類、結(jié)構(gòu)及基因信息
        2.1.3 桑樹Trihelix保守基序的鑒定及分析
        2.1.4 多序列聯(lián)配、蛋白質(zhì)保守序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    2.2 結(jié)果與討論
        2.2.1 桑樹Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定
        2.2.2 桑樹Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族的進(jìn)化分析
        2.2.3 桑樹Trihelix轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析
    2.3 小結(jié)
第3章 桑樹bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定和分析
    3.1 材料和方法
        3.1.1 bZIP基因家族數(shù)據(jù)獲取與分析
        3.1.2 桑bZIP家族基因的分類、結(jié)構(gòu)及基因信息
        3.1.3 桑樹bZIP保守基序的鑒定及分析
        3.1.4 多序列聯(lián)配、蛋白質(zhì)保守序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    3.2 結(jié)果與討論
        3.2.1 桑樹bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定
        3.2.2 桑樹bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族的進(jìn)化分析
        3.2.3 桑樹bZIP轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析
    3.3 討論
第4章 桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定和分析
    4.1 材料和方法
        4.1.1 桑樹MYB基因家族數(shù)據(jù)獲取與分析
        4.1.2 桑樹MYB家族基因的分類、結(jié)構(gòu)及基因信息
        4.1.3 桑樹MYB保守基序的鑒定及分析
        4.1.4 多序列聯(lián)配、蛋白質(zhì)保守序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    4.2 結(jié)果與討論
        4.2.1 桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定
        4.2.2 桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的進(jìn)化分析
        4.2.3 桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析
    4.3 討論
第5章 桑樹ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定和分析
    5.1 材料和方法
        5.1.1ERF基因家族數(shù)據(jù)的獲取與分析
        5.1.2 桑樹ERF家族基因的分類、結(jié)構(gòu)及基因信息
        5.1.3 桑樹ERF保守基序的鑒定和分析
        5.1.4 多序列聯(lián)配、蛋白質(zhì)保守序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    5.2 結(jié)果與討論
        5.2.1 桑樹ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定
        5.2.2 ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的進(jìn)化分析
        5.2.3 桑樹ERF轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析
    5.3 討論
第6章 桑樹干旱脅迫轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子鑒定
    6.1 材料和方法
        6.1.1 實(shí)驗(yàn)材料的準(zhǔn)備
        6.1.2 主要儀器與試劑
        6.1.3 樣品總RNA提取
        6.1.4 RNA質(zhì)量檢測(cè)
        6.1.5 測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建
        6.1.6 文庫(kù)質(zhì)檢、簇生成及Solexa測(cè)序
        6.1.7 測(cè)序數(shù)據(jù)的處理和分析
        6.1.8 測(cè)序數(shù)據(jù)的組裝分析
        6.1.9 差異表達(dá)分析
        6.1.10 差異表達(dá)基因(DEGs)注釋和分類
        6.1.11 四個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族差異基因富集分析
    6.2 結(jié)果與分析
        6.2.1 RNA質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果
        6.2.2 測(cè)序結(jié)果質(zhì)控結(jié)果
        6.2.3 測(cè)序數(shù)據(jù)的組裝與分析
        6.2.4 與參考基因組序列對(duì)比結(jié)果
        6.2.5 基因差異表達(dá)分析
        6.2.6 差異基因GO功能注釋分類
    6.3 討論
第7章 桑樹Trihelix基因的克隆和序列分析及表達(dá)模式
    7.1 材料與試劑
        7.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        7.1.2 主要儀器
        7.1.3 主要試劑
    7.2 實(shí)驗(yàn)方法
        7.2.1 大腸桿菌(E.coli)感受態(tài)細(xì)胞的制備
        7.2.2 目的基因片段的回收、連接和轉(zhuǎn)化
        7.2.3 桑樹的脅迫處理
        7.2.4 桑樹總RNA的提取和cDNA的合成
        7.2.5 目的基因的克隆和測(cè)序
        7.2.6 桑樹基因的全長(zhǎng)cDNA序列分析
        7.2.7 桑樹Mntrihelix基因的結(jié)構(gòu)及基因信息
        7.2.8 熒光定量PCR(qRT-PCR)
    7.3 結(jié)果與分析
        7.3.1 桑樹Mntrihelix基因的克隆與分析
        7.3.2 桑樹Mntrihelix基因的分析
        7.3.3 桑樹Mntrihelix同源進(jìn)化分析
        7.3.4 桑樹Mntrihelix基因在脅迫條件下的表達(dá)分析
    7.4 討論
第8章 桑樹bZIP基因的克隆和序列分析及表達(dá)模式
    8.1 材料與試劑
        8.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        8.1.2 主要儀器
        8.1.3 主要試劑
    8.2 實(shí)驗(yàn)方法
        8.2.1 大腸桿菌(E.coli)感受態(tài)細(xì)胞的制備
        8.2.2 目的基因片段的回收、連接和轉(zhuǎn)化
        8.2.3 桑樹的脅迫處理
        8.2.4 桑樹總RNA提取和cDNA的合成
        8.2.5 目的基因的克隆和測(cè)序
        8.2.6 桑樹基因的全長(zhǎng)cDNA序列分析
        8.2.7 桑樹MnbZIP基因的結(jié)構(gòu)及基因信息
        8.2.8 熒光定量PCR(qRT-PCR)
    8.3 結(jié)果與分析
        8.3.1 桑樹MnbZIP基因的克隆與分析
        8.3.2 桑樹MnbZIP基因的分析
        8.3.3 桑樹MnbZIP同源進(jìn)化分析
        8.3.4 桑樹MnbZIP基因在脅迫條件下的表達(dá)分析
    8.4 討論
第9章 桑樹MYB基因的克隆、序列分析、表達(dá)模式及原核表達(dá)
    9.1 材料與試劑
        9.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        9.1.2 主要儀器
        9.1.3 主要試劑
    9.2 實(shí)驗(yàn)方法
        9.2.1 桑樹的脅迫處理
        9.2.2 桑樹總RNA的提取和cDNA的合成
        9.2.3 目的基因的克隆和測(cè)序
        9.2.4 桑樹基因的全長(zhǎng)cDNA序列分析
        9.2.5 桑樹MnMYB家族基因的結(jié)構(gòu)及基因信息
        9.2.6 桑樹轉(zhuǎn)錄因子MYB基因的原核表達(dá)
        9.2.7 熒光定量PCR(qRT-PCR)
    9.3 結(jié)果與分析
        9.3.1 桑樹MnMYB基因的克隆與分析
        9.3.2 桑樹MnMYB基因的分析
        9.3.3 桑樹MnMYB同源進(jìn)化分析
        9.3.4 MYB基因的原核表達(dá)
        9.3.5 桑樹MnMYB基因在脅迫條件下的表達(dá)分析
    9.4 討論
第10章 桑樹ERF基因的克隆和序列分析及表達(dá)模式
    10.1 材料與試劑
        10.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        10.1.2 主要儀器
        10.1.3 主要試劑
    10.2 實(shí)驗(yàn)方法
        10.2.1 大腸桿菌(E.coli)感受態(tài)細(xì)胞的制備
        10.2.2 目的基因片段的回收、連接和轉(zhuǎn)化
        10.2.3 桑樹的脅迫處理
        10.2.4 桑樹總RNA提取和cDNA的合成
        10.2.5 目的基因的克隆和測(cè)序
        10.2.6 桑樹基因的全長(zhǎng)cDNA序列分析
        10.2.7 桑樹ERF家族基因的結(jié)構(gòu)及基因信息
        10.2.8 熒光定量PCR(qRT PCR)
    10.3 結(jié)果與分析
        10.3.1 桑樹MnERF基因克隆與分析
        10.3.2 桑樹MnERF基因的分析
        10.3.3 桑樹MnERF同源進(jìn)化分析
        10.3.4 桑樹MnERF在脅迫條件下的表達(dá)分析
    10.4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
博士期間學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
致謝
詳細(xì)摘要


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3424134