牡丹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及重要性狀QTL分析
發(fā)布時間：2021-09-03 00:48
牡丹（Paeonia Sect. Moutan）,屬于芍藥科（Paeoniaceae）芍藥屬（Paeonia）牡丹組植物,是中國的傳統(tǒng)名花,其育種是牡丹產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的基本保障。開展分子生物學(xué)研究,探索表型性狀的遺傳調(diào)控機(jī)制,是促使牡丹育種從傳統(tǒng)雜交育種逐步向現(xiàn)代分子育種轉(zhuǎn)變的重要基礎(chǔ)。本研究以‘鳳丹白’M24和中原牡丹‘紅喬’雜交獲得的F1群體為作圖材料,采用SLAF-seq （Specific-locus amplified fragment sequencing）簡化基因組測序技術(shù)和簡單重復(fù)序列（Simple sequence repeat, SSR）分子標(biāo)記技術(shù),構(gòu)建了第一張牡丹高密度遺傳連鎖圖譜,繼而開展了牡丹重要表型性狀的數(shù)量性狀位點（Quantitative trait loci, QTLs）定位研究,主要研究結(jié)果如下：（1）利用19對SSR引物,對牡丹3個雜交組合進(jìn)行了遺傳多態(tài)性分析,結(jié)果顯示：‘鳳丹白’M24ב紅喬’雜交組合親本間DNA水平的多態(tài)性最高,19對SSR引物共檢測到27個多態(tài)性位點,親本間遺傳距離為0.7070；進(jìn)一步分析了該雜交組合F1分離群體的遺傳結(jié)...
【文章來源】：北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：138 頁
【學(xué)位級別】：博士
【部分圖文】：
圖３－５不同分離類型的ＳＬＡＦ標(biāo)記數(shù)量??Ｆｉｇ．?３－５?Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ＳＬＡＦ?ｍａｒｋｅｒ?ｆｏｒ?ｅｉｇｈｔ?ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ?ｐａｔｔｅｒｎｓ??
個?ＳＮＰ＆ＩｎＤｅｌ?標(biāo)記和?７２?個?ＳＳＲ?標(biāo)記，分別占?８８．４２％，１．４３％，?４．４４％和?５．７１％。５?個連??鎖群中均包含這４類標(biāo)記，例如ＬＧ２連鎖群上，這４類標(biāo)記所占的比例為別為８９．２３％，??２．０５％，?３．０８％和５．６４％，各連鎖群上標(biāo)記類型的分布情況見表３－６和圖３－９。??分析ＳＬＡＦ標(biāo)記上的ＳＮＰ位點，包括１１１５個ＳＮＰ－ｏｎｌｙ標(biāo)記和５６個ＳＮＰ＆ＩｎＤｅｌ標(biāo)??記，結(jié)果顯示：１１７１標(biāo)記共有２５１８個ＳＮＰ位點，中有６５６個標(biāo)記含有２個或２個以上??的ＳＮＰ位點。進(jìn)一步分析這些ＳＮＰ位點顯示：轉(zhuǎn)換類型（ｔｒａｎｓｉｔｉｏｎｔｙｐｅ）的位點占多數(shù)??（６７．７１％），包括Ｒ（Ａ／Ｇ）和Ｙ（Ｃ／Ｔ）兩種類型，分別占３３．７６和３３．９６％；顛換類型??（ｔｒａｎｓｖｅｒｓｉｏｎｔｙｐｅ）的位點占少數(shù)（３２．２９。／。），包括?Ｍ（Ａ／Ｃ），Ｗ（Ａ／Ｔ），?Ｓ（Ｃ／Ｇ），和?Ｋ??（Ｇ／Ｔ）四種類型（表３－７）。??３．２．８．２偏分離分析??卡方檢測ＣＰ＜０．０５）結(jié)果表明，牡丹遺傳圖譜上１２６１個分子標(biāo)記中，有３２２個偏??．?分離標(biāo)記，占總數(shù)的２５．５４％。偏分離標(biāo)記在５個連鎖群上均有分布，但所占比例各不相??同（表３－８）。ＬＧ５連鎖群上偏分離標(biāo)記所占比例最高，達(dá)到４１．７９％，明顯高于其他連??鎖群。ＬＧ１連鎖群上偏分離標(biāo)記所占比例最低
紫色系（Ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ）和紅紫色系（Ｒｅｄｄｉｓｈ?ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ）（見附錄?ＩＩ）。??對４個色系的Ｚ、ａ＊．?參數(shù)進(jìn)行分析顯示，４個色系的參數(shù)分布規(guī)律明顯，可以??將不同色系明顯地區(qū)分開來（圖４－５）。值由高到低分別是白色系、紫粉色系、紅紫色??系和紫色系；值由高到低是紅紫色系、紫色系、紫粉色系和白色系；而６＊值由高到低??的順序與Ｚ＊值相同。此外，白色系和紫粉色系的Ｚ＊、《＊、ｂ＊ｍ，分布較為集中，而且??兩色系值的分布范圍能明顯區(qū)分開來；紫色系和紅紫色系的Ｚ＊、ａ＊．?６＊值分布有重疊范??圍，其中紅紫色系的￡＊、ａ＊、６＊值分布范圍比紫色系更廣。??ｔｏ－??－??．??：?－ｒ?４０．??－?？：?Ｔ?Ｉ??？?ＴＯ－?????？??’???ｔｉ?Ｉ?１?１?ｓ?２０．????＂■?，。？?＇＝＾＝１?丄?ｉ??５０．?０－??Ｉ?Ｉ?Ｉ?ｒ＇?“?■?“?‘??Ａ?ｎ?ｒ?ｎ?ａ?ｂ?ｔ：?ｉ＞??Ｓｉ??０－?Ｊ??Ｔ??ｒ—＾??－ｓ．?Ｊ?Ｔ?丨??？?．１０．??＂■?ｎｒ??？２０．??Ｉ?Ｉ?Ｉ?ｒ?■■?■■??Ａ?ａ?（？?ｎ??注：Ａ：白色系；Ｂ：紫粉色系；Ｃ：紫色系；Ｄ：紅紫色系??Ｎｏｔｅ：?Ａ：?Ｗｈｉｔｅ?ｇｒｏｕｐ；?Ｂ：?Ｐｕｒｐｌｉｓｈ?ｐｉｎｋ?ｇｒｏｕｐ；?Ｃ：?Ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ；?Ｄ：?Ｒｅｄｄｉｓｈ?ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ．??圖４－５作圖群體４個色系ｉ＊、ａ＊
本文編號：3380063
【文章來源】：北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：138 頁
【學(xué)位級別】：博士
【部分圖文】：
圖３－５不同分離類型的ＳＬＡＦ標(biāo)記數(shù)量??Ｆｉｇ．?３－５?Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ＳＬＡＦ?ｍａｒｋｅｒ?ｆｏｒ?ｅｉｇｈｔ?ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ?ｐａｔｔｅｒｎｓ??
個?ＳＮＰ＆ＩｎＤｅｌ?標(biāo)記和?７２?個?ＳＳＲ?標(biāo)記，分別占?８８．４２％，１．４３％，?４．４４％和?５．７１％。５?個連??鎖群中均包含這４類標(biāo)記，例如ＬＧ２連鎖群上，這４類標(biāo)記所占的比例為別為８９．２３％，??２．０５％，?３．０８％和５．６４％，各連鎖群上標(biāo)記類型的分布情況見表３－６和圖３－９。??分析ＳＬＡＦ標(biāo)記上的ＳＮＰ位點，包括１１１５個ＳＮＰ－ｏｎｌｙ標(biāo)記和５６個ＳＮＰ＆ＩｎＤｅｌ標(biāo)??記，結(jié)果顯示：１１７１標(biāo)記共有２５１８個ＳＮＰ位點，中有６５６個標(biāo)記含有２個或２個以上??的ＳＮＰ位點。進(jìn)一步分析這些ＳＮＰ位點顯示：轉(zhuǎn)換類型（ｔｒａｎｓｉｔｉｏｎｔｙｐｅ）的位點占多數(shù)??（６７．７１％），包括Ｒ（Ａ／Ｇ）和Ｙ（Ｃ／Ｔ）兩種類型，分別占３３．７６和３３．９６％；顛換類型??（ｔｒａｎｓｖｅｒｓｉｏｎｔｙｐｅ）的位點占少數(shù)（３２．２９。／。），包括?Ｍ（Ａ／Ｃ），Ｗ（Ａ／Ｔ），?Ｓ（Ｃ／Ｇ），和?Ｋ??（Ｇ／Ｔ）四種類型（表３－７）。??３．２．８．２偏分離分析??卡方檢測ＣＰ＜０．０５）結(jié)果表明，牡丹遺傳圖譜上１２６１個分子標(biāo)記中，有３２２個偏??．?分離標(biāo)記，占總數(shù)的２５．５４％。偏分離標(biāo)記在５個連鎖群上均有分布，但所占比例各不相??同（表３－８）。ＬＧ５連鎖群上偏分離標(biāo)記所占比例最高，達(dá)到４１．７９％，明顯高于其他連??鎖群。ＬＧ１連鎖群上偏分離標(biāo)記所占比例最低
紫色系（Ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ）和紅紫色系（Ｒｅｄｄｉｓｈ?ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ）（見附錄?ＩＩ）。??對４個色系的Ｚ、ａ＊．?參數(shù)進(jìn)行分析顯示，４個色系的參數(shù)分布規(guī)律明顯，可以??將不同色系明顯地區(qū)分開來（圖４－５）。值由高到低分別是白色系、紫粉色系、紅紫色??系和紫色系；值由高到低是紅紫色系、紫色系、紫粉色系和白色系；而６＊值由高到低??的順序與Ｚ＊值相同。此外，白色系和紫粉色系的Ｚ＊、《＊、ｂ＊ｍ，分布較為集中，而且??兩色系值的分布范圍能明顯區(qū)分開來；紫色系和紅紫色系的Ｚ＊、ａ＊．?６＊值分布有重疊范??圍，其中紅紫色系的￡＊、ａ＊、６＊值分布范圍比紫色系更廣。??ｔｏ－??－??．??：?－ｒ?４０．??－?？：?Ｔ?Ｉ??？?ＴＯ－?????？??’???ｔｉ?Ｉ?１?１?ｓ?２０．????＂■?，。？?＇＝＾＝１?丄?ｉ??５０．?０－??Ｉ?Ｉ?Ｉ?ｒ＇?“?■?“?‘??Ａ?ｎ?ｒ?ｎ?ａ?ｂ?ｔ：?ｉ＞??Ｓｉ??０－?Ｊ??Ｔ??ｒ—＾??－ｓ．?Ｊ?Ｔ?丨??？?．１０．??＂■?ｎｒ??？２０．??Ｉ?Ｉ?Ｉ?ｒ?■■?■■??Ａ?ａ?（？?ｎ??注：Ａ：白色系；Ｂ：紫粉色系；Ｃ：紫色系；Ｄ：紅紫色系??Ｎｏｔｅ：?Ａ：?Ｗｈｉｔｅ?ｇｒｏｕｐ；?Ｂ：?Ｐｕｒｐｌｉｓｈ?ｐｉｎｋ?ｇｒｏｕｐ；?Ｃ：?Ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ；?Ｄ：?Ｒｅｄｄｉｓｈ?ｐｕｒｐｌｅ?ｇｒｏｕｐ．??圖４－５作圖群體４個色系ｉ＊、ａ＊
本文編號：3380063
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