發(fā)布時(shí)間：2021-08-29 12:34

　　嗜線蟲致病桿菌（Xenorhabdus nematophila）屬于腸桿菌科（Enterobacteriaceae）,是一類與小卷蛾斯氏線蟲（Steinernema carpocapsae）互惠共生的革蘭氏陰性細(xì)菌,具有廣譜的殺蟲和抑菌活性,其分泌的殺蟲毒素以及抑菌活性物質(zhì)中包括幾丁質(zhì)酶和幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白。為了明確嗜線蟲致病桿菌幾丁質(zhì)酶和幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白的特性和功能,本研究對(duì)其基因組中的幾丁質(zhì)酶基因和幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,通過原核表達(dá)獲得了重組幾丁質(zhì)酶和幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白,隨后測(cè)定了重組幾丁質(zhì)酶和幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白的生理生化特征以及生物活性,最后通過敲除幾丁質(zhì)酶基因Xn-chi60和Xn-chi70來(lái)了解這兩種幾丁質(zhì)酶與Xn-Tc毒素的關(guān)系�，F(xiàn)將主要結(jié)果總結(jié)如下:1.嗜線蟲致病桿菌基因組中含有4個(gè)幾丁質(zhì)酶基因和1個(gè)幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白基因,其編碼的幾丁質(zhì)酶分別屬于18家族幾丁質(zhì)酶和20家族幾丁質(zhì)酶。通過對(duì)GenBank中嗜線蟲致病桿菌基因組進(jìn)行分析,從中找到了 2個(gè)18家族幾丁質(zhì)酶基因 Xn-chi60和Xn-chi70（登錄號(hào):KC701470 和 KC701471）、2 個(gè) 20家... 

【文章來(lái)源】：河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】：129 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖２－５?Ｘ？－ｃ處基因推導(dǎo)的氨基酸序列??．－ｅｕｃｅａｍｎｃ－ｃ

?ｉ???（????ｔ???Ｃ＊ｓｃｏｒｏ?■＇??１．〇?Ｓ－ｓｃｏｒｏ????．??Ｙ－ｓｃｏｒｅ????〇．Ｂ廣廣一Ａ??ｌ〇＜?ｚｚＷ?：??０．２?＇?、、？、??ａ。ｉｉｉｉｉ川??Ｍ８ＩＫＫＳＬＬＬＭ３ＬＴＴＦＷ?Ｉ?ＰＩ：?Ｉ８?８Ａ?Ｅ８ＮＳＨＭＯＹＩ?ＯＳＰＰＳＲＡ?ＬＬＣ８Ｔ?ＲＩ?８１ＮＫＮＣＱＰＩ?ＭＹＥＰＱ８Ｖ?ＥＯＰＫＯＦ?ｆ??０?１０?２０?３０?４０?ＳＯ?６０?７０??Ｐｏｓｉｔｉｏｎ??圖２＿６各蛋白質(zhì)信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果??Ｆｉｇ．?２－６?Ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｓｉｇｎａｌ?ｐｅｐｔｉｄｅ?ｉｎ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ??Ａ：?ＡＶＣｈｉ６０；?Ｂ：?ＡＶＣｈｉ７０；?Ｃ：?ＡＶＣｈｉｌＯｌ；?Ｄ：?ＡＶＣｈｉ２５；?Ｅ：?ＡＶＣＢＰ??通過?ＮＣＢＩ?Ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ?Ｄｏｍａｉｎ?Ｓｅａｒｃｈ?工具分別對(duì)?Ａ＞ｚ－Ｃｈｉ６０、Ａ＞？－Ｃｈｉ７０、Ｊｆｔ－ＣｈｉｌＯｌ?ｗ＼＞？－Ｃｈｉ２５??和辦－ＣＢＰ五種蛋白質(zhì)的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)ＡＶＣｈｉ６０只包含一個(gè)ＧＨＩ８－ｃｈｉｔｉｎａｓｅ－ｌｉｋｅ??ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ結(jié)構(gòu)域；ＡＶＣｈｉ７０只包含一個(gè)ＧＨ丨８－ｃｈｉｔｉｎａｓｅ結(jié)構(gòu)域；Ａ＞？－Ｃｈｉ２５僅包含一個(gè)??Ｇｌｙｃｏ－ｈｙｄｒｏ－２０ｂ?ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ?結(jié)構(gòu)域；ＡＶＣＢＰ?僅含有一個(gè)?ＬＰＭＯ－１０?ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ?結(jié)構(gòu)域；??１９??

?河北農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位（畢業(yè)）論文???Ｘ？－Ｃｈｉ?１０１蛋白包含４個(gè)保守結(jié)構(gòu)域，分別為Ｎ端的ＣＨＢ－ＨＥＸ結(jié)構(gòu)域，中間區(qū)的Ｇｌｙｃｏ－ｈｙｄｒｏ－２０ｂ??ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ結(jié)構(gòu)域和ＧＨ２０－Ｓｍ－ｃｈｉｔｏｂｉａｓｅ－ｌｉｋｅ結(jié)構(gòu)域以及Ｃ端的ＣＨＢ－ＨＥＸ－Ｃ結(jié)構(gòu)域。各蛋白??質(zhì)的結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)圖如圖２－７所示。??？Ｊ＞ｊ－Ｃｈｉ６０?ＧＨＩＳ－ｃｈｉｔｉｌｉａｓｅ－ｌＯｃｅ?二＾??－８ｊ－Ｃｈｔ７０?ＧＨ１８－ｃｌｉｉｔｉｎａｓｅ?二＾）??＊？ｎ－Ｃｌｉｉ２５??Ｇｉｙｃｏ－ｈｙｄｒｏ－２０ｂ?ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ??．？ｊ－ＣＢＰ?號(hào)ＬＰＭＯ－ＩＯ?ｓｕｐｅｒｆａｍｉｉｙ?￣＾＞??．＆－ＣＩｉｉｌ０１?號(hào)ＣＨＢ－ＨＥ＾）（＾Ｓｔｙｃｏ￣ｈｙｄｒｏ￣＿２０ｂ?ｓｕｐｅｒｆａｍｉｉｙ．?ｙＸ＾Ｈ２０－Ｓｍ￣ｃｈｉｔｏｂ；ａｓｅ－ｌｉｋ（）（＾＾ＨＢ－ＨＥＸ＾Ｃｒ＾??圖２－７各蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)示意圖??Ｆｉｇ．?２－７?Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｅａｃｈ?ｐｒｏｔｅｉｎ??２．３．３幾丁質(zhì)酶和幾丁質(zhì)結(jié)蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)??通過在線程序ＰＳＩｐｒｅｄ對(duì)辦－Ｃｈｉ６０、Ｋｈｉ７０、Ｘ？－Ｃｈｉ〗０１、辦－Ｃｈｉ２５和Ｘｎ－ＣＢＰ五種蛋白??質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析，結(jié)果表明，Ｘ？－Ｃｈｉ６０含有１９個(gè)ａ螺旋，含有１４個(gè)ｐ折疊（圖２－８）?；?Ｘ？－Ｃｈｉ７０??含有２４個(gè)ａ螺旋和２０個(gè)ｐ折疊（圖２－９）?；?Ｚ？－Ｃｈｉｌ０１含有２５個(gè)ｏｔ螺旋和３６個(gè)ｐ折疊（圖２－１０）；??Ｘ？－Ｃｈｉ２５含有８?jìng)�(gè)ａ螺旋和６個(gè)ｐ折疊（圖２－丨１?）；ＪＴ？－ＣＢＰ含有４個(gè)ａ螺旋和７個(gè)ｐ折疊（圖２－１２）。??

【參考文獻(xiàn)】：
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