發(fā)布時間：2021-07-30 05:36

　　禽流感病毒（Avian Influenza Virus,AIV）是分節(jié)段的單股負鏈RNA病毒,屬于正黏病毒科（Orthomyxoviride）A型流感病毒（Infuenza A Virus,IAV）。該病毒極易變異且具有感染禽類和哺乳動物的能力。野生鳥類特別是雁形目水鳥作為禽流感病毒的自然宿主,在禽流感病毒的感染和傳播方面扮演著重要角色。本研究于2014年10月-2015年3月,在上海浦東東灘濕地、湖南東洞庭湖濕地和貴州草海濕地共采集雁形目水鳥咽肛拭樣656份,糞便1473份。使用MagMAXTTM Pathogen RNA/DNA Kit試劑盒抽提病毒RNA,使用實時定量熒光RT-PCR對流感病毒的M基因進行檢測以篩查陽性樣本,然后對陽性樣本進行亞型鑒定和物種鑒定,并選取代表毒株進行全基因組測序。通過后期數(shù)據(jù)分析,對不同樣本采集地的病毒感染狀況、代表毒株的致病性、核苷酸同源性及系統(tǒng)進化關(guān)系進行梳理,并探討了候鳥遷徙與病毒傳播的關(guān)系,主要結(jié)果整理如下:1.樣本采集及病毒感染情況2014年10-11月,本研究于浦東東灘濕地采集雁形目水鳥11種326只次,獲得咽肛拭樣656份,陽性率為40... 

【文章來源】：華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：114 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 流感病毒概述
        1.1.1 分類與命名
        1.1.2 形態(tài)結(jié)構(gòu)與化學(xué)組成
        1.1.3 抗原變異與分子進化
    1.2 野生鳥類與禽流感病毒
        1.2.1 野生鳥類禽流感病毒概述
        1.2.2 野生鳥類禽流感病毒監(jiān)測
        1.2.3 禽流感病毒與雁形目水鳥
        1.2.4 候鳥遷徙與病毒傳播
    1.3 本研究的目標與意義
    1.4 本研究創(chuàng)新點
    1.5 技術(shù)路線
第二章 禽流感樣本采集及病毒感染情況
    2.1 研究背景
        2.1.1 浦東東灘濕地概況及當?shù)匾傍B禽流感研究
        2.1.2 東洞庭湖濕地概況及當?shù)匾傍B禽流感研究
        2.1.3 草海濕地概況及當?shù)匾傍B禽流感研究
    2.2 研究方法
        2.2.1 樣本采集
        2.2.2 病毒RNA抽提
        2.2.3 實時熒光定量PCR (Real-time RT-PCR)
        2.2.4 一步法(One Step)RT-PCR
        2.2.5 PCR
        2.2.6 糞便樣本的物種鑒定
        2.2.7 PCR產(chǎn)物鑒定
        2.2.8 凝膠回收
        2.2.9 測定凝膠回收產(chǎn)物濃度
        2.2.10 測序
    2.3 研究結(jié)果
        2.3.1 浦東東灘濕地禽流感病毒感染情況
        2.3.2 東洞庭濕地禽流感病毒感染情況
        2.3.3 草海濕地禽流感病毒感染情況
    2.4 討論
        2.4.1 浦東東灘濕地禽流感病毒感染情況
        2.4.2 東洞庭湖與草海濕地禽流感病毒感染情況
        2.4.3 病毒陽性率的差異
    2.5 本章小結(jié)
第三章 禽流感病毒氨基酸序列特異性位點分析
    3.1 研究背景
        3.1.1 氨基酸序列位點與宿主特異性
        3.1.2 氨基酸序列位點與致病性
    3.2 研究方法
    3.3 研究結(jié)果
        3.3.1 裂解位點、受體結(jié)合位點及耐藥位點分析
        3.3.2 潛在糖基化位點分析
    3.4 討論
        3.4.1 HA蛋白與宿主特異性/致病性
        3.4.2 NA蛋白與致病性
        3.4.3 其他蛋白與致病性
    3.5 本章小結(jié)
第四章 禽流感病毒序列同源性與系統(tǒng)進化分析
    4.1 研究背景
        4.1.1 H5亞型病毒流行情況
        4.1.2 H6亞型病毒流行情況
        4.1.3 H9亞型病毒流行情況
        4.1.4 H8、H11和H12亞型病毒流行情況
    4.2 研究方法
    4.3 研究結(jié)果
        4.3.1 禽流感病毒序列同源性分析
        4.3.2 禽流感病毒系統(tǒng)進化分析
    4.4 討論
        4.4.1 代表毒株的基因來源
        4.4.2 候鳥遷徙與病毒傳播
    4.5 本章小結(jié)
第五章 結(jié)論與展望
    5.1 結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻
附錄1 實驗材料
附錄2 野外采樣照片
博士期間科研成果
致謝



本文編號：3310804