發(fā)布時(shí)間：2021-07-19 17:43

　　高密度遺傳圖譜和數(shù)量性狀位點(diǎn)（Quantitative trait locus,QTL）定位是基因組學(xué)和分子育種研究的有力工具。桉樹(shù)是全球范圍內(nèi)廣泛種植的闊葉樹(shù)種。本研究致力于桉樹(shù)遺傳圖譜構(gòu)建和重要性狀的QTL定位,作圖樹(shù)種為尾葉桉（Eucalyptus urophylla）和細(xì)葉桉（E.tereticornis）,作圖標(biāo)記包括多態(tài)性陣列技術(shù)（Diversity array technology,DAr T）以及基于表達(dá)序列標(biāo)簽（Expressed sequence tag,EST）的簡(jiǎn)單序列重復(fù)（Simple sequence repeat,SSR,也稱微衛(wèi)星）、插入/缺失（Insert-Deletion,In Del）、切割擴(kuò)增多態(tài)性序列（Cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS）和單核苷酸多態(tài)性（Single nucleotide polymorphism,SNP）,QTL定位的性狀包括樹(shù)高、胸徑、木材基本密度和纖維素含量。主要內(nèi)容如下:（1）尾葉桉和細(xì)葉桉樹(shù)高、胸徑和木材密度的初步定位。對(duì)于樹(shù)高（10、23、32、44和56月生）、... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】：142 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 引言
        1.1.1 研究背景
        1.1.2 研究的目的和意義
        1.1.3 項(xiàng)目來(lái)源和經(jīng)費(fèi)支持
    1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢(shì)
        1.2.1 桉樹(shù)簡(jiǎn)介
        1.2.2 分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展
        1.2.3 分子標(biāo)記在桉樹(shù)遺傳育種中的應(yīng)用
        1.2.4 桉樹(shù)遺傳圖譜
        1.2.5 QTL定位
    1.3 研究目標(biāo)和主要研究?jī)?nèi)容
        1.3.1 研究目標(biāo)
        1.3.2 主要研究?jī)?nèi)容
        1.3.3 擬解決的重點(diǎn)問(wèn)題
    1.4 研究技術(shù)路線
第二章 桉樹(shù)生長(zhǎng)和木材密度QTL的初步定位
    2.1 材料與方法
        2.1.1 作圖群體與大田試驗(yàn)建立
        2.1.2 分子標(biāo)記與遺傳圖譜
        2.1.3 試驗(yàn)方法
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1.表型分析
        2.2.2 QTL分析
        2.2.3 QTL置信區(qū)間內(nèi)的位置候選基因
    2.3 討論
    2.4 結(jié)論
第三章 桉樹(shù)EST-InDel標(biāo)記開(kāi)發(fā)：遺傳作圖和物理定位
    3.1 材料與方法
        3.1.1 植物材料和DNA提取
        3.1.2 EST-InDel的開(kāi)發(fā)
        3.1.3 跨種擴(kuò)增和多態(tài)性估算
        3.1.4 與巨桉基因組比對(duì)
        3.1.5 EST-InDel標(biāo)記整合到現(xiàn)有的尾葉桉和細(xì)葉桉遺傳圖譜
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 EST-InDel標(biāo)記的開(kāi)發(fā)和多態(tài)性
        3.2.2 種間通用性研究
        3.2.3 EST-InDels標(biāo)記的物理定位
        3.2.4 EST-InDel標(biāo)記的遺傳作圖
    3.3 討論
        3.3.1 InDel標(biāo)記開(kāi)發(fā)與種間通用性
        3.3.2 InDel標(biāo)記與巨桉基因組比對(duì)及遺傳作圖
    3.4 結(jié)論
第四章 桉樹(shù)EST-SNP標(biāo)記開(kāi)發(fā)及高密度、高分辨率轉(zhuǎn)錄子連鎖圖譜構(gòu)建
    4.1 材料與方法
        4.1.1 植物材料與DNA提取
        4.1.2 EST-SNP標(biāo)記的發(fā)現(xiàn)與序列確認(rèn)
        4.1.3 SNP位點(diǎn)選擇與芯片設(shè)計(jì)
        4.1.4 SNP分型
        4.1.5 遺傳圖譜構(gòu)建
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 引物設(shè)計(jì)與PCR條件優(yōu)化
        4.2.2 PCR產(chǎn)物驗(yàn)證與芯片SNP選擇
        4.2.3 新開(kāi)發(fā)SNP標(biāo)記的功能注釋
        4.2.4 GoldenGate分型實(shí)驗(yàn)
        4.2.5 標(biāo)記分離分析
        4.2.6 遺傳圖譜構(gòu)建
    4.3 討論
        4.3.1 SNP標(biāo)記開(kāi)發(fā)
        4.3.2 分型成功率
        4.3.3 尾葉桉和細(xì)葉桉遺傳圖譜
        4.3.4 偏分離標(biāo)記
    4.4 結(jié)論
第五章 桉樹(shù)生長(zhǎng)、木材基本密度和纖維素含量QTL定位
    5.1 材料與方法
        5.1.1 植物材料與遺傳圖譜
        5.1.2 表型數(shù)據(jù)測(cè)量與分析
        5.1.3 QTL定位
        5.1.4 與巨桉基因組比對(duì)查找候選基因
        5.1.5 與初步定位QTL位點(diǎn)比較
    5.2 結(jié)果與分析
        5.2.1 表型性狀分析
        5.2.2 表型性狀QTL分析
        5.2.3 置信區(qū)間內(nèi)的候選基因
        5.2.4 與初步QTL定位結(jié)果比較
    5.3 討論
    5.4 結(jié)論
第六章 結(jié)論與討論
    6.1 結(jié)論
    6.2 討論
    6.3 研究意義與應(yīng)用潛力
    6.4 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
在讀期間的學(xué)術(shù)研究
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]桉樹(shù)扦插生根和生長(zhǎng)性狀的QTL定位[J]. 于曉麗,李發(fā)根,翁啟杰,周長(zhǎng)品,甘四明.  林業(yè)科學(xué)研究. 2011(02)
[2]數(shù)量性狀基因定位研究中若干常見(jiàn)問(wèn)題的分析與解答[J]. 李慧慧,張魯燕,王建康.  作物學(xué)報(bào). 2010(06)
[3]林木根系研究綜述[J]. 宋維峰,王希群.  西南林學(xué)院學(xué)報(bào). 2007(05)
[4]分子生物學(xué)技術(shù)在桉樹(shù)育林中的應(yīng)用[J]. 甘四明,李發(fā)根,白嘉雨.  廣西林業(yè)科學(xué). 2006(04)
[5]尾葉桉×細(xì)葉桉雜種無(wú)性系扦插生根和生長(zhǎng)性狀的研究[J]. 甘四明,李梅,李發(fā)根,吳坤明,吳菊英,盧國(guó)桓,白嘉雨.  林業(yè)科學(xué)研究. 2006(02)
[6]表達(dá)序列標(biāo)簽（EST）分析及其在林木研究中的應(yīng)用[J]. 李虹,盧孟柱,蔣湘寧.  林業(yè)科學(xué)研究. 2004(06)
[7]27種引種桉樹(shù)的園藝觀賞價(jià)值[J]. 董靜曦,吳赤衛(wèi).  云南林業(yè)科技. 2003(04)
[8]桉樹(shù)嫩枝扦插育苗技術(shù)研究[J]. 莫曉勇,龍騰,彭仕堯,陳文平.  中南林學(xué)院學(xué)報(bào). 2002(04)
[9]植物QTL定位方法的研究進(jìn)展[J]. 高用明,朱軍.  遺傳. 2000(03)
[10]遺傳標(biāo)記的發(fā)展[J]. 周延清.  生物學(xué)通報(bào). 2000(05)

博士論文
[1]小麥遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及主要農(nóng)藝和品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 王霖.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]桉樹(shù)雜種無(wú)性系紙漿材性狀的遺傳與環(huán)境效應(yīng)研究[D]. 羅建中.南京林業(yè)大學(xué) 2012
[3]尾葉桉和細(xì)葉桉STS標(biāo)記連鎖圖譜構(gòu)建及生長(zhǎng)性狀QTL定位研究[D]. 李發(fā)根.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2010

碩士論文
[1]桉樹(shù)遺傳圖譜的EST-CAPS標(biāo)記整合及生長(zhǎng)和扦插性狀的QTL定位[D]. 于曉麗.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2012
[2]桉樹(shù)木質(zhì)素合成途徑兩個(gè)關(guān)鍵基因的克隆與功能研究[D]. 黃青云.中南林業(yè)科技大學(xué) 2010
[3]桉樹(shù)EST-SNP的開(kāi)發(fā)及EST圖譜構(gòu)建[D]. 張曉紅.南京林業(yè)大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3291140