蓮的花器官瓣化分子調(diào)控機制的研究
發(fā)布時間:2021-07-10 04:15
蓮屬于蓮科、蓮屬,是多年生的基部雙子葉水生植物。蓮屬包含有兩個種:亞洲蓮和美洲黃蓮。其中,亞洲蓮就是我們通常所稱的蓮。中國是蓮的分布中心和栽培中心之一。蓮是重要的觀賞水生植物,又稱為荷花,是中國傳統(tǒng)十大名花之一,其觀賞價值很大程度上取決于絢麗的花色和多樣的花型;ㄐ偷臎Q定因素包括花器官形態(tài),特別是花瓣的組成、數(shù)量、大小和形狀等。類花瓣性狀是觀賞植物育種中選擇的重要特征之一。一些花蓮品種在花發(fā)育過程,雄蕊和心皮會發(fā)生瓣化現(xiàn)象,形成重瓣花型,極大地提高了蓮的觀賞價值。因此,重瓣花品種的選育,是花蓮育種的重要目標之一。然而,目前對蓮的雄蕊瓣化和心皮瓣化的分子機理知之甚少。開展蓮雄蕊瓣化和心皮瓣化機理的研究,充分發(fā)掘蓮中控制花型的優(yōu)異基因資源,對于培育觀賞型的花蓮新品種具有重要意義。本研究通過多組學技術(shù)(轉(zhuǎn)錄組、蛋白組及全基因組DNA甲基化)對蓮的花器官瓣化現(xiàn)象進行了系統(tǒng)的研究,并對花器官發(fā)育相關(guān)的重要基因家族MADS-box基因家族進行了分析鑒定。挖掘出部分可能參與調(diào)控蓮花器官瓣化的關(guān)鍵基因。同時,選取蓮的SEP3基因在擬南芥中過表達,其過表達植株影響開花時間及花形態(tài)。這些為蓮的花器官瓣化機...
【文章來源】:中國科學院大學(中國科學院武漢植物園)湖北省
【文章頁數(shù)】:152 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1擬南芥中花四聚體模型和花發(fā)育ABCDE模型(改自TheiBenetal.,2016)??
肴??蜃椋模危良諄???戲治雋?男廴鋨昊?芯浚崳?出了一系列具有不同花形態(tài)的花蓮品種。其中,熱帶品種‘粉紅凌霄’,擁有變??態(tài)的花器官,其絕大多數(shù)雄蕊轉(zhuǎn)變成了類似花瓣器官(圖2.1B-F)。與‘中國古??代蓮’相比,‘粉紅凌霄’有更多的花瓣和較少的雄蕊。它的變異器官稱作雄蕊??瓣化,類似花瓣但也有雄蕊附屬物(圖2.1F)。這個特征提供了很好的一個研宄??雄蕊瓣化的模型。??mi??I?ff?r??mm??圖2.1蓮花形態(tài)圖??(A)中國古代蓮的花。(B)和(C)?‘粉紅凌霄’的花苞。(D)?‘粉紅凌霄’開花第一天。??(E)?‘粉紅凌霄'開花第四天。(F)三個花器官分別為雄蕊(St)、瓣化雄蕊(Sp)和花瓣??(P)。所有標尺長為lcm。??Figure?2.1?Sacred?lotus?flower??(A)?Flower?of?'China?antique,.?(B)?and?(C)?Flower?bud?of?1Fenhonglingxiao,.?(D)?Flower?of??‘Fenhonglingxiao’?at?the?first?day?of?blossom.?(E)?Flower?of‘Fenhonglingxiao’?at?the?fourth?day?of??blossom.?I?represents?Petal?(P);?II?represents?Stamen?(St);?III?represents?carpel;?IV?represents??Stamen?petaloid?(Sp).?(F)?Three?floral?organs
2.2.2?mRNAIUuminaHiSeq?測序結(jié)果??為了研究雄蕊瓣化的分子機制,對花瓣(P)、瓣化雄蕊(Sp)和雄蕊(St)??進行了轉(zhuǎn)錄組測序。在花朵開放的第一天(圖2.1D),收集花器官花瓣、瓣化雄??蕊和雄蕊。每個樣品三次重復,然后建立9個文庫分別是PI、P2、P3,?Spl、Sp2、??Sp3和Stl、St2、St3。9個文庫經(jīng)測序產(chǎn)生了?75.35?Gb的clean?data。選擇其中??高質(zhì)量(Q>20)的讀長73.11Gb,每個樣品有超過6.51Gb的cleandata作為后??續(xù)分析數(shù)據(jù)。本研究分析每個樣品轉(zhuǎn)錄本的數(shù)目及其FPKMs值(圖2.2A)。剔??除標準化reads的FPKM小于0.5的基因,樣品總共檢測到27053個轉(zhuǎn)錄本。大??約有33%的基因表達FPKM在0.5-10范圍,而FPKM>10的基因有36%。82.72-??86.46%的短clean?reads能比對到‘中國古代蓮’參考基因組上(Ming?et?al.,?2013)。??其中
【參考文獻】:
期刊論文
[1]荷花由單瓣到千瓣的演化及調(diào)控機制探討[J]. 秦密,劉鳳欒,張大生,田代科. 自然雜志. 2018(03)
[2]Whole genome re-sequencing reveals evolutionary patterns of sacred lotus(Nelumbo nucifera)[J]. Longyu Huang,Mei Yang,Ling Li,Hui Li,Dong Yang,Tao Shi,Pingfang Yang. Journal of Integrative Plant Biology. 2018(01)
[3]蓮NnFUL基因克隆、亞細胞定位及表達分析[J]. 陳岳,張微微,田代科,王金剛. 上海農(nóng)業(yè)學報. 2015(04)
[4]荷花LEAFY基因的克隆及表達分析[J]. 劉藝平,董姬秀,張曼,李創(chuàng),李娜,孔德政. 植物生理學報. 2014(02)
[5]重瓣和重臺蓮品種花芽分化過程的解剖結(jié)構(gòu)比較[J]. 姜莉,陳發(fā)棣,滕年軍,陳素梅,崔娜欣,顧俊杰. 園藝學報. 2009(08)
[6]重瓣花的形成機理及遺傳特性研究進展[J]. 趙印泉,劉青林. 西北植物學報. 2009(04)
[7]The Expression of Manganese Superoxide Dismutase Gene from Nelumbo nucifera Responds Strongly to Chilling and Oxidative Stresses[J]. Wen Li1,Lin Qi1,Xiaodong Lin1,Huhui Chen1,Zhanqi Ma1,Keqiang Wu2 and Shangzhi Huang1(1School of Life Sciences,Sun Yat-sen University,Guangzhou 510275,China;2Institute of Plant Biology,School of Life Sciences,National Taiwan University,Taipei 106,China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(03)
[8]花發(fā)育的基因調(diào)控與花性狀的改造[J]. 華志明. 生物技術(shù)通報. 1998(01)
博士論文
[1]蓮葉綠體基因組圖譜的構(gòu)建及其系統(tǒng)進化分析[D]. 全志武.武漢大學 2011
本文編號:3275166
【文章來源】:中國科學院大學(中國科學院武漢植物園)湖北省
【文章頁數(shù)】:152 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1擬南芥中花四聚體模型和花發(fā)育ABCDE模型(改自TheiBenetal.,2016)??
肴??蜃椋模危良諄???戲治雋?男廴鋨昊?芯浚崳?出了一系列具有不同花形態(tài)的花蓮品種。其中,熱帶品種‘粉紅凌霄’,擁有變??態(tài)的花器官,其絕大多數(shù)雄蕊轉(zhuǎn)變成了類似花瓣器官(圖2.1B-F)。與‘中國古??代蓮’相比,‘粉紅凌霄’有更多的花瓣和較少的雄蕊。它的變異器官稱作雄蕊??瓣化,類似花瓣但也有雄蕊附屬物(圖2.1F)。這個特征提供了很好的一個研宄??雄蕊瓣化的模型。??mi??I?ff?r??mm??圖2.1蓮花形態(tài)圖??(A)中國古代蓮的花。(B)和(C)?‘粉紅凌霄’的花苞。(D)?‘粉紅凌霄’開花第一天。??(E)?‘粉紅凌霄'開花第四天。(F)三個花器官分別為雄蕊(St)、瓣化雄蕊(Sp)和花瓣??(P)。所有標尺長為lcm。??Figure?2.1?Sacred?lotus?flower??(A)?Flower?of?'China?antique,.?(B)?and?(C)?Flower?bud?of?1Fenhonglingxiao,.?(D)?Flower?of??‘Fenhonglingxiao’?at?the?first?day?of?blossom.?(E)?Flower?of‘Fenhonglingxiao’?at?the?fourth?day?of??blossom.?I?represents?Petal?(P);?II?represents?Stamen?(St);?III?represents?carpel;?IV?represents??Stamen?petaloid?(Sp).?(F)?Three?floral?organs
2.2.2?mRNAIUuminaHiSeq?測序結(jié)果??為了研究雄蕊瓣化的分子機制,對花瓣(P)、瓣化雄蕊(Sp)和雄蕊(St)??進行了轉(zhuǎn)錄組測序。在花朵開放的第一天(圖2.1D),收集花器官花瓣、瓣化雄??蕊和雄蕊。每個樣品三次重復,然后建立9個文庫分別是PI、P2、P3,?Spl、Sp2、??Sp3和Stl、St2、St3。9個文庫經(jīng)測序產(chǎn)生了?75.35?Gb的clean?data。選擇其中??高質(zhì)量(Q>20)的讀長73.11Gb,每個樣品有超過6.51Gb的cleandata作為后??續(xù)分析數(shù)據(jù)。本研究分析每個樣品轉(zhuǎn)錄本的數(shù)目及其FPKMs值(圖2.2A)。剔??除標準化reads的FPKM小于0.5的基因,樣品總共檢測到27053個轉(zhuǎn)錄本。大??約有33%的基因表達FPKM在0.5-10范圍,而FPKM>10的基因有36%。82.72-??86.46%的短clean?reads能比對到‘中國古代蓮’參考基因組上(Ming?et?al.,?2013)。??其中
【參考文獻】:
期刊論文
[1]荷花由單瓣到千瓣的演化及調(diào)控機制探討[J]. 秦密,劉鳳欒,張大生,田代科. 自然雜志. 2018(03)
[2]Whole genome re-sequencing reveals evolutionary patterns of sacred lotus(Nelumbo nucifera)[J]. Longyu Huang,Mei Yang,Ling Li,Hui Li,Dong Yang,Tao Shi,Pingfang Yang. Journal of Integrative Plant Biology. 2018(01)
[3]蓮NnFUL基因克隆、亞細胞定位及表達分析[J]. 陳岳,張微微,田代科,王金剛. 上海農(nóng)業(yè)學報. 2015(04)
[4]荷花LEAFY基因的克隆及表達分析[J]. 劉藝平,董姬秀,張曼,李創(chuàng),李娜,孔德政. 植物生理學報. 2014(02)
[5]重瓣和重臺蓮品種花芽分化過程的解剖結(jié)構(gòu)比較[J]. 姜莉,陳發(fā)棣,滕年軍,陳素梅,崔娜欣,顧俊杰. 園藝學報. 2009(08)
[6]重瓣花的形成機理及遺傳特性研究進展[J]. 趙印泉,劉青林. 西北植物學報. 2009(04)
[7]The Expression of Manganese Superoxide Dismutase Gene from Nelumbo nucifera Responds Strongly to Chilling and Oxidative Stresses[J]. Wen Li1,Lin Qi1,Xiaodong Lin1,Huhui Chen1,Zhanqi Ma1,Keqiang Wu2 and Shangzhi Huang1(1School of Life Sciences,Sun Yat-sen University,Guangzhou 510275,China;2Institute of Plant Biology,School of Life Sciences,National Taiwan University,Taipei 106,China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(03)
[8]花發(fā)育的基因調(diào)控與花性狀的改造[J]. 華志明. 生物技術(shù)通報. 1998(01)
博士論文
[1]蓮葉綠體基因組圖譜的構(gòu)建及其系統(tǒng)進化分析[D]. 全志武.武漢大學 2011
本文編號:3275166
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