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利用基因重測(cè)序和蛋白質(zhì)含量探析栽培大麥的起源與馴化

發(fā)布時(shí)間:2021-03-21 04:32
  大麥?zhǔn)鞘澜缟献罟爬、分布種植最廣、經(jīng)濟(jì)價(jià)值極高的谷類作物之一,其產(chǎn)量和面積在禾本科作物中一直居第四位。高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、多抗一直是大麥遺傳改良的主要目標(biāo),然長(zhǎng)期的馴化選擇,特別是經(jīng)過(guò)近代育種和集約化種植,使得大麥不少有益等位基因丟失,遺傳多樣性明顯降低,出現(xiàn)了遺傳基礎(chǔ)狹窄和基因同質(zhì)化等問(wèn)題,已成為實(shí)現(xiàn)主要育種目標(biāo)的瓶頸。一年生野生大麥(Hordeum vulgare ssp.spontaneum)是栽培大麥(Hordeum vulgare ssp.vulgare)的祖先,具有廣闊的自然分布和生態(tài)適應(yīng)性。一直以來(lái),一年生野生大麥因其豐富的自然變異與遺傳多樣性,以及與栽培大麥無(wú)生殖隔離,被認(rèn)為是栽培大麥性狀改良的初級(jí)基因庫(kù)。充分利用野生種群中的有利基因變異在某種程度上不僅取決于對(duì)野生種群遺傳結(jié)構(gòu)的了解,包括確定有哪些野生祖先或者野生祖先的哪些部分對(duì)馴化后代有什么樣的遺傳貢獻(xiàn),而且取決于對(duì)現(xiàn)有馴化后代遺傳基礎(chǔ)和遺傳背景的認(rèn)識(shí)。大麥的馴化傳播一直是學(xué)術(shù)界的熱點(diǎn)問(wèn)題之一,時(shí)至今日仍然存在著爭(zhēng)議。本研究以不同地理來(lái)源的野生大麥和遍布世界范圍的栽培大麥為研究對(duì)象,通過(guò)基因重測(cè)序和馴化相關(guān)性狀-蛋白質(zhì)含量的... 

【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:130 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

利用基因重測(cè)序和蛋白質(zhì)含量探析栽培大麥的起源與馴化


野生大麥(B、D)和栽培大麥(A、C、E)小穗形態(tài)多樣性(引自PourkheirandishandKomatsuda2007)

模式圖,大麥,地理,群體


麥群體中具有不同的頻率。例如,Hap1主要分布在西南亞野生大麥群體中(0.264),在北美和歐洲栽培大麥中分布極少(0.063和0.10),而在其他大麥群體中則完全缺失。又如,在北美栽培大麥中,Hap7是最主要的單倍型,而其余兩種單倍型Hap1和Hap2則分布很少,它們各自占北美總供試大麥的87.5%,6.3%和6.3%。另外,結(jié)果顯示,低頻或稀有單倍型具有明顯的地理特征,都僅存在于某個(gè)特定的地理區(qū)域內(nèi)。例如Hap3(0.075),Hap5(0.057),和Hap6(0.057)僅存在于西南亞野生大麥中;Hap8和Hap10僅在西藏野生大麥群體中出現(xiàn)(表3.2,圖3.1)。不同單倍型的序列組成見(jiàn)附錄3-圖S1。圖3.1野生大麥和栽培大麥群體在世界上的地理分布模式NAM-1單倍型在不同地理區(qū)域的分布及頻率;單倍型以不同顏色標(biāo)注,其頻率在餅圖中以相應(yīng)比例表示Fig3.1GeographicdistributionofwildandcultivatedbarleypopulationsNAM-1haplotypefrequenciesamongninegeographicregionsweredisplayedinpiediagramsandtheexactproportionsofeacharegiveninpercentbythecorrespondingcolourcode

基因,大麥,類群


華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2019屆博士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文44圖3.2基于NAM-1基因的系統(tǒng)發(fā)育分析主要分為兩大類群:野生類群(綠色分枝)和栽培類群(紅色分枝);不同大麥群體縮寫同表3.2Fig.3.2Phylogenetictreeof214barleyaccessionsbasedontheNAM-1geneTwomajorclusters,onecomprisedofamajorityofwildbarleyaccessions(representedingreenbar)andanothercomprisedofamajorityofcultivatedbarleyaccessions(representedinredbar)areseparated.AbbreviationsofdifferentbarleypopulationsarethesameasshowninTable3.23.1.4蛋白質(zhì)含量(GPC)的差異分析如圖3.3所示,蛋白質(zhì)在不同地理來(lái)源的大麥群體中的平均含量不同。鑒定的118份栽培大麥和93份野生大麥的GPC在6.73~12.35%之間,平均為9.43%。總體而言,野生大麥的平均GPC(10.44%)要高于栽培大麥。其中,西南亞野生大麥和中亞野生大麥的GPC均高于所有不同地理分布的栽培大麥,并且存在顯著性差異。


本文編號(hào):3092331

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