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水稻品種抗稻瘟病等位基因鑒定及抗瘟新基因的定位和克隆

發(fā)布時間:2019-07-08 21:20
【摘要】:水稻是全世界最重要的糧食作物之.。在水稻生產(chǎn)中,病害的發(fā)生是威脅生產(chǎn)的重要問題。由真菌灰色巨角間座殼菌(Magnaporthe grisea)引起的稻瘟病作為最主要的病害之一,廣泛發(fā)生于全世界各水稻產(chǎn)區(qū)。在我國稻瘟病位于水稻上三大病害之首,嚴(yán)重危害時致使水稻產(chǎn)量損失嚴(yán)重,尤其在晨露時間較長的丘陵地區(qū)或山區(qū)甚至經(jīng)常出現(xiàn)絕收的現(xiàn)象,多年來一直是我國水稻產(chǎn)量及糧食安全的嚴(yán)重威脅。生產(chǎn)實踐證明,培育持久抗性品種是稻瘟病防控的首要措施。本文通過對水稻主栽品種及育種親本的抗瘟基因型進(jìn)行鑒定,并通過對水稻品種抗稻瘟病新基因Pi65(t)的精細(xì)定位、克隆和載體構(gòu)建,以期了解不同抗病基因在品種中的分布,為抗病品種選育及品種布局提供理論依據(jù)。1.遼寧省主栽水稻品種抗稻瘟病的等位基因型鑒定研究選取了遼寧省24份水稻材料,根據(jù)9個抗稻瘟病基因的保守區(qū)設(shè)計引物,擴(kuò)增各品種的編碼區(qū)序列,對擴(kuò)增子序列進(jìn)行對比分析,鑒定各基因在24個品種中的分布情況,并對部分抗病等位基因進(jìn)行了功能驗證。結(jié)果表明:遼寧省24個主栽水稻品種均不攜帶Pi36、Pi37、Pi21、Pit及其抗病等位基因,而Pid2、Pid3、Pita、Piz-t和Pil/Piks/Pikm/Pikp在24個品種中以不同突變類型及不同頻率出現(xiàn),其中,在2個品種中檢測到Pid2的抗病等位基因及Pid3的抗病等位基因;4個品種檢測到Pita的抗病等位基因,Pita的等位基因中新發(fā)現(xiàn)的幾處堿基突變并未影響抗病基因的功能;所有品種中均無與Pik及其復(fù)等位基因完全一致的序列,但利用攜帶AVR-Pik的稻瘟病菌接種鑒定結(jié)果表明,遼粳454和沈農(nóng)265攜帶的Pik等位基因可能仍具有抗病基因功能;在品種中檢測到19種Piz-t的等位基因,接種結(jié)果表明大部分突變位點均使Piz-t的等位基因喪失了抗病功能。2.港育129品種抗稻瘟病新基因Pi65(t)的精細(xì)定位利用遼寧省采集的稻瘟病群體,對遼寧省110份水稻材料進(jìn)行抗譜分析,結(jié)果篩選出連續(xù)兩年在田間表現(xiàn)高抗(港育129)、高感(遼星1號)的品種,經(jīng)基因型鑒定分析,高抗品種中不含有任何已知的抗病基因。利用港育129和遼星1號構(gòu)建DH群體,通過SLAF-seq技術(shù)將候選區(qū)域定位至30.42-30.98M之間,繼續(xù)通過在BC1F2代群體中篩選性狀分離的個體(重組體),將候選基因進(jìn)一步定位至30.42-30.85M之間,該區(qū)間內(nèi)有21個基因,通過RT-PCR分析其中有4個基因在港源8號和遼星1號之間表達(dá)存在差異。而且在港育129接種稻瘟病菌后,4個基因表達(dá)量均顯升高,說明4個基因可能與水稻抗性相關(guān)。4個基因分別為Os11g0691700、Os11g0691800、Os11g0691900、 Os11g0692100,均屬于NBS-LRR類。由于NBS-LRR類基因是抗稻瘟病基因中常見的類型,因此認(rèn)為這些基因很可能是在港育129中定位到的新基因。3.Pita、Pi9新等位基因及候選基因Osllg0691700的克隆和載體構(gòu)建根據(jù)基因型鑒定的結(jié)果,水稻品種遼農(nóng)979攜帶的Pi9等位基因和港源8號所攜帶的Pita等位基因,均為新的抗病等位基因。分別從兩個品種中克隆基因,并將兩個基因分別連接至表達(dá)載體;利用SLAF-seq技術(shù),在品種港育129中定位到1個和抗病有關(guān)的基因Pi65(t),克隆該基因并連接至表達(dá)載體。試驗結(jié)果表明,Pi9、Pita和Pi65(t)被成功克隆并連接至表達(dá)載體。
[Abstract]:Rice is the most important food crop in the world. In the production of rice, the occurrence of diseases is an important problem in the production of rice. Magnaporthe grisea, which is caused by Magnaporthe grisea, is one of the main diseases, and is widely used in various rice-producing areas in the world. It is a serious threat to rice yield and food security for many years. The production practice shows that the cultivation of durable resistant varieties is the primary measure of the prevention and control of the rice blast. The anti-blast genotypes of the rice varieties and their parents were identified, and the fine positioning, cloning and vector construction of the new gene Pi65 (t) of the rice variety were used to understand the distribution of the different disease-resistant genes in the variety. And provides a theoretical foundation for the breeding and the variety layout of the disease-resistant variety. In this paper,24 rice materials in Liaoning province were selected according to the allele-type identification of the rice blast resistance of the main rice varieties in Liaoning province, and the coding region sequences of each variety were amplified according to the conserved region design primers of 9 blast-resistant rice blast genes, and the amplicon sequences were compared and analyzed. The distribution of each gene in 24 varieties was identified, and the functional verification of some of the disease-resistant alleles was carried out. The results showed that Pid2, Pid3, Pita, Piz-t and Pil/ Piks/ Pikp/ Pikp appeared in 24 varieties with different mutation types and different frequencies, among which, Pid2, Pid3, Pita, Piz-t and Pil/ Piks/ Pik/ Pikp appeared in 24 varieties with different mutation types and different frequencies. The resistance allele of Pid2 and the disease-resistant allele of Pid3 were detected in two varieties. Four varieties of Pita's disease-resistant allele were detected, and several base mutations in Pita's allele did not affect the function of the disease-resistant gene. No sequence of Pik and its complex allele was found in all the varieties, but the identification of the rice blast fungus carrying the AVR-Pik showed that the Pik allele carried by the Liaoning and Shennong 265 may still have the disease-resistant gene function, and the alleles of the 19 Piz-t were detected in the variety. The results showed that most of the mutant sites had a loss of resistance to the allele of Piz-t. The rice blast population collected in Liaoning province was used for the fine positioning of the new gene Pi65 (t), which was collected in Liaoning province, and the resistance spectrum of 110 rice materials in Liaoning province was analyzed. The results showed that there were high anti-blast resistance (129) and high (LiaoXing 1) variety in the field for two consecutive years. Through the genotype identification analysis, no known disease-resistant gene is contained in the high-resistant variety. The candidate genes were further located between 30.42 and 30.98M by the SLLAF-seq technique, and the candidate genes were further located between 30.42 and 30.85 M. RT-PCR was used to analyze the difference of the expression of 4 genes between the port number 8 and the Liaoxing 1. The four genes may be related to the resistance of rice. The four genes are Os11g0691700, Os11g0691800, Os11g0691900 and Os11g0692100, all of which belong to NBS-LRR. Since the NBS-LRR class gene is a common type in the rice blast resistance gene, it is considered that these genes are most likely to be the new gene located in the port culture 129.3. The cloning and vector of the Pita, Pi9 new allele and the candidate gene Osllg0691700 are based on the results of the genotype identification, The Pi9 allele and the Pita allele carried by the rice variety, Liaonon 979, were all new disease-resistant alleles. The gene is cloned from two varieties, and the two genes are respectively connected to the expression vector, and one and a disease-related gene Pi65 (t) are positioned in the variety harbor culture 129 by using the SLAF-seq technique, and the gene is cloned and connected to the expression vector. The test results showed that Pi9, Pita and Pi65 (t) were successfully cloned and ligated to the expression vector.
【學(xué)位授予單位】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S435.111.41

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本文編號:2511886

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