本文選題：禽流感病毒 + 傳播網(wǎng)絡(luò)��； 參考：《清華大學(xué)》2016年博士論文

【摘要】：自1996年后H5亞型高致病性禽流感病毒迅速在全球范圍內(nèi)廣泛傳播,并不斷進(jìn)化,世界各地的家禽產(chǎn)業(yè)遭受了巨大的損失,野生鳥類、哺乳動(dòng)物的生命也受到了嚴(yán)重威脅。因此,研究H5亞型高致病性禽流感病毒的暴發(fā)、傳播和進(jìn)化模式,對(duì)疫情的防控具有重要意義。本研究目的是研究H5亞型高致病性禽流感病毒的暴發(fā)、傳播及進(jìn)化規(guī)律,探索不同宿主、宿主行為、地理環(huán)境等因素對(duì)疾病傳播與進(jìn)化的影響,以期為該疾病未來預(yù)防與控制提供建議和理論支持。具體研究及發(fā)現(xiàn)如下:(1)對(duì)2004年至2015年H5亞型高致病性禽流感疫情出現(xiàn)的時(shí)間、地點(diǎn)等信息進(jìn)行空間化展示,發(fā)現(xiàn)該病毒在2004至2008年出現(xiàn)集中暴發(fā)及大面積擴(kuò)散后,于2011年至2015年出現(xiàn)第二次大面積暴發(fā),同時(shí)伴隨多種禽流感亞型;此外,對(duì)不同地區(qū)病毒的遺傳差異進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)地理隔離會(huì)造成病毒在區(qū)域內(nèi)鮮有進(jìn)化或暴發(fā);而病毒在一個(gè)地區(qū)持續(xù)性存在并感染不同宿主,導(dǎo)致病毒的進(jìn)化及遺傳的多樣性。這是造成有些地區(qū)如南亞、北美洲,病毒遺傳差異較小,而有些地區(qū)如東北亞、中國等病毒的遺傳差異顯著的原因。(2)結(jié)合2005年至2013年H5亞型高致病性禽流感病毒暴發(fā)事件和基因序列信息,利用生物信息學(xué)方法研究不同宿主體內(nèi)病毒的進(jìn)化模式,重建了黑�！刂泻＿w徙帶不同宿主源病毒的傳播網(wǎng)絡(luò):野鳥源病毒傳播網(wǎng)絡(luò)以長距離傳播為主;而家禽源病毒由于家禽養(yǎng)殖過程中與野鳥的接觸以及地區(qū)間貿(mào)易過程中家禽間的相互接觸,同時(shí)出現(xiàn)相鄰區(qū)域間短距離和長距離病毒傳播模式。(3)利用斑頭雁和赤麻鴨的衛(wèi)星跟蹤數(shù)據(jù),結(jié)合其生態(tài)環(huán)境信息(如濕地、NDVI等),利用廣義線性混合模型,研究不同鳥類對(duì)生態(tài)環(huán)境的特定選擇。研究發(fā)現(xiàn)不同鳥類的遷徙行為存在差異,這種差異會(huì)影響其在遷徙過程中對(duì)生態(tài)環(huán)境的選擇—如停歇地的選擇從而影響禽流感病毒擴(kuò)散方式:斑頭雁在遷徙過程中停歇地成聚集性分布,容易造成病毒在種群內(nèi)傳播;赤麻鴨在遷徙過程中停歇地成相對(duì)離散型分布,容易造成病毒在種群間的大面積傳播。
[Abstract]:Since 1996, the highly pathogenic avian influenza virus of H5 subtype has been widely spread and evolved in the world. The poultry industry in the world has suffered great losses, and the life of wild birds and mammals has also been seriously threatened. Therefore, it is of great significance to study the outbreak, transmission and evolution of H5 subtype highly pathogenic avian influenza virus. The purpose of this study was to study the outbreak, transmission and evolution of H5 subtype highly pathogenic avian influenza virus, and to explore the effects of different hosts, host behavior and geographical environment on disease transmission and evolution. In order to provide advice and theoretical support for the prevention and control of the disease in the future. The specific studies and findings are as follows: (1) the time and location of the outbreak of H5 subtype highly pathogenic avian influenza from 2004 to 2015 were spatially displayed, and it was found that the virus occurred in a concentrated outbreak and spread in a large area from 2004 to 2008. The second outbreak occurred from 2011 to 2015, accompanied by a variety of avian influenza subtypes. In addition, the genetic differences of viruses in different regions were analyzed, and it was found that geographic isolation would result in little evolution or outbreak of the virus in the region. Viruses persist in a region and infect different hosts, leading to the evolution and genetic diversity of the virus. This is the result of relatively small genetic differences in some areas, such as South Asia and North America, while in some regions, such as North-East Asia, The causes of the significant genetic differences among Chinese and other viruses. (2) based on the outbreak events and gene sequence information of H5 subtype H5 virus from 2005 to 2013, the evolutionary patterns of viruses in different hosts were studied by bioinformatics. The transmission network of virus from different hosts in the Black Sea Mediterranean migration belt was reconstructed: the transmission network of wild bird origin virus was mainly long-distance transmission; Because of the contact with wild birds during poultry breeding and the contact between poultry in the process of inter-regional trade, At the same time, there are short and long distance virus transmission modes between adjacent regions. (3) based on satellite tracking data of wild goose and red duck, combined with ecological environment information (such as NDVI), a generalized linear hybrid model is used. To study the specific selection of different birds to the ecological environment. The study found that the migration behavior of different birds is different. This kind of difference will affect the ecological environment selection in the course of migration, such as the choice of resting place, so as to influence the way of avian influenza virus spreading. During the migration of red duck, it is easy to spread the virus in a large area.
【學(xué)位授予單位】：清華大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S852.65

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本文編號(hào)：2111754