基于RNA-Seq的舍內(nèi)氨氣對肉雞胸肌生長發(fā)育的分子機(jī)制
本文選題:氨氣 + 肉雞; 參考:《中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院》2017年博士后論文
【摘要】:氨氣作為畜禽舍內(nèi)最主要的有毒氣體,嚴(yán)重影響動(dòng)物的健康和生產(chǎn)性能,危害現(xiàn)代肉雞產(chǎn)業(yè)的長期可持續(xù)發(fā)展。本團(tuán)隊(duì)之前的研究表明,75 ppm高濃度氨氣影響肉雞體脂分布和肉品質(zhì),但氨氣對肉雞胸肌組織代謝的影響及相關(guān)的分子機(jī)制未進(jìn)行研究;同時(shí),25 ppm作為氨氣暴露的極限濃度仍然危害家禽健康,尤其是呼吸道,但25 ppm氨氣對肉雞胸肌組織的影響研究很少且作用機(jī)制不清楚。本課題采用高通量的RNA測序技術(shù)研究氨氣對肉雞胸肌基因表達(dá)的影響,篩選差異表達(dá)的候選基因,以期為遺傳育種和營養(yǎng)調(diào)控提高雞肉產(chǎn)量和肉品質(zhì)提供理論依據(jù)。研究結(jié)果表明,75ppm試驗(yàn)組肉雞平均日增重和平均日采食量均顯著降低(P0.05),料肉比顯著上升(P0.05);氨氣改變?nèi)怆u體脂分布,胸肌組織脂肪含量顯著下降(P0.05)。高通量測序共篩選到胸肌267個(gè)差異表達(dá)基因(P0.05,FC2),其中上調(diào)基因67個(gè),下調(diào)基因189個(gè)。KEGG分析表明差異基因主要參與的代謝通路為類固醇生物合成途徑和過氧化物酶體增殖物激活受體途徑,均為重要的脂代謝通路。75 ppm氨氣導(dǎo)致肉雞胸肌脂質(zhì)沉積減少、肉品質(zhì)下降可能通過影響重要的脂代謝通路而發(fā)揮作用。25 ppm氨氣顯著降低肉雞屠宰性能和胸肌產(chǎn)量(P0.05);高通量測序篩選到胸肌163個(gè)差異表達(dá)的基因(P0.05;FC2),其中,96個(gè)基因表達(dá)下調(diào),67個(gè)表達(dá)上調(diào);GO和KEGG分析表明,差異表達(dá)基因參與脂質(zhì)合成、糖脂代謝和脂肪酸代謝等能量代謝途徑。25 ppm氨氣導(dǎo)致肉雞胸肌含量減少可能通過影響重要的能量代謝通路和候選基因MSTN而發(fā)揮作用。本研究為遺傳育種和營養(yǎng)調(diào)控提高雞肉產(chǎn)量和肉品質(zhì)提供了理論依據(jù)、為改善畜禽舍環(huán)境和動(dòng)物福利奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Ammonia gas, as the main toxic gas in livestock and poultry houses, seriously affects the health and production performance of animals and endangers the long-term sustainable development of modern broiler industry. Previous studies by our team showed that high concentration of ammonia at 75 ppm affected fat distribution and meat quality in broilers, but the effects of ammonia on metabolism of pectoralis muscle and the related molecular mechanisms were not studied. At the same time, 25 ppm as the limit concentration of ammonia exposure is still harmful to poultry health, especially respiratory tract, but the effect of 25 ppm ammonia on breast muscle tissue of broilers is not clear. In this study, high-throughput RNA sequencing was used to study the effect of ammonia on breast muscle gene expression in broilers, and to screen candidate genes for differential expression, in order to provide theoretical basis for genetic breeding and nutrition regulation to improve chicken yield and meat quality. The results showed that the average daily gain (ADG) and average daily intake (ADFI) of broilers in 75 ppm group were significantly lower than those in the control group (P 0.05), the feed / meat ratio was significantly increased (P 0.05), ammonia changed the body fat distribution of broilers, and the fat content of pectoralis muscle tissue decreased significantly (P 0.05). A total of 267 differentially expressed genes of pectoralis muscle were screened by high-throughput sequencing, among which 67 genes were up-regulated. The down-regulated gene 189. KEGG analysis showed that the main metabolic pathways involved in differential genes were steroid biosynthesis pathway and peroxisome proliferator-activated receptor pathway. Both of them were important lipid metabolism pathway. 75 ppm ammonia resulted in the decrease of lipid deposition in pectoralis muscle of broilers. The decline of meat quality may play a role by affecting the important lipid metabolism pathway. 25 ppm ammonia can significantly reduce slaughter performance and breast muscle yield of broilers. High throughput sequencing screened 163 differentially expressed genes P0.05FC2, of which 96 genes were identified. Expression was down-regulated, 67 up-regulated go and KEGG analysis showed that, Differentially expressed genes were involved in lipid synthesis, energy metabolism pathways, such as glycolipid metabolism and fatty acid metabolism. 25 ppm ammonia resulted in the decrease of pectoralis muscle content in broilers, which might play a role by affecting important energy metabolism pathway and candidate gene MSTN. This study provides a theoretical basis for genetic breeding and nutrition regulation to improve chicken yield and meat quality, and lays a foundation for improving the environment of livestock and poultry houses and animal welfare.
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士后
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S831
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本文編號(hào):1954841
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