miRNAs對(duì)TBX5的靶向調(diào)控及其遺傳變異的調(diào)控差異在先天性心臟病中的作用
本文關(guān)鍵詞:北京鴨胚胎期胸肌發(fā)育相關(guān)基因與miRNAs表達(dá)模式鑒定及其互作關(guān)系研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
《復(fù)旦大學(xué)》 2012年
miRNAs對(duì)TBX5的靶向調(diào)控及其遺傳變異的調(diào)控差異在先天性心臟病中的作用
王鳳
【摘要】:先天性心臟病(Congenital heart disease, CHD)是出生缺陷中最常見的類型,已成為嬰幼兒死亡和殘疾的首要原因。開展其相關(guān)的病因和發(fā)病機(jī)制的研究,是早期發(fā)現(xiàn)和早期干預(yù)的重要策略。目前已知多種轉(zhuǎn)錄因子與維持胚胎心臟的正常發(fā)育密切相關(guān)。轉(zhuǎn)錄因子TBX5基因編碼區(qū)序列突變是在人類第一個(gè)發(fā)現(xiàn)的致病性突變,可引起包括房間隔缺損(ASD)、室間隔缺損(VSD)和傳導(dǎo)系統(tǒng)異常等在內(nèi)的Holt-Oram綜合征。長期以來,TBX5與人類CHD的相關(guān)研究側(cè)重于基因編碼區(qū),關(guān)注因氨基酸變化導(dǎo)致的基因功能異常是否會(huì)增加CHD易感性,而很少對(duì)基因調(diào)控區(qū)尤其是3'UTR進(jìn)行系統(tǒng)研究來探討基因劑量與CHD的關(guān)系。為了探討TBX5 3'UTR的遺傳變異和CHD易感性是否存在聯(lián)系,我們在山東和上海兩個(gè)省市收集了總計(jì)1,177例CHD病例和990例健康對(duì)照樣本,挑選出其中32個(gè)樣本對(duì)TBX5 3'UTR進(jìn)行了測序,根據(jù)測序結(jié)果挑選最小等位基因頻率(MAF)大于5%的SNPs,在兩個(gè)人群中分別進(jìn)行基因分型和關(guān)聯(lián)分析。我們發(fā)現(xiàn),TBX53'UTR rs6489956 CT多態(tài)位點(diǎn)可顯著增加先心病的患病風(fēng)險(xiǎn),并在兩個(gè)人群中得到了一致的結(jié)果。其中,T等位基因?yàn)轱L(fēng)險(xiǎn)因子,與CC基因型相比,CT-TT基因型能提高1.9倍的患病風(fēng)險(xiǎn)(adjusted OR= 1.90,95%Cl= 1.52-2.38, P=8.79×10-9)。分層分析發(fā)現(xiàn),該位點(diǎn)與多種類型CHD存在關(guān)聯(lián),且在室間隔缺損(VSD)中較為突出(CT:OR=1.61,95%CI=1.23-2.10;TT:OR=2.43,95% CI=1.04-5.65,P=4×10-4)。在找到與疾病易感性相關(guān)的陽性位點(diǎn)后,我們進(jìn)一步對(duì)其進(jìn)行了功能上的分析。qRT-PCR實(shí)驗(yàn)表明,攜帶rs6489956 T等位基因的CT-TT基因型患病個(gè)體心臟組織TBX5 mRNA的表達(dá)水平僅為CC基因型個(gè)體的49.3%。細(xì)胞水平的熒光素酶報(bào)告基因檢測實(shí)驗(yàn)顯示,miR-9和miR-30a對(duì)rs6489956 CT不同等位基因的負(fù)調(diào)控存在差異。進(jìn)一步的qRT-PCR和Western blot表明,該多態(tài)由C到T的變化會(huì)增強(qiáng)miR-9和miR-30a對(duì)TBX5基因的抑制作用,表現(xiàn)為miR-9引起細(xì)胞內(nèi)源TBX5 mRNA和蛋白水平的表達(dá)下調(diào),而miR-30a則主要抑制TBX5蛋白翻譯。為了鑒定更多的靶向調(diào)控TBX5的miRNAs,根據(jù)生物信息學(xué)的預(yù)測結(jié)果,我們通過細(xì)胞水平的熒光素酶篩選實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)miR-10a和miR-10b均可引起熒光素酶表達(dá)下調(diào)。隨后的qRT-PCR和Western blot證實(shí), miR-10a和miR-10b對(duì)HEK 293T細(xì)胞內(nèi)源TBX5 mRNA的表達(dá)無顯著影響,但可引起其蛋白水平的顯著下調(diào);而miR-10a或miR-10b抑制劑則上調(diào)TBX5蛋白水平的表達(dá)。ANF是TBX5的下游基因之一,其啟動(dòng)子區(qū)具有TBX5的結(jié)合位點(diǎn)。因此,我們進(jìn)一步檢測了miR-10a/10b對(duì)于ANF的作用。HEK 293T細(xì)胞轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)證實(shí),miR-10a/10b均可顯著抑制熒光素酶的活性,而在內(nèi)源低表達(dá)TBX5的Hela細(xì)胞中卻未發(fā)現(xiàn)此現(xiàn)象。隨后的qRT-PCR結(jié)果顯示miR-10a/10b可以下調(diào)HEK293T細(xì)胞內(nèi)源ANF mRNA的表達(dá)。通過以上研究,我們首次鑒定出TBX5 3'UTR rs6489956 CT多態(tài)可顯著增加CHD的患病風(fēng)險(xiǎn),miR-9和miR-30a對(duì)T等位基因的負(fù)調(diào)控作用更為顯著,從而導(dǎo)致TBX5基因的表達(dá)差異;首次發(fā)現(xiàn)miR-10a/10b能夠通過直接靶向TBX5 3'UTR而抑制TBX5蛋白水平的表達(dá)和下游ANF的轉(zhuǎn)錄。
【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號(hào)】:R725.4
【目錄】:
下載全文 更多同類文獻(xiàn)
CAJ全文下載
(如何獲取全文? 歡迎:購買知網(wǎng)充值卡、在線充值、在線咨詢)
CAJViewer閱讀器支持CAJ、PDF文件格式
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 ;Impact of tiny miRNAs on cancers[J];World Journal of Gastroenterology;2007年04期
2 宋寶;宋現(xiàn)讓;劉杰;魏玲;;miRNAs及其靶基因的識(shí)別[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2007年09期
3 ;放療和miRNAs兩者關(guān)系的研究進(jìn)展(英文)[J];Chinese-German Journal of Clinical Oncology;2012年05期
4 王寧;黃辰;姚嘉宜;艾婷;李圍圍;付學(xué)海;宋麗萍;;肺癌相關(guān)miRNAs研究進(jìn)展[J];現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué);2012年05期
5 ;Identification of deregulated miRNAs and their targets in hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma[J];World Journal of Gastroenterology;2012年38期
6 William CS CHO;南娟;;miRNAs作為癌癥預(yù)測和預(yù)后標(biāo)志物的巨大潛能[J];中國肺癌雜志;2013年01期
7 李長貴;紀(jì)艷;;miRNAs和內(nèi)分泌疾病研究進(jìn)展[J];中華醫(yī)學(xué)信息導(dǎo)報(bào);2006年21期
8 William CS CHO;南娟;丁燕;;miRNAs在肺癌中的作用[J];中國肺癌雜志;2009年12期
9 Wen Luo,;Qinghua Nie;Xiquan Zhang;;MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J];遺傳學(xué)報(bào);2013年03期
10 ;Small but influential:the role of microRNAs on gene regulatory network and 3′UTR evolution[J];遺傳學(xué)報(bào);2009年01期
中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 ;A potential role for Chlamydomonas miRNAs in response to environmental changes[A];中國遺傳學(xué)會(huì)植物遺傳和基因組學(xué)專業(yè)委員會(huì)2009年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2009年
2 Ping Xuan;Maozu Guo;Yangchao Huang;;MaturePred:Efficient Identification of MicroRNAs within Novel Plant Pre-miRNAs[A];第五屆全國生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)論文集[C];2012年
3 Zhen-Dong Xiao;Li-Ting Diao;Jian-Hua Yang;Hui Xu;Mian-Bo Huang;Yong-Jin Deng;Hui Zhou;Liang-Hu Qu;;Systematical identification of cis-elements orchestrating the expressions of miRNAs in humans[A];生命的分子機(jī)器及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)——2012年全國生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)摘要集[C];2012年
4 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];2011醫(yī)學(xué)科學(xué)前沿論壇第十二屆全國腫瘤藥理與化療學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2011年
5 任波;馬迪;李毅;;地高辛標(biāo)記探針結(jié)合化學(xué)發(fā)光技術(shù)快速靈敏檢測植物總RNA中的miRNAs方法[A];中國植物病理學(xué)會(huì)2005年學(xué)術(shù)年會(huì)暨植物病理學(xué)報(bào)創(chuàng)刊50周年紀(jì)念會(huì)論文摘要集[C];2005年
6 任波;馬迪;李毅;;地高辛標(biāo)記探針結(jié)合化學(xué)發(fā)光技術(shù)快速靈敏檢測植物總RNA中的miRNAs方法[A];中國植物病理學(xué)會(huì)2005年學(xué)術(shù)年會(huì)暨植物病理學(xué)報(bào)創(chuàng)刊50周年紀(jì)念會(huì)論文集[C];2005年
7 戚鵬;韓金祥;魯艷芹;王傳璽;欒中華;卜范峰;;病毒編碼的miRNAs:基因表達(dá)新的調(diào)控因子[A];山東省藥學(xué)會(huì)2006年生化與生物技術(shù)藥物學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年
8 ;Bioinformatic identification and expression analysis of new microRNAs from Medicago truncatula[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)2008年學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2008年
9 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤學(xué)分會(huì)第七屆全國中青年腫瘤學(xué)術(shù)會(huì)議——中華醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤學(xué)分會(huì)“中華腫瘤 明日之星”大型評(píng)選活動(dòng)暨中青年委員全國遴選論文匯編[C];2011年
10 ;miRNAs involved in Tau expression of BMSCs induced neurons[A];中國神經(jīng)科學(xué)學(xué)會(huì)第九屆全國學(xué)術(shù)會(huì)議暨第五次會(huì)員代表大會(huì)論文摘要集[C];2011年
中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 江尚;[N];中國醫(yī)藥報(bào);2007年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 陳健德;新生兒膿毒癥miRNAs表達(dá)譜及其免疫調(diào)節(jié)作用研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年
2 A.B.M.Khaldun;[D];中國科學(xué)院研究生院(武漢植物園);2015年
3 成鷹;大腸桿菌和布魯氏菌脂多糖刺激條件下巨噬細(xì)胞差異表達(dá)miRNAs的鑒定及其作用機(jī)制[D];海南大學(xué);2014年
4 王奕;MiRNAs在白癜風(fēng)外周血單個(gè)核細(xì)胞中的表達(dá)及miR-3940-5p對(duì)T細(xì)胞作用機(jī)制的研究[D];山東大學(xué);2015年
5 陳科;小鼠子宮內(nèi)膜mRNAs和miRNAs時(shí)空表達(dá)與胚胎著床的關(guān)系及SPOP對(duì)基質(zhì)細(xì)胞蛻膜化的影響[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年
6 陳芳;鵝肥肝生成相關(guān)miRNAs、基因的鑒定及功能研究和就巢性相關(guān)miRNAs的鑒定[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
7 顧麗紅;北京鴨胚胎期胸肌發(fā)育相關(guān)基因與miRNAs表達(dá)模式鑒定及其互作關(guān)系研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
8 侯冬霞;游離脂肪酸在脂肪組織胰島素抵抗中的作用研究及Solexa技術(shù)在miRNAs檢測中的應(yīng)用研究[D];南京大學(xué);2011年
9 李菁;分泌的miRNAs在2型糖尿病和血管再生中的生物學(xué)功能研究[D];南京大學(xué);2011年
10 王鳳;miRNAs對(duì)TBX5的靶向調(diào)控及其遺傳變異的調(diào)控差異在先天性心臟病中的作用[D];復(fù)旦大學(xué);2012年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 姜青華;丹參miRNAs組織特異表達(dá)譜及其靶基因鑒定[D];杭州師范大學(xué);2015年
2 劉元會(huì);抑郁患者腦脊液和血清中差異性miRNAs鑒定的臨床研究[D];四川醫(yī)科大學(xué);2015年
3 賈文慧;宮頸癌及子宮內(nèi)膜癌血清miRNAs的研究[D];南京大學(xué);2013年
4 許成辰;不同HER-2水平的人乳腺癌MCF-7細(xì)胞內(nèi)miRNAs表達(dá)譜及相關(guān)miRNAs對(duì)癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2015年
5 曹文婷;奶山羊乳腺組織miRNAs的鑒定、篩選及功能的初步研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
6 劉帥帥;循環(huán)miRNAs檢測對(duì)肝癌診斷價(jià)值的meta分析[D];蚌埠醫(yī)學(xué)院;2015年
7 王蕊;喉癌相關(guān)miRNAs的篩選及其功能的初步研究[D];南華大學(xué);2015年
8 雷彬;大白豬和二花臉豬排卵前卵泡差異表達(dá)miRNAs及其靶基因鑒定[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
9 葛瑩;綿羊不同發(fā)情狀態(tài)下松果體若干miRNAs表達(dá)差異及其與AANAT靶關(guān)系鑒定[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年
10 湯自征;RA-FLS的遷移、侵襲及RA相關(guān)miRNAs表達(dá)水平的檢測[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年
本文關(guān)鍵詞:北京鴨胚胎期胸肌發(fā)育相關(guān)基因與miRNAs表達(dá)模式鑒定及其互作關(guān)系研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):194488
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/nykjbs/194488.html