本文關鍵詞：亞隔孢殼科的系統(tǒng)演化及分類學研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：莖點霉屬(Phoma)真菌是一類重要的植物病原菌,分布廣泛且具有豐富的多樣性,主要引起植物葉片及莖桿上的病斑,可導致作物產(chǎn)量嚴重損失,其中一些物種還具有檢疫重要性。莖點霉屬與殼二孢屬(Ascochyta)真菌在形態(tài)、生理、致病性和分子序列上都高度相似,二者關系一直未理清。亞隔孢殼屬(Didymella)是唯一與莖點霉屬和殼二孢屬真菌正確關聯(lián)的有性型屬,而對該屬的研究仍較少。2009年新建立的亞隔孢殼科(Didymellaceae)將這三個屬容納其中,還包括其他相關的物種,而大多數(shù)物種的分類地位尚未清楚,種屬劃分未明確,因此亞隔孢殼科物種的分類系統(tǒng)亟待完善。隨著分子系統(tǒng)學研究方法的引入和發(fā)展,結合傳統(tǒng)形態(tài)學分類,使物種種屬的劃分更趨于自然,所建立的分類系統(tǒng)更加穩(wěn)定可靠。本研究通過標本采集和國際合作獲得亞隔孢殼科及相關類群真菌菌株共297株,通過多位點(LSU, ITS, tub2, rpb2)聯(lián)合分析推測系統(tǒng)發(fā)育關系,同時進行形態(tài)學比較研究,結合表型與基因型,探討亞隔孢殼科真菌的系統(tǒng)分類,得到清晰劃分的17個屬,以及1個與亞隔孢殼科物種明顯區(qū)分開的新科。建立了9個新屬,分別為Allophoma Q. Chen L. Cai, Calophoma Q. Chen L. Cai, Heterophoma Q. Chen L. Cai, Neoascochyta Q. Chen L. Cai, Neodidymelliopsis Q. Chen L. Cai, Nothophoma Q. Chen L. Cai, Paraboeremia Q. Chen L. Cai, Phomatodes Q. Chen L. Cai和Xenodidymella Q. Chen L. Cai; 5個新種,包括Allophoma nicaraguensis Q. Chen L. Cai, Phoma odoratissimi Q. Chen, Phoma neerlandica Q. Chen L. Cai, Phoma segeticola Q. Chen和Stagonosporopsis helianthi Q. Chen L. Cai。引入2個新名稱,Ascochyta medicaginicola var. medicaginicola Q. Chen L. Cai和Didymella senecionicola Q. Chen L. Cai;以及Allophoma labilis (Sacc.) Q. Chen L. Cai,All. minor (Aveskamp et al.) Q. Chen L. Cai, All. piperis (Tassi) Q. Chen L. Cai等84個新組合。另外,在對模式標本和原始描述的查閱、檢查基礎之上,根據(jù)產(chǎn)地、寄主、形態(tài)特征相符合的原則,為11個物種指定了注釋模式(epitype),包括Ascochyta hordei var. europaea Punith., Ascochyta pisi Lib., Didymella asphodeli E. Mull., Didymosphaeria applanata Niessl, Phoma anigozanthi Tassi, Phoma dennisii Boerema, Phoma polemonii Cooke, Phyllosticta noackiana Allesch., Phyllosticta piperis Tassi, Sclerophomella aubrietiae Moesz和Sphaeria pinodes Berk. A. Bloxam;為7個物種指定了新模式(neotype),包括Ascochyta desmazieri Cav., Phoma heteromorpha Schulzer Sacc., Phoma protuberans Lev., Phoma strasseri Moesz, Phoma sylvatica Sacc., Phoma xanthina Sacc.和Phyllosticta selaginellae Sacc.。根據(jù)對亞隔孢殼科分類系統(tǒng)的研究結果,將Ascochyta, Didymella和Phoma三個屬的關系理清,并對每個屬進行了清晰的界定。同時,還對Ascochyta, Didymella, Epicoccum和Phoma四個屬的屬征進行了補充和修訂。另外將原屬于Didymellaceae的Microsphaeropsis屬建立了新科Microsphaeropsidaceae。
【關鍵詞】：殼二孢屬 莖點霉屬 亞隔孢殼屬 多位點系統(tǒng)發(fā)育 分類學
【學位授予單位】：中國農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：博士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：S432.4
【目錄】：

• 摘要4-5
• ABSTRACT5-8
• 第一章 緒論8-14
• 1.1 莖點霉屬概述及經(jīng)濟重要性8
• 1.2 亞隔孢殼科的分類研究概況8-11
• 1.3 新模式和注釋模式11-12
• 1.4 分子系統(tǒng)學研究12
• 1.5 本研究的目的和意義12-14
• 第二章 材料與方法14-34
• 2.1 標本采集及菌株分離14-15
• 2.2 模式標本15
• 2.3 形態(tài)學研究15
• 2.4 DNA提取15-16
• 2.5 PCR擴增及測序16-17
• 2.6 系統(tǒng)發(fā)育分析17-34
• 第三章 亞隔孢殼科系統(tǒng)發(fā)育34-42
• 第四章 亞隔孢殼科的新分類系統(tǒng)42-130
• 4.1 新屬42-46
• 4.1.1 Allophoma42
• 4.1.2 Calophoma42-43
• 4.1.3 Heterophoma43
• 4.1.4 Neoascochyta43-44
• 4.1.5 Neodidymelliopsis44
• 4.1.6 Nothophoma44-45
• 4.1.7 Paraboeremia45
• 4.1.8 Phomatodes45-46
• 4.1.9 Xenodidymella46
• 4.2 屬征修訂46-51
• 4.2.1 殼二孢屬Ascochyta46-47
• 4.2.2 亞隔孢殼屬Didymella47-48
• 4.2.3 附球孢屬Epicoccum48-49
• 4.2.4 莖點霉屬Phoma49-51
• 4.3 新組合、新名稱、注釋模式及新模式51-93
• 4.3.1 新組合51-76
• 4.3.2 新名稱76-77
• 4.3.3 注釋模式77-87
• 4.3.4 新模式87-93
• 4.4 新種93-97
• 4.5 新科97-99
• 4.6 未確定種99-130
• 第五章 結論與討論130-134
• 5.1 結論130-131
• 5.2 討論131-134
• 參考文獻134-142
• 致謝142-144
• 個人簡介144

  本文關鍵詞：亞隔孢殼科的系統(tǒng)演化及分類學研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號：256129