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秀麗線蟲中小RNA介導(dǎo)產(chǎn)生的H3K27me3染色體修飾依賴于Nrde通路

發(fā)布時(shí)間:2019-10-02 00:35
【摘要】:小RNA分子指導(dǎo)染色質(zhì)的修飾在植物和酵母中有著廣泛的研究,然而在動(dòng)物中直接證明小RNA可以指導(dǎo)序列特異性的染色質(zhì)修飾的研究卻相對(duì)缺乏。在秀麗隱桿線蟲中,細(xì)胞核內(nèi)RNA干擾通路可以介導(dǎo)小干擾RNA分子從細(xì)胞質(zhì)中轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞核內(nèi),從而調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的延伸,指導(dǎo)組蛋白H3第9位賴氨酸H3K9形成三甲基化修飾并實(shí)現(xiàn)RNA干擾的多代遺傳。本文的研究發(fā)現(xiàn)外源性RNA干擾和NRDE內(nèi)源性結(jié)合的22G小RNA分子都可以在靶標(biāo)位置上通過Nrde通路介導(dǎo)序列特異性的組蛋白H3第27位賴氨酸H3K27的三甲基化修飾。這些產(chǎn)生的H3K27me3修飾可以通過后代在子代中多代遺傳。piRNA和WAGO-1結(jié)合的小干擾RNA分子也可以介導(dǎo)H3K27me3的表達(dá)。有趣的是CSR-1結(jié)合的內(nèi)源性小干擾RNA卻并不能生成依賴于Nrde通路的H3K27me3表達(dá),但是當(dāng)對(duì)CSR-1靶標(biāo)基因位置外源性引入雙鏈RNA時(shí),在靶標(biāo)位置卻可以出現(xiàn)依賴于Nrde的H3K27me3表達(dá)。我們進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)H3K9me3和H3K27me3的表達(dá)需要不同的遺傳因子;騭et-25和met-2對(duì)于H3K9me3表達(dá)是必須的,而H3K27me3的表達(dá)需要mes-2的介導(dǎo)。當(dāng)mes-2基因突變時(shí)會(huì)導(dǎo)致RNA干擾缺失的表型出現(xiàn)。這些結(jié)果表明在線蟲中雙鏈RNA可以介導(dǎo)依賴于Nrde通路的序列特異性染色質(zhì)的修飾。
【圖文】:

雙鏈,線蟲,特定基,大腸桿菌


為了進(jìn)一步探索雙鏈RNA祀向位置和。遥危练肿诱T導(dǎo)的H3K27me3表達(dá)逡逑位置之間的關(guān)系。我們分別構(gòu)建表達(dá)祀向化2-/yP基因的5’端和3’端的雙鏈RNA逡逑大腸桿菌(圖3.3邋A)來喂食指定基因型的線蟲。我們發(fā)現(xiàn)雙鏈RNA祀向誘導(dǎo)逡逑的H3K27me3峰值隨著小民NA分子位置的變化存在一個(gè)5化的從左到右的偏移逡逑(圖3.3邋B和C)。這種起始雙鏈RNA與H3K27邋H甲基化修飾的表達(dá)水平之間逡逑空間的位置聯(lián)系,表明。遥危练肿诱T導(dǎo)的染色質(zhì)修飾的序列特異性響應(yīng)發(fā)生在逡逑亞基因水平。逡逑53逡逑

示意圖,亞基因,甲基化,雙鏈


1邋0l_Z:IZ:l邋尙。MMlh逡逑dpy-28逡逑圖3.2邋Nrde遁路對(duì)于外源性RNA干擾誘導(dǎo)產(chǎn)生的H3K27me3是必須的逡逑西注:對(duì)指定基因型的線蟲分為喂食含有鉛向特定基巧的雙鏈RNA的大腸桿菌(A,逡逑B)獻(xiàn)-^/56,(C,邋D)拆-/,(E,,F)曲及不含有雙鏈RNA的對(duì)照大腸桿逡逑菌。通過抗體Mimpore#07-449邋anti-H3K27me3,利用Chip實(shí)驗(yàn)和定量巧光逡逑PCR檢測(cè)橗標(biāo)基因和其周圍區(qū)域H31C27me3的表達(dá)水平。利用基因作為內(nèi)逡逑參標(biāo)定樣品H3K27me3的信號(hào),數(shù)據(jù)表示為RNAi處理組和對(duì)照組H3K27me3逡逑水平的比值。(n=3+/-邋s.d.)逡逑義1.4雙鏈RNA邋可レ:U秀導(dǎo)亞基因水平的染色質(zhì)修飾逡逑為了進(jìn)一步探索雙鏈RNA祀向位置和。遥危练肿诱T導(dǎo)的H3K27me3表達(dá)逡逑位置之間的關(guān)系。我們分別構(gòu)建表達(dá)祀向化2-/yP基因的5’端和3’端的雙鏈RNA逡逑大腸桿菌(圖3.3邋A)來喂食指定基因型的線蟲。我們發(fā)現(xiàn)雙鏈RNA祀向誘導(dǎo)逡逑的H3K27me3峰值隨著小民NA分子位置的變化存在一個(gè)5化的從左到右的偏移逡逑(圖3.3邋B和C)。這種起始雙鏈RNA與H3K27邋H甲基化修飾的表達(dá)水平之間逡逑空間的位置聯(lián)系,表明。遥危练肿诱T導(dǎo)的染色質(zhì)修飾的序列特異性響應(yīng)發(fā)生在逡逑亞基因水平。逡逑53逡逑
【學(xué)位授予單位】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:Q78

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本文編號(hào):2544659

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