基于RNA-seq測序技術(shù)揭示黃曲霉對槲皮素的應(yīng)答機(jī)制
本文選題:黃曲霉 + 黃曲霉毒素。 參考:《中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院》2017年博士后論文
【摘要】:黃曲霉(Aspergillus flavus)是一種遍布全世界的腐生真菌,能產(chǎn)生黃曲霉毒素(aflatoxin,AF)。AF是一組具有致癌性、肝臟毒性和免疫抑制效應(yīng)的真菌毒素,嚴(yán)重威脅人類健康和糧食安全,每年給世界農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)造成巨大的損失。槲皮素不僅能夠抑制黃曲霉菌的生長,同時(shí)能夠抑制黃曲霉毒素的合成。本研究基于RNA-seq技術(shù)分析槲皮素抑制黃曲霉生長及其毒素合成的可能機(jī)制,得到以下結(jié)論:第一,槲皮素能夠抑制黃曲霉生長及毒素的合成。第二,采用RNA-seq技術(shù)分析槲皮素處理前后黃曲霉基因mRNA水平的影響。RNA-seq結(jié)果顯示,黃曲霉樣品表達(dá)轉(zhuǎn)錄本注釋得到的基因有11308個,對所有能夠比對上基因組的基因按|log2(fold change)|1,Probability0.8的條件篩選,共有665個差異表達(dá)基因。其中,槲皮素處理組黃曲霉表達(dá)上調(diào)的基因有340個,表達(dá)下調(diào)的基因有325個。差異表達(dá)基因GO和KEGG分析結(jié)果顯示,差異基因主要富集到structural constituent of ribosome 和 structural molecule activity。第三,槲皮素抑制黃曲霉生長,主要與AFLA_083110和AFLA_044790兩個與孢子發(fā)育相關(guān)的基因有關(guān)。第四,槲皮素抑制黃曲霉AF合成,主要調(diào)控了 aflS基因,但afrs在AF生物合成中的確切作用目前尚不清楚。
[Abstract]:Aspergillus flavus is a worldwide saprophytic fungus that produces aflatoxinus aflatoxin.AF is a group of fungal toxins with carcinogenic, hepatic and immunosuppressive effects that pose a serious threat to human health and food security.Every year to the world agricultural economy caused huge losses.Quercetin can not only inhibit the growth of Aspergillus flavus, but also inhibit the synthesis of aflatoxin.The possible mechanism of quercetin inhibiting the growth and toxin synthesis of Aspergillus flavus was analyzed based on RNA-seq. The following conclusions were obtained: firstly, quercetin could inhibit the growth of Aspergillus flavus and the synthesis of toxin.Secondly, the effect of quercetin treatment on the mRNA level of aflatoxin gene was analyzed by RNA-seq. RNA-seq results showed that there were 11308 genes expressed in Aspergillus flavus samples.A total of 665 differentially expressed genes were screened for all genes that could be compared to the upper genome by using the log2(fold change 1 / Probability0.8 condition.In quercetin treated group, 340 genes were up-regulated and 325 genes were down-regulated.The results of differential expression gene go and KEGG analysis showed that the differentially expressed genes were mainly enriched in structural constituent of ribosome and structural molecule activity.Third, quercetin inhibits the growth of Aspergillus flavus, mainly related to AFLA_083110 and AFLA_044790 genes related to spore development.Fourth, quercetin inhibits AF biosynthesis of Aspergillus flavus and regulates the aflS gene, but the exact role of afrs in AF biosynthesis is unclear.
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士后
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:Q936
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