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應(yīng)用細(xì)胞色素氧化酶亞基I鑒定蠅科常見嗜尸性蠅種

發(fā)布時間:2017-08-23 18:28

  本文關(guān)鍵詞:應(yīng)用細(xì)胞色素氧化酶亞基I鑒定蠅科常見嗜尸性蠅種


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【摘要】:背景: 法醫(yī)昆蟲學(xué)(Forensic entomology)是法醫(yī)學(xué)和節(jié)肢動物科學(xué)在廣泛領(lǐng)域結(jié)合并相互影響的一門新型交叉邊緣性學(xué)科,應(yīng)用范圍上涉及刑事、民事、行政案件,為法醫(yī)實際檢案提供技術(shù)幫助。主要研究方法是對在尸體內(nèi)、尸體表面或尸體附近采集到的昆蟲標(biāo)本,進(jìn)行檢驗、鑒定、分類后,明確昆蟲種類或確定某一昆蟲生長發(fā)育狀態(tài),結(jié)合該昆蟲在尸體上的生態(tài)群落演替及生活習(xí)性,幫助法醫(yī)完成死亡時間(postmortem interval, PMI)推斷。在應(yīng)用尸體上昆蟲群落演替規(guī)律解決相關(guān)法醫(yī)學(xué)問題的前提是鑒定昆蟲的種類。 機(jī)體死后不久,就會有大量嗜尸性蠅類到達(dá)并產(chǎn)卵,因此,測定尸體上嗜尸性蠅類的種類及其蛹的發(fā)育齡期是估計死亡時間(PMI)的重要昆蟲學(xué)資料。然而昆蟲種類繁多,只有經(jīng)過專門訓(xùn)練的專業(yè)人員才能掌握某類群的形態(tài)學(xué)鑒別要點(diǎn)。利用形態(tài)學(xué)特征鑒定蠅類的方法不能得到很好的普及,也給法醫(yī)工作者日常實際檢案帶來很大障礙。 近年發(fā)展起來的分子生物學(xué)技術(shù)便很好的解決了這一難題,本研究通過運(yùn)用自行設(shè)計的線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ(co Ⅰ)引物,從基因水平探索昆蟲種類的鑒別。使昆蟲種類鑒定方法更為準(zhǔn)確和科學(xué)。 目的: 應(yīng)用272bp的細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ(co Ⅰ)的基因片段對蠅科常見嗜尸性蠅種進(jìn)行種類鑒定,為建立地區(qū)嗜尸性昆蟲基因庫積累數(shù)據(jù),為蠅科嗜尸性蠅種在實踐中進(jìn)行死亡時間推斷奠定基礎(chǔ)。 方法: 2009-2011年在湖南省及周邊省份應(yīng)用家兔尸體誘捕嗜尸性蠅科成蟲,與本教研室前期(2007-2008)捕獲的嗜尸性蠅科樣本進(jìn)行匯總、挑選,邀請湖南省農(nóng)業(yè)大學(xué)昆蟲學(xué)專家對挑選出的樣本進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定。利用十六烷基三甲溴化銨(CTAB)法提取樣本DNA,瓊脂糖凝膠電泳檢測提取效果。Epoendorf梯度PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,PCR膠回收試劑盒純化。純化產(chǎn)物送往華大基因(武漢)進(jìn)行序列測性;MEGA4軟件包進(jìn)行序列分析及構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。 結(jié)果: 通過對DNA COI片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序的方法,能有效檢測出嗜尸性蠅科樣本的基因序列,利用MEGA4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。得出與形態(tài)學(xué)鑒定一致的種類,鑒定出4屬5種蠅類的種屬關(guān)系:家蠅屬中家蠅;黑蠅屬中厚環(huán)黑蠅、斑踱黑蠅;腐蠅屬中廄腐蠅;螫蠅屬中廄螫蠅。 結(jié)論: DNA序列分析具有快速、簡便和精確的特點(diǎn),是目前分析進(jìn)化及系統(tǒng)發(fā)育研究中有效、可靠的方法,分子鑒定是對形態(tài)學(xué)鑒定方法上的一個有效補(bǔ)充,因此,mtDNA的272bp COI片段是鑒定蠅科常見嗜尸性蠅種的一個有效分子標(biāo)記。
【關(guān)鍵詞】:法醫(yī)昆蟲學(xué) 死亡時間推斷 線粒體DNA 細(xì)胞色素氧化酶亞基I 種屬鑒定
【學(xué)位授予單位】:中南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號】:D919.1
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • ABSTRACT6-11
  • 技術(shù)路線11-12
  • ~.略詞表12-13
  • 前言13-15
  • 第一章 材料與方法15-24
  • 1.1 主要實驗試劑和儀器15-17
  • 1.1.1 主要實驗試劑15
  • 1.1.2 主要試劑配制15-17
  • 1.1.3 主要儀器17
  • 1.2 樣本來源和處理17-20
  • 1.3 實驗方法與步驟20-24
  • 1.3.1 DNA提取20-21
  • 1.3.2 DNA質(zhì)量濃度和純度檢測21
  • 1.3.3 瓊脂糖電泳檢測DNA提取效果21
  • 1.3.4 PCR引物設(shè)計及PCR擴(kuò)增21-23
  • 1.3.5 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純化及測序23
  • 1.3.6 序列分析和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建23-24
  • 第二章 結(jié)果24-38
  • 2.1 形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果24-26
  • 2.2 瓊脂糖電泳檢測mtDNA提取效果26-27
  • 2.3 COI DNA基因測序結(jié)果27-32
  • 2.4 種蠅科序列登錄NCBI數(shù)據(jù)庫搜索結(jié)果32
  • 2.5 COI序列分析和系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建結(jié)果32-35
  • 2.6 通過COIDNA基因序列獲得的遺傳距離35-38
  • 2.6.1 種間差異35-36
  • 2.6.2 種內(nèi)差異36-37
  • 2.6.3 兩兩種類種間差異百分比37-38
  • 第三章 討論38-40
  • 第四章 結(jié)論40-41
  • 參考文獻(xiàn)41-45
  • 綜述45-51
  • 參考文獻(xiàn)48-51
  • 致謝51-52
  • 攻讀碩士學(xué)位期間的研究成果52

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 張亞平,施立明;動物線粒體DNA多態(tài)性的研究概況[J];動物學(xué)研究;1992年03期

2 蔡繼峰,常云峰,廖志鋼,劉敏,董建國,陶濤,潘洪富,張林,閆紅濤;嗜尸性蒼蠅mtDNA中COⅡ基因序列檢測[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2005年04期

3 孫曉明;蔡繼峰;應(yīng)斌武;方月琴;云利兵;袁萬安;高山;侯一平;;16SrDNA序列分析在嗜尸性蠅類鑒定中的應(yīng)用[J];法醫(yī)學(xué)雜志;2006年01期

4 李響;蔡繼峰;;mtDNA多態(tài)性在嗜尸性昆蟲種類鑒定中的應(yīng)用[J];法醫(yī)學(xué)雜志;2011年02期

5 陳瑤清;郭亞東;李茂枝;熊楓;李劍波;蔡繼峰;;常見嗜尸性昆蟲mtDNA提取方法的比較[J];法醫(yī)學(xué)雜志;2011年04期

6 李濤,賴旭龍,鐘揚(yáng);利用DNA序列構(gòu)建系統(tǒng)樹的方法[J];遺傳;2004年02期

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本文編號:726598

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