【摘要】： 目的:采用微測序(minisequenting)方法建立線粒體DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)控制區(qū)和編碼區(qū)共21個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點(diǎn)的復(fù)合檢測方法:為線粒體DNA的快速復(fù)合檢測及結(jié)果解釋提供參考依據(jù)。 方法:從前期課題檢測的漢族、瑤族、藏族等民族樣本的SNP位點(diǎn)中選擇高變SNP位點(diǎn)(頻率＞0.2)聯(lián)合同一個(gè)體不同組織檢出的異質(zhì)性SNP位點(diǎn),建立SNaPshot檢測方法并對(duì)其進(jìn)行優(yōu)化。收集26份組織樣本(兩個(gè)個(gè)體,每個(gè)個(gè)體13份樣本,包括血液、心、肝、脾、肺、腎、胰、腦、肌肉、皮膚、指甲及毛發(fā))、2名無關(guān)個(gè)體樣本、日常案件檢驗(yàn)中的9份檢材以及9份動(dòng)物樣本,采用優(yōu)化后的SNaPshot檢測方法對(duì)所有樣本進(jìn)行法醫(yī)學(xué)應(yīng)用有效性驗(yàn)證:同時(shí)對(duì)所有樣本進(jìn)行測序,將SNaPshot檢測方法與直接測序法的檢驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行比對(duì)。 結(jié)果:本研究中SNaPshot檢測結(jié)果與測序結(jié)果一致:且SNaPshot檢測具有種屬特異性、組織同一性等特點(diǎn) 結(jié)論:SNaPshot可快速檢測線粒體DNA的單核苷酸多態(tài)性,方便、經(jīng)濟(jì)、靈敏度高且自動(dòng)化程度高,可為法醫(yī)學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域線粒體DNA單核苷酸多態(tài)性提供一種便宜的檢測方法。
[Abstract]:Objective: to establish a complex method for the detection of 21 single nucleotide polymorphisms (SNP) (SNPs) loci in mitochondrial DNA (mitochondrial DNA,mtDNA (mtDNA) control region and coding region by microsequencing (minisequenting), and to provide a reference for rapid compound detection and interpretation of mitochondrial DNA. Methods: from the SNP loci of Han, Yao and Tibetan nationalities tested in the previous study, the high variable SNP locus (frequency > 0.2) and heterogeneity SNP loci detected in different tissues of the same body were selected, and the SNaPshot detection method was established and optimized. Two unrelated samples were collected from 26 tissue samples (2 individuals, 13 samples each, including blood, heart, liver, spleen, lung, kidney, pancreas, brain, muscle, skin, nails and hair). Nine samples and nine animal samples from routine cases were tested by optimized SNaPshot method to verify the validity of forensic application: all samples were sequenced at the same time. The results of SNaPshot detection and direct sequencing were compared. Results: in this study, the results of SNaPshot detection were consistent with those of sequencing. The results showed that SNaPshot detection had the characteristics of species-specific and tissue identity. Conclusion: the single nucleotide polymorphism of mitochondrial DNA can be detected quickly by using SNaPshot. It is convenient and economical to detect the single nucleotide polymorphism of mitochondrial DNA. High sensitivity and high automation can provide a cheap method for the detection of mitochondrial DNA single nucleotide polymorphisms in forensic applications.
【學(xué)位授予單位】：山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2007
【分類號(hào)】：D919

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