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ABO基因CASPA分型方法的研究

發(fā)布時(shí)間:2018-08-03 21:54
【摘要】:前言 ABO血型是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的人類血液遺傳標(biāo)記系統(tǒng)。1990年,Yamamoto等人首先報(bào)道了ABO基因的核酸序列,并且確定了決定ABO血型表型的各等位基因的堿基序列差異點(diǎn),這一發(fā)現(xiàn)是在DNA水平上檢測(cè)ABO基因型的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。目前應(yīng)用的ABO基因分型技術(shù)大概可以分為擴(kuò)增限制性片段長度多態(tài)性法(PCR-RFLP)、單鏈構(gòu)象多態(tài)性法(SSCP)、PCR直接測(cè)序法、等位基因特異性擴(kuò)增法(ASA)、等位基因特異性引物消耗法(CASPA)等幾類技術(shù)方法。其中,等位基因特異性擴(kuò)增法是當(dāng)前在法醫(yī)物證檢驗(yàn)鑒定領(lǐng)域研究和應(yīng)用最為廣泛的一種ABO基因分型方法,該方法具有靈敏、簡便、快捷等特點(diǎn)。本項(xiàng)研究所選擇的等位基因特異性引物消耗法(CASPA法)就是近期在ASA法基礎(chǔ)上研究建立的一種新的ABO基因分型方法。該方法的優(yōu)點(diǎn)是:1.由于采用毛細(xì)管電泳儀檢測(cè)擴(kuò)增后剩余的熒光標(biāo)記引物,所以方法更加簡單、快速、靈敏;2.由于其等位基因特異性引物長度與其擴(kuò)增產(chǎn)物相比較要短的多,所以電泳分離時(shí)間縮短;3.由于所檢測(cè)的是擴(kuò)增后剩余引物,所以該方法適合在降解生物檢材的ABO基因分型中應(yīng)用。本項(xiàng)研究在Watanabe等人報(bào)道的等位基因特異性引物消耗法的基礎(chǔ)上,在引物設(shè)計(jì)上進(jìn)行了改進(jìn),并進(jìn)行了法醫(yī)常見生物物證的適用性研究,現(xiàn)將研究結(jié)果報(bào)告如下: 實(shí)驗(yàn)材料 分別被熒光染料6-FAM和HEX標(biāo)記的6條長度不等的等位基因特異性引物以及1條無標(biāo)記物的共用引物。已知ABO基因型的DNA提取液。146份中國漢族無關(guān)個(gè)體血液斑樣品;旌习摺煹、汗液斑、肌肉、軟骨、股骨、帶毛囊的毛發(fā)。
[Abstract]:Preface ABO blood group is the first human blood genetic marker system. In 1990, ABO gene nucleic acid sequence was first reported by ABO et al. The differences in the base sequence of the alleles determining the phenotype of ABO were determined, which is the genetic basis for the detection of ABO genotypes at the DNA level. The ABO genotyping techniques used at present can be divided into amplified restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and single strand conformation polymorphism (SSCP) (SSCP) direct sequencing. Allele specific amplification method (ASA), allele specific primer consumption method (CASPA) and other techniques. Allele-specific amplification is one of the most widely used ABO genotyping methods in the field of forensic physical evidence testing and identification. This method is sensitive, simple and rapid. The allele-specific primer consumption (CASPA) method selected in this study is a new ABO genotyping method based on ASA recently. The advantage of this method is: 1. The method is simpler, faster and more sensitive because of the detection of remaining fluorescent labeled primers by capillary electrophoresis. Because the length of the allele-specific primers was much shorter than that of the amplified products, the separation time of the allele-specific primers was shortened by 3%. This method is suitable for ABO genotyping of biodegradable samples because of the amplified residual primers. Based on the allele-specific primer consumption method reported by Watanabe et al., the primer design was improved, and the applicability of common biological evidence in forensic medicine was studied. The results are reported as follows: the experimental materials were labeled with fluorescent dye 6-FAM and HEX, respectively. Six allele-specific primers with different lengths and one common primer with no marker. DNA extract of known ABO genotypes. 146 blood spot samples from unrelated individuals of Han nationality in China. Mixed spot, cigarette butt, sweat spot, muscle, cartilage, femur, hair with hair follicle.
【學(xué)位授予單位】:中國醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2005
【分類號(hào)】:D919.1

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本文編號(hào):2163107

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