發(fā)布時(shí)間：2018-05-04 10:17

  本文選題：Y-SNP + Y-STR��； 參考：《昆明醫(yī)學(xué)院》2011年碩士論文

【摘要】：[目的] Y染色體非重組區(qū)DNA多態(tài)呈父系遺傳,在法醫(yī)學(xué)混合斑分析、父系親權(quán)鑒定及男性嫌疑人的案件排查中發(fā)揮重要作用。其單核苷酸多態(tài)具有種族、地理特異性,根據(jù)現(xiàn)場遺留男性個(gè)體生物學(xué)檢材的特點(diǎn)來推測其種族地理來源可為偵查破案提供線索。本課題利用云南獨(dú)特的少數(shù)民族遺傳資源,選擇了佤族、白族和傣族三個(gè)祖裔來源不同的民族進(jìn)行具有東亞特異性的7個(gè)Y-SNP位點(diǎn)和Y filer試劑盒17個(gè)Y-STR基因座基因分型檢測。獲取了上述三個(gè)民族Y-SNP、STR兩種遺傳標(biāo)記的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分布特點(diǎn),初步探討了Y-STR與Y-SNP分型之間存在的關(guān)聯(lián)性,及根據(jù)Y-SNP單倍群、Y-STR單倍型的特點(diǎn)來推測其種族來源的可行性,為更多民族群體利用Y染色體DNA多態(tài)研究及其在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用提供一研究方法。 [方法]采集云南佤族(100例)、白族(146例)和傣族(158例)共404例無關(guān)男性健康個(gè)體的靜脈血各5mL。采用酚-氯仿有機(jī)法提取核基因組DNA。用巢式PCR和PCR產(chǎn)物直接測序法進(jìn)行7個(gè)Y-SNP分型檢測；用Y filer試劑盒進(jìn)行17個(gè)Y-STR基因座的復(fù)合擴(kuò)增檢測。應(yīng)用Arlequin 3.5、Network4.5.1.6等軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析。 [結(jié)果]所檢測的7個(gè)Y-SNP,佤族在O3-M122、O2-M95、K*-M9、C-M130和F*-M89單倍群中有頻率分布,無O1-M119和P*-M45分型；白族中7個(gè)Y-SNP單倍群均有分布；傣族除P*-M45外有其余6種單倍群分布。其中,O3-M122在佤族、白族和傣族中分別占56.0%、47.3%和31.0%；02-M95分別占15.0%、15.8%和39.9%；K*-M9分別占24.0%、13.0%和5.7%；C-M130分別占3.0%、10.2%和5.7%。17個(gè)Y-STR基因座構(gòu)成的單倍型在佤族、白族和傣族中分別檢出72種、115種和140種單倍型；三個(gè)民族之間無共有的單倍型：三個(gè)民族的Y-STR單倍型多樣性分別為0.9875±0.0046、0.9957±0.0015和0.9981±0.0010。 佤族17個(gè)Y-STR基因座在各Y-SNP單倍群內(nèi)均有高頻率的等位基因分布,除DYS389Ⅱ和DYS19外,其余15個(gè)基因座的等位基因頻率分布在03-M122和02-M95之間明顯不同；DYS389 I, DYS19、DYS393、YGATAH4和DYS438中高頻率等位基因在03-M122、02-M95和K*-M9單倍群之間的分布不同；03-M122的特征單倍型是15-12-23-29-15-15-12,17-12-10-11-22-13-13(14/12)-15-9-19,02-M95的特征單倍型是16-13-25-29-16-15-15,19-14-11-12-20-14-11-14-10-18。白族各Y-SNP單倍群內(nèi)的等位基因頻率分布比較均勻。傣族DYS389 I、DYS389 II、DYS19、DYS439、DYS392、DYS437、DYS438和DYS448高頻率等位基因分布在03-M122和03-M95間不同,DYS390、DYS393和DYS635的等位基因在03-M122、03-M95和O1-M119單倍群之間分布不同。 同一Y-SNP單倍群的Y-STR單倍型Network網(wǎng)絡(luò)圖顯示,佤族在03-M122、02-M95和K*-M9三個(gè)單倍群的網(wǎng)絡(luò)圖中均具有非常接近的單倍型并形成starcluster形狀；白族在03-M122圖中除部分單倍型位于中央外,單倍型之間差異比較大,02-M95網(wǎng)絡(luò)圖中具有一個(gè)小、star cluster形狀；傣族在03-M122網(wǎng)絡(luò)圖中大部分的單倍型個(gè)體聚在一起,具有star cluster形狀,且和部分白族個(gè)體的很接近,而在02-M95網(wǎng)絡(luò)圖中則各單倍型較分散,具有高度的單倍型多樣性和分支多樣性。 [結(jié)論]本課題研究獲取了云南佤族、白族和傣族三個(gè)少數(shù)民族Y-SNP和Y-STR的群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù),初步掌握了三個(gè)民族的父系遺傳特點(diǎn)以及民族間的遺傳差異。佤族的父系遺傳結(jié)構(gòu)單一,較好的保持了其父系遺傳特征,其Y-STR等位基因頻率分布與Y-SNP單倍群有相關(guān)性,在法醫(yī)學(xué)案件檢驗(yàn)中可利用其Y-STR特征單倍型及特異等位基因來推測其Y-SNP單倍群。而白族和傣族的父系遺傳結(jié)構(gòu)在多樣性中存在著基因交流。
[Abstract]:Based on the characteristics of Y - SNP and Y - STR loci in Yunnan Province , this paper discusses the relationship between Y - STR and Y - SNP typing , and provides a research method for the application of Y - SNP haplotype and Y - STR haplotype in the field of forensic medicine .

Methods A total of 404 unrelated male healthy individuals were collected from the Wa nationality ( 100 cases ) , Bai nationality ( 146 cases ) and Dai nationality ( 158 cases ) in Yunnan Province .
The multiplex amplification of 17 Y - STR loci was performed with Y filer kit . The data were analyzed by Arlequin 3.5 , Network4.5 . 1.6 and other software .

The results showed that the seven Y - SNP and Wa were frequency - distributed among O3 - M122 , O2 - M95 , K * - m9 , C - M130 and F * - M89 single fold , and there were no O1 - M119 and P * - M45 typing ;
There was a distribution of 7 Y - SNP haplotype groups in Bai people .
Among the Dai people , there are the remaining six single - fold distributions except P * - M45 . Among them , the O3 - M122 accounts for 56.0 % , 47.3 % and 31.0 % in Wa , Bai and Dai .
02 - M95 accounted for 15.0 % , 15.8 % and 39.9 % , respectively .
K * - 9 9 accounted for 24 . 0 % , 13.0 % and 5.7 % , respectively .
C - M130 accounted for 3.0 % , 10.2 % and 5.7 % , respectively . There were 72 species , 115 species and 140 haplotype in Wa , Bai and Dai , respectively .
There was no common haplotype among the three peoples : the haplotype diversity of Y - STR haplotype was 0.998 75 鹵 0.0046 , 0.9957 鹵 0.0015 and 0.9981 鹵 0.0010 , respectively .

The distribution of allele frequencies of 17 Y - STR loci in each Y - SNP haplotype was significantly different between 03 - M122 and 02 - M95 except DYS389 鈪，

本文編號(hào)：1842656