本文關(guān)鍵詞：法醫(yī)學(xué)常用15個(gè)STRs的檢測(cè)及其應(yīng)用于人群遺傳關(guān)系推斷的研究

  更多相關(guān)文章： 新疆 哈薩克族 法醫(yī)學(xué) 短串聯(lián)重復(fù)序列 民族推斷 群體遺傳學(xué)

【摘要】：背景和目的 短串聯(lián)重復(fù)序列一般是由兩個(gè)或多個(gè)核苷酸為核心序列的重復(fù)出現(xiàn)而組成的串聯(lián)結(jié)構(gòu),以重復(fù)區(qū)域?yàn)橹行牡钠伍L(zhǎng)度一般在400bp以內(nèi),重復(fù)單位為2～6bp,重復(fù)次數(shù)可達(dá)10-60次。由于不同STRs位點(diǎn)的核心序列不同,而同一STR位點(diǎn)在不同人中的重復(fù)次數(shù)不同,導(dǎo)致出現(xiàn)個(gè)體差異,構(gòu)成了長(zhǎng)度多態(tài)性,廣泛應(yīng)用于個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定。由于STRs具有分布廣、信息量大、高度多態(tài)性以及遵循孟德?tīng)柟诧@性遺傳等特點(diǎn),也成為推斷民族遺傳距離的有效工具。 哈薩克族是哈薩克斯坦的主要民族和中國(guó)的少數(shù)民族,人口1700萬(wàn)。在中國(guó)主要分布于新疆維吾爾自治區(qū)伊犁哈薩克自治州、木壘哈薩克自治縣、巴里坤哈薩克自治縣、甘肅省阿克塞哈薩克族自治縣。該民族使用文字是以阿拉伯字母為基礎(chǔ)的哈薩克語(yǔ),按語(yǔ)言系屬分類,屬于突厥語(yǔ)族人種。按血統(tǒng)分類,屬于蒙古人種北亞類型和歐羅巴人種及印度地中海類型之間的混合類型,屬于混血民族。 由于部分哈薩克人仍以游牧生活為主,無(wú)固定居住區(qū)域,且地理位置較為偏僻,交通不便,經(jīng)濟(jì)發(fā)展欠發(fā)達(dá)等多重原因,我國(guó)哈薩克族人群的15個(gè)基因座數(shù)據(jù)資料至2011年10月一直未見(jiàn)報(bào)道。因?qū)熃M有機(jī)會(huì)從新疆合作單位取得新疆哈薩克族血樣,特對(duì)這些血樣進(jìn)行法醫(yī)學(xué)常用STR基因座的檢測(cè)。 然后,本研究通過(guò)公用數(shù)據(jù)庫(kù)或同行評(píng)議期刊等網(wǎng)絡(luò)資料庫(kù),收集了中國(guó)各個(gè)省份、其它各個(gè)民族的STR基因座頻率數(shù)據(jù)。通過(guò)對(duì)40個(gè)不同民族群體間遺傳距離的計(jì)算,構(gòu)建了多個(gè)民族間的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),以探討其遺傳關(guān)系。 方法 使用酚-氯仿法對(duì)100例新疆哈薩克族外周血樣進(jìn)行DNA提取,使用Identifiler試劑盒進(jìn)行熒光標(biāo)記PCR擴(kuò)增,而后使用3130DNA測(cè)序儀對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳,最后完成對(duì)新疆哈薩克族100例健康無(wú)親緣性個(gè)體的15個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性的研究。 通過(guò)公用數(shù)據(jù)庫(kù)或同行評(píng)議期刊等資料庫(kù)收集中國(guó)各個(gè)省份、各個(gè)民族其它群體的STR基因座頻率數(shù)據(jù)；將獲得的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)與新疆哈薩克族的遺傳數(shù)據(jù),篩選匯總后計(jì)算出9個(gè)法醫(yī)學(xué)常用STR位點(diǎn)(D13S317.D18S51.D21S11.D3S1358. D5S818.D7S820.D8S1179.FGA.vWA)在中國(guó)40個(gè)民族中的基因頻率,以phyl ip3.69統(tǒng)計(jì)軟件包計(jì)算遺傳距離,并通過(guò)Neighbor－joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),研究各民族間的遺傳關(guān)系。 結(jié)果 對(duì)100例新疆哈薩克族的15個(gè)STR基因座進(jìn)行檢測(cè)分別檢出了10、15、8、10、6、6、7、6、12、11、8、6、12、7、10個(gè)等位基因,其基因頻率分布范圍分別在0.01-0.25,0.005-0.275,0.01-0.225,0.015-0.33,0.01-0.335,0.01-0.285,0.015-0.24,0.025-0.265,0.015-0.205,0.015-0.29,0.02-0.26,0.01-0.595,0.005-0.255,0.025-0.365以及0.005-0.205之間. 比較所有40個(gè)族群的9個(gè)STRs基因座基因頻率數(shù)據(jù)計(jì)算出了遺傳距離,并根據(jù)遺傳距離采用Neighbor-joining法構(gòu)建了40個(gè)族群之間的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)。在樹(shù)狀圖上,可以看出在系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)的下半部分,新疆維吾爾族先與內(nèi)蒙古蒙古族首先聚合,然后再與新疆哈薩克族、內(nèi)蒙古達(dá)斡爾族、天津漢族,青�；刈宸謩e聚合,繼而與青海藏族、西藏藏族、西藏珞巴族,浙江畬族的亞類相聚合,再與陜西漢族、云南白族,天津朝鮮族、湖南土家族、山東漢族、江蘇漢族相聚合。然后與河北漢族、內(nèi)蒙古漢族、河南漢族,遼寧漢族形成的漢族亞類相聚合,構(gòu)成了整個(gè)北方人群。系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)上半部分,廣西毛南族和廣西京族首先聚合,繼而與廣西苗族、廣西仫佬族聚合,與廣西瑤族和海南黎族聚合的亞類聚合。接下來(lái)與廣西瑤族、海南漢族相聚合。廣西侗族、廣西壯族。廣西漢族、廣東漢族的亞類與之相聚合后,又與四川漢族、福建漢族以及湖北漢族以及重慶土家族聚合,構(gòu)成南方人群。而安徽漢族、浙江漢族,構(gòu)成了南方漢族和北方漢族之間的過(guò)渡人群。 結(jié)論 通過(guò)對(duì)100例新疆哈薩克民族人群血樣15個(gè)STR基因座數(shù)據(jù)資料的檢測(cè),可以為法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別、親權(quán)鑒定、DNA數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)等法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供基礎(chǔ)資料,同時(shí)也為研究該民族基因特異性,分析人類進(jìn)化、民族起源、族群之間的親緣關(guān)系以及由于民族基因缺陷而特有的疾病譜提供了重要依據(jù)。 中國(guó)南北人群之間存在遺傳差異,漢族和少數(shù)民族之間存在遺傳差異
【關(guān)鍵詞】：新疆 哈薩克族 法醫(yī)學(xué) 短串聯(lián)重復(fù)序列 民族推斷 群體遺傳學(xué)
【學(xué)位授予單位】：鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號(hào)】：D919
【目錄】：

• 中文摘要4-7
• Abstract7-12
• 第一部分12-31
• 前言12-13
• 材料和方法13-19
• 結(jié)果19-26
• 討論26-28
• 結(jié)論28-29
• 參考文獻(xiàn)29-31
• 第二部分31-49
• 前言31-32
• 材料和方法32-37
• 結(jié)果37-39
• 討論39-44
• 結(jié)論44-45
• 參考文獻(xiàn)45-49
• 綜述49-58
• 參考文獻(xiàn)56-58
• 網(wǎng)絡(luò)資源58-59
• 中英文縮略詞索引59-60
• 附錄 試劑配方60-61
• 在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文61-62
• 致謝62-63
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷63

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1098849